seq1 = pF1KB5108.tfa, 2385 bp
seq2 = pF1KB5108/gi568815589r_26805514.tfa (gi568815589r:26805514_27047045), 241532 bp

>pF1KB5108 2385
>gi568815589r:26805514_27047045 (Chr9)

(complement)

1-149  (100001-100149)   100% ->
150-343  (111840-112033)   100% ->
344-444  (118638-118738)   100% ->
445-565  (118826-118946)   100% ->
566-733  (120486-120653)   100% ->
734-869  (121086-121221)   100% ->
870-1039  (123699-123868)   100% ->
1040-1197  (126662-126819)   100% ->
1198-1417  (127517-127736)   100% ->
1418-1486  (129881-129949)   100% ->
1487-1555  (133099-133167)   100% ->
1556-1657  (136607-136708)   100% ->
1658-1822  (139048-139212)   100% ->
1823-2385  (140970-141532)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGAGCGGCGCAACCAGGTACCGGCTGAGCTGCTCGCTCCGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGAGCGGCGCAACCAGGTACCGGCTGAGCTGCTCGCTCCGGGGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCTGGACGTACGGGGCCTGGTGTGCTGCGCCTATCCGCCGGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCTGGACGTACGGGGCCTGGTGTGCTGCGCCTATCCGCCGGGAGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGTGTCCGTGTCCCGAGACCGCACCACCCGCCTCTGGGCCCCAGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100101 TTGTGTCCGTGTCCCGAGACCGCACCACCCGCCTCTGGGCCCCAGACAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150         TCCAAACAGGAGCTTTACAGAAATGCACTGTATGAGTGGCCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TG...CAGTCCAAACAGGAGCTTTACAGAAATGCACTGTATGAGTGGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCCAATTTTGTATCTTGTGTATGCATCATACCCTCAAGTGACATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111882 TTCCAATTTTGTATCTTGTGTATGCATCATACCCTCAAGTGACATCTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCATGGCCTAATTGCCACCGGTGGAAATGACCACAATATATGCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111932 CTCATGGCCTAATTGCCACCGGTGGAAATGACCACAATATATGCATTTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCACTGGACAGTCCAATGCCACTTTATATTCTAAAAGGCCACAAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111982 TCACTGGACAGTCCAATGCCACTTTATATTCTAAAAGGCCACAAAAATAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TG         TTTGTAGTCTATCATCTGGAAAATTTGGGACATTACTTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112032 TGGTG...TAGTTTGTAGTCTATCATCTGGAAAATTTGGGACATTACTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGGTTCATGGGACACCACTGCTAAAGTCTGGCTGAATGACAAGTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118677 GTGGTTCATGGGACACCACTGCTAAAGTCTGGCTGAATGACAAGTGCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGACCTTGCAG         GGTCATACAGCTGCAGTGTGGGCGGTAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 118727 ATGACCTTGCAGGTA...CAGGGTCATACAGCTGCAGTGTGGGCGGTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATCTTACCTGAACAGGGCTTAATGTTGACTGGATCAGCAGACAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118855 GATCTTACCTGAACAGGGCTTAATGTTGACTGGATCAGCAGACAAGACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTAAACTGTGGAAGGCTGGAAGATGTGAGAGGACTTTTTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118905 TTAAACTGTGGAAGGCTGGAAGATGTGAGAGGACTTTTTCAGGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566  GGCATGAAGACTGTGTAAGAGGTTTGGCAATTTTGAGTGAAACAGAATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120485 GGGCATGAAGACTGTGTAAGAGGTTTGGCAATTTTGAGTGAAACAGAATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCTTTCCTGTGCAAATGATGCTAGTATTAGAAGGTGGCAAATCACTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120535 TCTTTCCTGTGCAAATGATGCTAGTATTAGAAGGTGGCAAATCACTGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGTGTCTTGAAGTATATTATGGACATACAAATTATATTTATAGCATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120585 AGTGTCTTGAAGTATATTATGGACATACAAATTATATTTATAGCATATCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTTTTCCAAATTGTAGAG         ACTTTGTGACAACAGCAGAGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 120635 GTTTTTCCAAATTGTAGAGGTA...TAGACTTTGTGACAACAGCAGAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAGATCTCTGAGAATCTGGAAACATGGGGAATGTGCTCAAACTATCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121108 CAGATCTCTGAGAATCTGGAAACATGGGGAATGTGCTCAAACTATCCGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTCCAGCTCAGTCTATATGGTGCTGCTGTGTGCTCGACAATGGTGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121158 TTCCAGCTCAGTCTATATGGTGCTGCTGTGTGCTCGACAATGGTGACATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGGTTGGTGCGAG         TGATGGCATTATTAGAGTGTTTACAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121208 GTGGTTGGTGCGAGGTA...CAGTGATGGCATTATTAGAGTGTTTACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ATCAGAAGATCGAACAGCAAGTGCTGAAGAAATCAAGGCTTTTGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123726 ATCAGAAGATCGAACAGCAAGTGCTGAAGAAATCAAGGCTTTTGAAAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AACTGTCTCACGCAACCATTGATTCTAAAACTGGCGATTTAGGGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123776 AACTGTCTCACGCAACCATTGATTCTAAAACTGGCGATTTAGGGGACATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AATGCTGAGCAGCTTCCTGGGAGGGAACATCTTAATGAACCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 123826 AATGCTGAGCAGCTTCCTGGGAGGGAACATCTTAATGAACCTGGTA...A

