seq1 = pF1KB5093.tfa, 2853 bp
seq2 = pF1KB5093/gi568815587r_27267870.tfa (gi568815587r:27267870_27572302), 304433 bp

>pF1KB5093 2853
>gi568815587r:27267870_27572302 (Chr11)

(complement)

1-185  (100001-100185)   100% ->
186-257  (159443-159514)   100% ->
258-329  (179785-179856)   100% ->
330-401  (181138-181209)   100% ->
402-617  (186835-187050)   99% ->
618-689  (187896-187967)   100% ->
690-758  (190047-190115)   100% ->
759-830  (191337-191408)   100% ->
831-902  (191592-191663)   100% ->
903-971  (191964-192032)   100% ->
972-1043  (193535-193606)   100% ->
1044-1109  (195080-195145)   100% ->
1110-1181  (195933-196004)   100% ->
1182-1253  (198257-198328)   100% ->
1254-1379  (198627-198752)   100% ->
1380-1495  (199905-200020)   100% ->
1496-1579  (200605-200688)   100% ->
1580-2853  (203160-204433)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGGCCCGCTAGGGCTGCTCTGCTTCCTCGCCCTGGGGCTGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGGCCCGCTAGGGCTGCTCTGCTTCCTCGCCCTGGGGCTGCTCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGCCGGGCCCAGCGGCGCGGCGCCGCCTCTCTGCGCGGCGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGCCGGGCCCAGCGGCGCGGCGCCGCCTCTCTGCGCGGCGCCCTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGCGACGGCGACCGTCGGGTGGACTGCTCCGGGAAGGGGCTGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGCGACGGCGACCGTCGGGTGGACTGCTCCGGGAAGGGGCTGACGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCCCGAGGGGCTCAGCGCCTTCACCCAAGCGCT         GGATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100151 GTGCCCGAGGGGCTCAGCGCCTTCACCCAAGCGCTGTG...CAGGGATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGTATGAACAACATTACTCAGTTGCCAGAAGATGCATTTAAGAACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159449 CAGTATGAACAACATTACTCAGTTGCCAGAAGATGCATTTAAGAACTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTTTCTAGAAGAGCT         ACAATTGGCGGGCAACGACCTTTCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 159499 CTTTTCTAGAAGAGCTGTA...TAGACAATTGGCGGGCAACGACCTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTATCCACCCAAAGGCCTTGTCTGGGTTGAAAGAACTCAAAGTTCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 179810 TTTATCCACCCAAAGGCCTTGTCTGGGTTGAAAGAACTCAAAGTTCTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    330       AACGCTCCAGAATAATCAGTTGAAAACAGTACCCAGTGAAGCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179860 ...CAGAACGCTCCAGAATAATCAGTTGAAAACAGTACCCAGTGAAGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCGAGGGCTGAGTGCTTTGCAGTCTTT         GCGTTTAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 181182 TTCGAGGGCTGAGTGCTTTGCAGTCTTTGTA...TAGGCGTTTAGATGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AACCATATTACCTCAGTCCCCGAGGACAGTTTTGAAGGACTTGTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186848 AACCATATTACCTCAGTCCCCGAGGACAGTTTTGAAGGACTTGTTCAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACGGCATCTGTGGCTGGATGACAACAGCTTGACGGAGGTGCCTGTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186898 ACGGCATCTGTGGCTGGATGACAACAGCTTGACGGAGGTGCCTGTGCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCCTCAGCAATCTGCCCACCCTACAGGCGCTGACCCTGGCTCTCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186948 CCCTCAGCAATCTGCCCACCCTACAGGCGCTGACCCTGGCTCTCAACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCTCAAGTATCCCTGACTTTGCATTTACCAACCTTTCAAGCCTGGTAGT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186998 ATCTCAAGCATCCCTGACTTTGCATTTACCAACCTTTCAAGCCTGGTAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCT         GCATCTTCATAACAATAAAATTAGAAGCCTGAGTCAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187048 TCTGTA...TAGGCATCTTCATAACAATAAAATTAGAAGCCTGAGTCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACTGTTTTGATGGACTAGATAACCTGGAGACCTT         AGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 187934 ACTGTTTTGATGGACTAGATAACCTGGAGACCTTGTA...TAGAGACTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AATTATAATAACTTGGGGGAATTTCCTCAGGCTATTAAAGCCCTTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190054 AATTATAATAACTTGGGGGAATTTCCTCAGGCTATTAAAGCCCTTCCTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTTAAAGAGCT         AGGATTTCATAGTAATTCTATTTCTGTTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 190104 CCTTAAAGAGCTGTG...TAGAGGATTTCATAGTAATTCTATTTCTGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCCCTGATGGAGCATTTGATGGTAATCCACTCTTAAGAACTAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 191366 TCCCTGATGGAGCATTTGATGGTAATCCACTCTTAAGAACTATGTA...C

