seq1 = pF1KB5152.tfa, 1962 bp
seq2 = pF1KB5152/gi568815579r_1511710.tfa (gi568815579r:1511710_1750248), 238539 bp

>pF1KB5152 1962
>gi568815579r:1511710_1750248 (Chr19)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-145  (103822-103894)   100% ->
146-219  (117844-117917)   100% ->
220-298  (118133-118211)   100% ->
299-366  (122823-122890)   100% ->
367-499  (124541-124673)   100% ->
500-549  (126249-126298)   100% ->
550-652  (127834-127936)   100% ->
653-822  (128026-128195)   100% ->
823-955  (128279-128411)   100% ->
956-1014  (129058-129116)   100% ->
1015-1093  (129203-129281)   100% ->
1094-1167  (130396-130469)   100% ->
1168-1326  (130775-130933)   98% ->
1327-1450  (131015-131138)   100% ->
1451-1586  (134428-134563)   100% ->
1587-1822  (134729-134964)   100% ->
1823-1962  (138400-138539)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCAGCCGCAGAGGATGGCGCCTGTGGGCACAGACAAGGAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCAGCCGCAGAGGATGGCGCCTGTGGGCACAGACAAGGAGCTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCTCCTGGACTTCAGCATG         ATGTTCCCGCTGCCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 TGACCTCCTGGACTTCAGCATGGTG...CAGATGTTCCCGCTGCCTGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAACGGGAAGGGCCGGCCCGCCTCCCTGGCCGGGGCGCAGTTCGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103841 CCAACGGGAAGGGCCGGCCCGCCTCCCTGGCCGGGGCGCAGTTCGGAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAG         GTCTTGAGGACCGGCCCAGCTCAGGCTCCTGGGGCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103891 TCAGGTA...CAGGTCTTGAGGACCGGCCCAGCTCAGGCTCCTGGGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGGCGACCAGAGCAGCTCCTCCTTTGACCCCAGCCGG         ACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 117881 CGGCGACCAGAGCAGCTCCTCCTTTGACCCCAGCCGGGTA...TAGACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAGCGAGGGCACCCACTTCACTGAGTCGCACAGCAGCCTCTCTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118137 TCAGCGAGGGCACCCACTTCACTGAGTCGCACAGCAGCCTCTCTTCATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACATTCCTGGGACCGGGACTCGGAG         GCAAGAGCGGTGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 118187 ACATTCCTGGGACCGGGACTCGGAGGTG...CAGGCAAGAGCGGTGAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGGCGCCTATGCCTCCTTCGGGAGAGACGCAGGCGTGGGCGGCCTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122839 GGGCGCCTATGCCTCCTTCGGGAGAGACGCAGGCGTGGGCGGCCTGACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AG         GCTGGCTTCCTGTCAGGCGAGCTGGCCCTCAACAGCCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122889 AGGTG...CAGGCTGGCTTCCTGTCAGGCGAGCTGGCCCTCAACAGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GGGCCCCTGTCCCCTTCGGGCATGAAGGGGACCTCCCAGTACTACCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124580 GGGCCCCTGTCCCCTTCGGGCATGAAGGGGACCTCCCAGTACTACCCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTACTCCGGCAGCTCCCGGCGGAGAGCGGCAGACGGCAGCCTAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124630 CTACTCCGGCAGCTCCCGGCGGAGAGCGGCAGACGGCAGCCTAGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500    ACACGCAGCCCAAGAAGGTCCGGAAGGTCCCGCCGGGTCTTCCATCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126246 CAGACACGCAGCCCAAGAAGGTCCGGAAGGTCCCGCCGGGTCTTCCATCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TCG         GTGTACCCACCCAGCTCAGGTGAGGACTACGGCAGGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126296 TCGGTG...CAGGTGTACCCACCCAGCTCAGGTGAGGACTACGGCAGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TGCCACCGCCTACCCGTCCGCCAAGACCCCCAGCAGCACCTATCCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127872 TGCCACCGCCTACCCGTCCGCCAAGACCCCCAGCAGCACCTATCCCGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CCTTCTACGTGGCAG         ATGGCAGCCTGCACCCCTCAGCCGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 127922 CCTTCTACGTGGCAGGTA...CAGATGGCAGCCTGCACCCCTCAGCCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CTCTGGAGTCCCCCGGGCCAGGCGGGCTTCGGGCCCATGCTGGGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128052 CTCTGGAGTCCCCCGGGCCAGGCGGGCTTCGGGCCCATGCTGGGTGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CTCATCCCCGCTGCCCCTCCCGCCCGGTAGCGGCCCGGTGGGCAGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128102 CTCATCCCCGCTGCCCCTCCCGCCCGGTAGCGGCCCGGTGGGCAGCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GAAGCAGCAGCACGTTTGGTGGCCTGCACCAGCACGAGCGTATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128152 GAAGCAGCAGCACGTTTGGTGGCCTGCACCAGCACGAGCGTATGGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    823    GGCTACCAGCTGCATGGAGCAGAGGTGAACGGTGGGCTCCCATCTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128276 CAGGGCTACCAGCTGCATGGAGCAGAGGTGAACGGTGGGCTCCCATCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 ATCCTCCTTCTCCTCAGCCCCCGGAGCCACGTACGGCGGCGTCTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128326 ATCCTCCTTCTCCTCAGCCCCCGGAGCCACGTACGGCGGCGTCTCCAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACACGCCGCCTGTCAGCGGGGCCGACAGCCTCCTGG         GCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 128376 ACACGCCGCCTGTCAGCGGGGCCGACAGCCTCCTGGGTA...CAGGCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 CGAGGGACCACAGCTGGCAGCTCCGGGGATGCCCTCGGCAAAGCACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129063 CGAGGGACCACAGCTGGCAGCTCCGGGGATGCCCTCGGCAAAGCACTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CTCG         ATCTACTCCCCGGATCACTCAAGCAATAACTTCTCGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129113 CTCGGTG...CAGATCTACTCCCCGGATCACTCAAGCAATAACTTCTCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CCAGCCCTTCTACCCCCGTGGGCTCCCCCCAGGGCCTGGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 129240 CCAGCCCTTCTACCCCCGTGGGCTCCCCCCAGGGCCTGGCAGGTC...CA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1094  GAACGTCACAGTGGCCTCGAGCAGGAGCCCCCGGTGCCTTATCGCCCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130395 GGAACGTCACAGTGGCCTCGAGCAGGAGCCCCCGGTGCCTTATCGCCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CTACGACGGGGGTCTCCACGGCCTG         CAGAGTAAGATAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 130445 CTACGACGGGGGTCTCCACGGCCTGGTG...CAGCAGAGTAAGATAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ACCACCTGGACGAGGCCATCCACGTGCTCCGCAGCCACGCCGTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130791 ACCACCTGGACGAGGCCATCCACGTGCTCCGCAGCCACGCCGTGGGCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GCCGGCGACATGCACACGCTGCTGCCTGGCCACGGGGCGCTGGCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130841 GCCGGCGACATGCACACGCTGCTGCCTGGCCACGGGGCGCTGGCCTCAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TTTCACCGGCCCCATGTCGCTGGGTGGGCGGCACGCAGGCCTG       
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||>>>...>
 130891 TTTCACCGGCCCCATGTCACTGGGCGGGCGGCACGCAGGCCTGGTG...C