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1040   GTACTAGAGAAGGACAGACTCGTCTAATCAGAGATGGGGAGAAAGTCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126660 AGGTACTAGAGAAGGACAGACTCGTCTAATCAGAGATGGGGAGAAAGTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAGCCTATCAGTGGAGTGTTAGTGAAGGGAGGTGGATAAAAATTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126710 AAGCCTATCAGTGGAGTGTTAGTGAAGGGAGGTGGATAAAAATTGGTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTGTTGGCTCATCTGGTGCTAATCAGCAAACATCTGGAAAAGTTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126760 GTTGTTGGCTCATCTGGTGCTAATCAGCAAACATCTGGAAAAGTTTTATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGAAGGGAAA         GAATTTGATTATGTTTTCTCAATTGATGTCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126810 TGAAGGGAAAGTA...TAGGAATTTGATTATGTTTTCTCAATTGATGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGAAGGTGGACCATCATATAAATTGCCATATAATACCAGTGATGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127548 ATGAAGGTGGACCATCATATAAATTGCCATATAATACCAGTGATGACCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TGGTTAACTGCATACAACTTCTTACAGAAGAATGATTTGAATCCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127598 TGGTTAACTGCATACAACTTCTTACAGAAGAATGATTTGAATCCTATGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TCTGGATCAAGTAGCTAAATTTATTATTGATAACACAAAAGGTCAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127648 TCTGGATCAAGTAGCTAAATTTATTATTGATAACACAAAAGGTCAAATGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGGGACTTGGGAATCCCAGCTTTTCAGATCCATTTACAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 127698 TGGGACTTGGGAATCCCAGCTTTTCAGATCCATTTACAGGTA...CAGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGTGGTCGGTATGTTCCGGGCTCTTCGGGATCTTCTAACACACTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129883 GGTGGTCGGTATGTTCCGGGCTCTTCGGGATCTTCTAACACACTACCCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AGCAGATCCTTTTACAG         GTGCTGGTCGTTATGTACCAGGTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 129933 AGCAGATCCTTTTACAGGTG...TAGGTGCTGGTCGTTATGTACCAGGTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CTGCAAGTATGGGAACTACCATGGCCGGAGTTGATCCATTTACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 133123 CTGCAAGTATGGGAACTACCATGGCCGGAGTTGATCCATTTACAGGTA..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556     GGAATAGTGCCTACCGATCAGCTGCATCTAAAACAATGAATATTTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133173 .TAGGGAATAGTGCCTACCGATCAGCTGCATCTAAAACAATGAATATTTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTTCCCTAAAAAAGAGGCTGTCACATTTGACCAAGCAAACCCTACACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136653 TTTCCCTAAAAAAGAGGCTGTCACATTTGACCAAGCAAACCCTACACAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TATTAG         GTAAACTGAAGGAACTTAATGGAACTGCACCTGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136703 TATTAGGTA...TAGGTAAACTGAAGGAACTTAATGGAACTGCACCTGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAGAAGAAGTTAACTGAGGATGACTTGATACTTCTTGAGAAGATACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139083 GAGAAGAAGTTAACTGAGGATGACTTGATACTTCTTGAGAAGATACTGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TCTAATATGTAATAGTTCTTCAGAAAAACCCACAGTCCAGCAACTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139133 TCTAATATGTAATAGTTCTTCAGAAAAACCCACAGTCCAGCAACTTCAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TTTTGTGGAAAGCTATTAACTGTCCTGAAG         ATATTGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 139183 TTTTGTGGAAAGCTATTAACTGTCCTGAAGGTA...TAGATATTGTCTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCTGCACTTGACATTCTTCGGTTGTCAATTAAACACCCCAGTGTGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140981 CCTGCACTTGACATTCTTCGGTTGTCAATTAAACACCCCAGTGTGAATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAACTTCTGCAATGAAAAGGAAGGGGCTCAGTTCAGCAGTCATCTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141031 GAACTTCTGCAATGAAAAGGAAGGGGCTCAGTTCAGCAGTCATCTTATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ATCTTCTGAACCCTAAAGGAAAGCCAGCAAACCAGCTGCTTGCTCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141081 ATCTTCTGAACCCTAAAGGAAAGCCAGCAAACCAGCTGCTTGCTCTCAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ACTTTTTGCAATTGTTTTGTTGGCCAGGCAGGACAAAAACTCATGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141131 ACTTTTTGCAATTGTTTTGTTGGCCAGGCAGGACAAAAACTCATGATGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CCAGAGGGAATCACTGATGTCCCATGCAATAGAACTGAAATCAGGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141181 CCAGAGGGAATCACTGATGTCCCATGCAATAGAACTGAAATCAGGGAGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 ATAAGAACATTCACATTGCTCTGGCTACATTGGCCCTGAACTATTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141231 ATAAGAACATTCACATTGCTCTGGCTACATTGGCCCTGAACTATTCTGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 TGTTTTCATAAAGACCATAACATTGAAGGGAAAGCCCAATGTTTGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141281 TGTTTTCATAAAGACCATAACATTGAAGGGAAAGCCCAATGTTTGTCACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 AATTAGCACAATCTTGGAAGTAGTACAAGACCTAGAAGCCACTTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141331 AATTAGCACAATCTTGGAAGTAGTACAAGACCTAGAAGCCACTTTTAGAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TTCTTGTGGCTCTTGGAACACTTATCAGTGATGATTCAAATGCTGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141381 TTCTTGTGGCTCTTGGAACACTTATCAGTGATGATTCAAATGCTGTACAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 TTAGCCAAGTCTTTAGGTGTTGATTCTCAAATAAAAAAGTATTCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141431 TTAGCCAAGTCTTTAGGTGTTGATTCTCAAATAAAAAAGTATTCCTCAGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 ATCAGAACCAGCTAAAGTAAGTGAATGCTGTAGATTTATCCTAAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141481 ATCAGAACCAGCTAAAGTAAGTGAATGCTGTAGATTTATCCTAAATTTGC

   2500 
   2384 TG
        ||
 141531 TG