seq1 = pF1KB5159.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KB5159/gi568815596f_20347466.tfa (gi568815596f:20347466_20548053), 200588 bp

>pF1KB5159 588
>gi568815596f:20347466_20548053 (Chr2)

1-588  (100001-100588)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCATCCGCAAGAAGCTGGTGGTGGTGGGCGACGGCGCGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCATCCGCAAGAAGCTGGTGGTGGTGGGCGACGGCGCGTGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGACGTGCCTGCTGATCGTGTTCAGTAAGGACGAGTTCCCCGAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGACGTGCCTGCTGATCGTGTTCAGTAAGGACGAGTTCCCCGAGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTGCCCACCGTCTTCGAGAACTATGTGGCCGACATTGAGGTGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTGCCCACCGTCTTCGAGAACTATGTGGCCGACATTGAGGTGGACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCAGGTGGAGCTGGCGCTGTGGGACACGGCGGGCCAGGAGGACTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCAGGTGGAGCTGGCGCTGTGGGACACGGCGGGCCAGGAGGACTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCCTGCGGCCGCTCTCCTACCCGGACACCGACGTCATTCTCATGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCCTGCGGCCGCTCTCCTACCCGGACACCGACGTCATTCTCATGTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCGGTGGACAGCCCGGACTCGCTGGAGAACATCCCCGAGAAGTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCGGTGGACAGCCCGGACTCGCTGGAGAACATCCCCGAGAAGTGGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCGAGGTGAAGCACTTCTGTCCCAATGTGCCCATCATCCTGGTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGAGGTGAAGCACTTCTGTCCCAATGTGCCCATCATCCTGGTGGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAAAAAGACCTGCGCAGCGACGAGCATGTCCGCACAGAGCTGGCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAAAAAGACCTGCGCAGCGACGAGCATGTCCGCACAGAGCTGGCCCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAAGCAGGAACCCGTGCGCACGGATGACGGCCGCGCCATGGCCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAAGCAGGAACCCGTGCGCACGGATGACGGCCGCGCCATGGCCGTGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCAAGCCTACGACTACCTCGAGTGCTCTGCCAAGACCAAGGAAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCAAGCCTACGACTACCTCGAGTGCTCTGCCAAGACCAAGGAAGGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGCGAGGTCTTCGAGACGGCCACGCGCGCCGCGCTGCAGAAGCGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGCGAGGTCTTCGAGACGGCCACGCGCGCCGCGCTGCAGAAGCGCTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .
    551 GCTCCCAGAACGGCTGCATCAACTGCTGCAAGGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCCCAGAACGGCTGCATCAACTGCTGCAAGGTGCTA