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1327   GTTGGAGGCAGCCACCCCGAGGACGGCCTCGCAGGCAGCACCAGCCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131013 AGGTTGGAGGCAGCCACCCCGAGGACGGCCTCGCAGGCAGCACCAGCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 ATGCACAACCACGCGGCCCTCCCCAGCCAGCCAGGCACCCTCCCTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131063 ATGCACAACCACGCGGCCCTCCCCAGCCAGCCAGGCACCCTCCCTGACCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GTCTCGGCCTCCCGACTCCTACAGTG         GGCTAGGGCGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 131113 GTCTCGGCCTCCCGACTCCTACAGTGGTA...CAGGGCTAGGGCGAGCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 GTGCCACGGCGGCCGCCAGCGAGATCAAGCGGGAGGAGAAGGAGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134443 GTGCCACGGCGGCCGCCAGCGAGATCAAGCGGGAGGAGAAGGAGGACGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GAGAACACGTCAGCGGCTGACCACTCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134493 GAGAACACGTCAGCGGCTGACCACTCGGAGGAGGAGAAGAAGGAGCTGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GGCCCCCCGGGCCCGGACCAG         CCCAGACGAGGACGAGGACG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134543 GGCCCCCCGGGCCCGGACCAGGTG...TAGCCCAGACGAGGACGAGGACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 ACCTTCTCCCCCCAGAGCAGAAGGCCGAGCGGGAGAAGGAGCGCCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134749 ACCTTCTCCCCCCAGAGCAGAAGGCCGAGCGGGAGAAGGAGCGCCGGGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCCAATAACGCCCGGGAGCGGCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134799 GCCAATAACGCCCGGGAGCGGCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 TAAGGAGCTGGGGCGCATGTGCCAACTGCACCTCAACAGCGAGAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134849 TAAGGAGCTGGGGCGCATGTGCCAACTGCACCTCAACAGCGAGAAGCCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGACCAAACTGCTCATCCTGCACCAGGCTGTCTCGGTCATCCTGAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134899 AGACCAAACTGCTCATCCTGCACCAGGCTGTCTCGGTCATCCTGAACTTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GAGCAGCAAGTGCGAG         AGCGGAACCTGAATCCCAAAGCAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 134949 GAGCAGCAAGTGCGAGGTC...CAGAGCGGAACCTGAATCCCAAAGCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 CTGTTTGAAACGGCGAGAAGAGGAAAAGGTGTCAGGTGTGGTTGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138425 CTGTTTGAAACGGCGAGAAGAGGAAAAGGTGTCAGGTGTGGTTGGAGACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 CCCAGATGGTGCTTTCAGCTCCCCACCCAGGCCTGAGCGAAGCCCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138475 CCCAGATGGTGCTTTCAGCTCCCCACCCAGGCCTGAGCGAAGCCCACAAC

   2100     .    :    .
   1948 CCCGCCGGGCACATG
        |||||||||||||||
 138525 CCCGCCGGGCACATG