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    831   ACATTTGTATGATAATCCTCTGTCTTTTGTGGGGAACTCAGCATTTCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191590 AGACATTTGTATGATAATCCTCTGTCTTTTGTGGGGAACTCAGCATTTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAATTTATCTGATCTTCATTCCCT         AGTCATTCGTGGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 191640 CAATTTATCTGATCTTCATTCCCTGTA...AAGAGTCATTCGTGGTGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GCATGGTGCAGCAGTTCCCCAATCTTACAGGAACTGTCCACCTGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191981 GCATGGTGCAGCAGTTCCCCAATCTTACAGGAACTGTCCACCTGGAAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CT         GACTTTGACAGGTACAAAGATAAGCAGCATACCTAATAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192031 CTGTA...CAGGACTTTGACAGGTACAAAGATAAGCAGCATACCTAATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TTTGTGTCAAGAACAAAAGATGCTTAGGACTTT         GGACTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 193574 TTTGTGTCAAGAACAAAAGATGCTTAGGACTTTGTA...AAGGGACTTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CTTACAATAATATAAGAGACCTTCCAAGTTTTAATGGTTGCCATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195088 CTTACAATAATATAAGAGACCTTCCAAGTTTTAATGGTTGCCATGCTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GAAGAAAT         TTCTTTACAGCGTAATCAAATCTACCAAATAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 195138 GAAGAAATGTG...TAGTTCTTTACAGCGTAATCAAATCTACCAAATAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGAAGGCACCTTTCAAGGCCTGATATCTCTAAGGATTCT         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 195966 GGAAGGCACCTTTCAAGGCCTGATATCTCTAAGGATTCTGTA...CAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ATCTGAGTAGAAACCTGATACATGAAATTCACAGTAGAGCTTTTGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198259 ATCTGAGTAGAAACCTGATACATGAAATTCACAGTAGAGCTTTTGCCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 CTTGGGCCAATAACTAACCT         AGATGTAAGTTTCAATGAATT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 198309 CTTGGGCCAATAACTAACCTGTA...TAGAGATGTAAGTTTCAATGAATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 AACTTCCTTTCCTACGGAAGGCCTGAATGGGCTAAATCAACTGAAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198648 AACTTCCTTTCCTACGGAAGGCCTGAATGGGCTAAATCAACTGAAACTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TGGGCAACTTCAAGCTGAAAGAAGCCTTAGCAGCAAAAGACTTTGTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198698 TGGGCAACTTCAAGCTGAAAGAAGCCTTAGCAGCAAAAGACTTTGTTAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CTCAG         GTCTTTATCAGTACCATATGCTTATCAGTGCTGTGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198748 CTCAGGTG...CAGGTCTTTATCAGTACCATATGCTTATCAGTGCTGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 ATTTTGGGGTTGTGACTCTTATGCAAATTTAAACACAGAAGATAACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199941 ATTTTGGGGTTGTGACTCTTATGCAAATTTAAACACAGAAGATAACAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TCCAGGACCACAGTGTGGCACAGGAGAAAG         GTACTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 199991 TCCAGGACCACAGTGTGGCACAGGAGAAAGGCA...CAGGTACTGCTGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GCAGCAAATGTCACAAGCACTCTTGAAAATGAAGAACATAGTCAAATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200616 GCAGCAAATGTCACAAGCACTCTTGAAAATGAAGAACATAGTCAAATAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 TATCCATTGTACACCTTCAACAG         GTGCTTTTAAGCCCTGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 200666 TATCCATTGTACACCTTCAACAGGTA...TAGGTGCTTTTAAGCCCTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 AATATTTACTGGGAAGCTGGATGATTCGTCTTACTGTGTGGTTCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203178 AATATTTACTGGGAAGCTGGATGATTCGTCTTACTGTGTGGTTCATTTTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 TTGGTTGCATTATTTTTCAACCTGCTTGTTATTTTAACAACATTTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203228 TTGGTTGCATTATTTTTCAACCTGCTTGTTATTTTAACAACATTTGCATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 TTGTACATCACTGCCTTCGTCCAAATTGTTTATAGGCTTGATTTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203278 TTGTACATCACTGCCTTCGTCCAAATTGTTTATAGGCTTGATTTCTGTGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 CTAACTTATTCATGGGAATCTATACTGGCATCCTAACTTTTCTTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203328 CTAACTTATTCATGGGAATCTATACTGGCATCCTAACTTTTCTTGATGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 