seq1 = pF1KB5162.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB5162/gi568815581r_75220371.tfa (gi568815581r:75220371_75493628), 273258 bp

>pF1KB5162 651
>gi568815581r:75220371_75493628 (Chr17)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-176  (160832-160929)   100% ->
177-299  (167609-167731)   100% ->
300-468  (171802-171970)   100% ->
469-651  (173076-173258)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCCATCGCCAAATATGACTTCAAAGCTACTGCAGACGACGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCCATCGCCAAATATGACTTCAAAGCTACTGCAGACGACGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTTCAAAAGGGGGGACATCCTCAAG         GTTTTGAACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GAGCTTCAAAAGGGGGGACATCCTCAAGGTA...CAGGTTTTGAACGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATGTGATCAGAACTGGTACAAGGCAGAGCTTAATGGAAAAGACGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160845 AATGTGATCAGAACTGGTACAAGGCAGAGCTTAATGGAAAAGACGGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTCCCAAGAACTACATAGAAATGAAACCACATCC         GTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 160895 ATTCCCAAGAACTACATAGAAATGAAACCACATCCGTA...TAGGTGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTTGGCAAAATCCCCAGAGCCAAGGCAGAAGAAATGCTTAGCAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167615 TTTTGGCAAAATCCCCAGAGCCAAGGCAGAAGAAATGCTTAGCAAACAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCACGATGGGGCCTTTCTTATCCGAGAGAGTGAGAGCGCTCCTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167665 GGCACGATGGGGCCTTTCTTATCCGAGAGAGTGAGAGCGCTCCTGGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCTCCCTCTCTGTCAA         GTTTGGAAACGATGTGCAGCACTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 167715 TTCTCCCTCTCTGTCAAGTA...CAGGTTTGGAAACGATGTGCAGCACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGGTGCTCCGAGATGGAGCCGGGAAGTACTTCCTCTGGGTGGTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171826 CAAGGTGCTCCGAGATGGAGCCGGGAAGTACTTCCTCTGGGTGGTGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAATTCTTTGAATGAGCTGGTGGATTATCACAGATCTACATCTGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171876 TCAATTCTTTGAATGAGCTGGTGGATTATCACAGATCTACATCTGTCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGAAACCAGCAGATATTCCTGCGGGACATAGAACAGGTGCCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 171926 AGAAACCAGCAGATATTCCTGCGGGACATAGAACAGGTGCCACAGGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     CAGCCGACATACGTCCAGGCCCTCTTTGACTTTGATCCCCAGGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171976 .CAGCAGCCGACATACGTCCAGGCCCTCTTTGACTTTGATCCCCAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGGAGAGCTGGGCTTCCGCCGGGGAGATTTTATCCATGTCATGGATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173122 ATGGAGAGCTGGGCTTCCGCCGGGGAGATTTTATCCATGTCATGGATAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCAGACCCCAACTGGTGGAAAGGAGCTTGCCACGGGCAGACCGGCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173172 TCAGACCCCAACTGGTGGAAAGGAGCTTGCCACGGGCAGACCGGCATGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .
    615 TCCCCGCAATTATGTCACCCCCGTGAACCGGAACGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173222 TCCCCGCAATTATGTCACCCCCGTGAACCGGAACGTC