GTGTCCTGGGGCAGATTCGCTGAATTTGGCATTTGGTGGGAAACTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203378 GTGTCCTGGGGCAGATTCGCTGAATTTGGCATTTGGTGGGAAACTGGCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 TGGCTGCAAAGTAGCTGGGTTTCTTGCAGTTTTCTCCTCAGAAAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203428 TGGCTGCAAAGTAGCTGGGTTTCTTGCAGTTTTCTCCTCAGAAAGTGCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TATTTTTATTAATGCTAGCAACTGTCGAAAGAAGCTTATCTGCAAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203478 TATTTTTATTAATGCTAGCAACTGTCGAAAGAAGCTTATCTGCAAAAGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 ATAATGAAAAATGGGAAGAGCAATCATCTCAAACAGTTCCGGGTTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203528 ATAATGAAAAATGGGAAGAGCAATCATCTCAAACAGTTCCGGGTTGCTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CCTTTTGGCTTTCCTAGGTGCTACAGTAGCAGGCTGTTTTCCCCTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203578 CCTTTTGGCTTTCCTAGGTGCTACAGTAGCAGGCTGTTTTCCCCTTTTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 ATAGAGGGGAATATTCTGCATCACCCCTTTGTTTGCCATTTCCTACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203628 ATAGAGGGGAATATTCTGCATCACCCCTTTGTTTGCCATTTCCTACAGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAAACGCCATCATTAGGATTCACTGTAACGTTAGTGCTATTAAACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203678 GAAACGCCATCATTAGGATTCACTGTAACGTTAGTGCTATTAAACTCACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGCATTTTTATTAATGGCCGTTATCTACACTAAGCTATACTGCAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 203728 AGCATTTTTATTAATGGCCGTTATCTACACTAAACTATACTGCAACTTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 AAAAAGAGGACCTCTCAGAAAACTCACAATCTAGCATGATTAAGCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203778 AAAAAGAGGACCTCTCAGAAAACTCACAATCTAGCATGATTAAGCATGTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GCTTGGCTAATCTTCACCAATTGCATCTTTTTCTGCCCTGTGGCGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203828 GCTTGGCTAATCTTCACCAATTGCATCTTTTTCTGCCCTGTGGCGTTTTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 TTCATTTGCACCATTGATCACTGCAATCTCTATCAGCCCCGAAATAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203878 TTCATTTGCACCATTGATCACTGCAATCTCTATCAGCCCCGAAATAATGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AGTCTGTTACTCTGATATTTTTTCCATTGCCTGCTTGCCTGAATCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203928 AGTCTGTTACTCTGATATTTTTTCCATTGCCTGCTTGCCTGAATCCAGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CTGTATGTTTTCTTCAACCCAAAGTTTAAAGAAGACTGGAAGTTACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203978 CTGTATGTTTTCTTCAACCCAAAGTTTAAAGAAGACTGGAAGTTACTGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GCGACGTGTTACCAAGAAAAGTGGATCAGTTTCAGTTTCCATCAGTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204028 GCGACGTGTTACCAAGAAAAGTGGATCAGTTTCAGTTTCCATCAGTAGCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 AAGGTGGTTGTCTGGAACAGGATTTCTACTACGACTGTGGCATGTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204078 AAGGTGGTTGTCTGGAACAGGATTTCTACTACGACTGTGGCATGTACTCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 CATTTGCAGGGCAACCTGACTGTTTGCGACTGCTGCGAATCGTTTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204128 CATTTGCAGGGCAACCTGACTGTTTGCGACTGCTGCGAATCGTTTCTTTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AACAAAGCCAGTATCATGCAAACACTTGATAAAATCACACAGCTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204178 AACAAAGCCAGTATCATGCAAACACTTGATAAAATCACACAGCTGTCCTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CATTGGCAGTGGCTTCTTGCCAAAGACCTGAGGGCTACTGGTCCGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204228 CATTGGCAGTGGCTTCTTGCCAAAGACCTGAGGGCTACTGGTCCGACTGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GGCACACAGTCGGCCCACTCTGATTATGCAGATGAAGAAGATTCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204278 GGCACACAGTCGGCCCACTCTGATTATGCAGATGAAGAAGATTCCTTTGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 CTCAGACAGTTCTGACCAGGTGCAGGCCTGTGGACGAGCCTGCTTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204328 CTCAGACAGTTCTGACCAGGTGCAGGCCTGTGGACGAGCCTGCTTCTACC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 AGAGTAGAGGATTCCCTTTGGTGCGCTATGCTTACAATCTACCAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204378 AGAGTAGAGGATTCCCTTTGGTGCGCTATGCTTACAATCTACCAAGAGTT

   3000     .
   2848 AAAGAC
        ||||||
 204428 AAAGAC