seq1 = pF1KB5083.tfa, 2055 bp
seq2 = pF1KB5083/gi568815593r_58354586.tfa (gi568815593r:58354586_58559959), 205374 bp

>pF1KB5083 2055
>gi568815593r:58354586_58559959 (Chr5)

(complement)

1-270  (100001-100270)   99% ->
271-378  (100868-100975)   100% ->
379-495  (101119-101235)   100% ->
496-625  (101432-101561)   100% ->
626-713  (101789-101876)   100% ->
714-809  (102377-102472)   100% ->
810-1008  (102581-102779)   100% ->
1009-1156  (102868-103015)   100% ->
1157-1254  (103371-103468)   100% ->
1255-1384  (103805-103934)   100% ->
1385-1625  (104181-104421)   100% ->
1626-1755  (104546-104675)   100% ->
1756-1866  (104939-105049)   100% ->
1867-2055  (105186-105374)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTTTTGCGGACTATCACCTACCAGCCAGCCGCCAGCACCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTTTTGCGGACTATCACCTACCAGCCAGCCGCCAGCACCAAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCGAGCAGGCGCTGGGCAAGGGTTGCGGAGCAGACTCGAAGAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100051 GTGCGAGCAGGCGCTGGGCAAGGGTTGCGGAGCGGACTCGAAGAAGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCGCCGCAGCCCCCCGAGGAATCGCAGCCACCTCAGTCCCAGGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCGCCGCAGCCCCCCGAGGAATCGCAGCCACCTCAGTCCCAGGCGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCCCCCGGCGGCCCCTCACCACCATCACCACCATTCGCACTCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCCCCCGGCGGCCCCTCACCACCATCACCACCATTCGCACTCGGGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGATCTCGCGGATTATCGTCGACCCCACGACTGGGAAGCGCTACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGATCTCGCGGATTATCGTCGACCCCACGACTGGGAAGCGCTACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGGCAAAGTGCTGGGAAAG         GGTGGCTTTGCAAAATGTTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100251 GGGGCAAAGTGCTGGGAAAGGTG...CAGGGTGGCTTTGCAAAATGTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGATGACAGATTTGACAAATAACAAAGTCTACGCCGCAAAAATTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 GAGATGACAGATTTGACAAATAACAAAGTCTACGCCGCAAAAATTATTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCACAGCAGAGTAGCTAAACCTCATCAAAGGGAAAAG         ATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100939 TCACAGCAGAGTAGCTAAACCTCATCAAAGGGAAAAGGTG...TAGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAAGAAATAGAGCTTCACAGAATTCTTCATCATAAGCATGTAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101123 ACAAAGAAATAGAGCTTCACAGAATTCTTCATCATAAGCATGTAGTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTTACCACTACTTCGAGGACAAAGAAAACATTTACATTCTCTTGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101173 TTTTACCACTACTTCGAGGACAAAGAAAACATTTACATTCTCTTGGAATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGCAGTAGAAGG         TCAATGGCTCATATTTTGAAAGCAAGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101223 CTGCAGTAGAAGGGTA...TAGTCAATGGCTCATATTTTGAAAGCAAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGTGTTGACAGAGCCAGAAGTTCGATACTACCTCAGGCAGATTGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101460 AGGTGTTGACAGAGCCAGAAGTTCGATACTACCTCAGGCAGATTGTGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGACTGAAATACCTTCATGAACAAGAAATCTTGCACAGAGATCTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101510 GGACTGAAATACCTTCATGAACAAGAAATCTTGCACAGAGATCTCAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AG         GGAACTTTTTTATTAATGAAGCCATGGAACTAAAAGTTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 AGGTA...TAGGGAACTTTTTTATTAATGAAGCCATGGAACTAAAAGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGGACTTCGGTCTGGCAGCCAGGCTAGAACCCTTGGAACACAGAAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101828 GGGACTTCGGTCTGGCAGCCAGGCTAGAACCCTTGGAACACAGAAGGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    714         AACGATATGTGGTACCCCAAATTATCTCTCTCCTGAAGTCCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101878 TA...CAGAACGATATGTGGTACCCCAAATTATCTCTCTCCTGAAGTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAACAAACAAGGACATGGCTGTGAATCAGACATTTGGGCCCTGGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102419 CAACAAACAAGGACATGGCTGTGAATCAGACATTTGGGCCCTGGGCTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAAT         GTATACAATGTTACTAGGGAGGCCCCCATTTGAAACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102469 TAATGTA...CAGGTATACAATGTTACTAGGGAGGCCCCCATTTGAAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACAAATCTCAAAGAAACTTATAGGTGCATAAGGGAAGCAAGGTATACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102618 ACAAATCTCAAAGAAACTTATAGGTGCATAAGGGAAGCAAGGTATACAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCGTCCTCATTGCTGGCTCCTGCCAAGCACTTAATTGCTAGTATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102668 GCCGTCCTCATTGCTGGCTCCTGCCAAGCACTTAATTGCTAGTATGTTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCAAAAACCCAGAGGATCGTCCCAGTTTGGATGACATCATTCGACATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102718 CCAAAAACCCAGAGGATCGTCCCAGTTTGGATGACATCATTCGACATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTTTTTTGCAG         GGCTTCACTCCGGACAGACTGTCTTCTAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102768 TTTTTTTTGCAGGTT...CAGGGCTTCACTCCGGACAGACTGTCTTCTAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTGTTGTCATACAGTTCCAGATTTCCACTTATCAAGCCCAGCTAAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102897 CTGTTGTCATACAGTTCCAGATTTCCACTTATCAAGCCCAGCTAAGAATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCTTTAAGAAAGCAGCTGCTGCTCTTTTTGGTGGCAAAAAAGACAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102947 TCTTTAAGAAAGCAGCTGCTGCTCTTTTTGGTGGCAAAAAAGACAAAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGATATATTGACACACATA         ATAGAGTGTCTAAAGAAGATGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102997 AGATATATTGACACACATAGTA...CAGATAGAGTGTCTAAAGAAGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGACATCTACAAGCTTAGGCATGATTTGAAAAAGACTTCAATAACTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103393 AGACATCTACAAGCTTAGGCATGATTTGAAAAAGACTTCAATAACTCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AACCCAGCAAACACAGGACAGATGAG         GAGCTCCAGCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103443 AACCCAGCAAACACAGGACAGATGAGGTG...AAGGAGCTCCAGCCACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACCACCACAGTTGCCAGGTCTGGAACACCCGCAGTAGAAAACAAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103820 ACCACCACAGTTGCCAGGTCTGGAACACCCGCAGTAGAAAACAAGCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GATTGGGGATGCTATTCGGATGATAGTCAGAGGGACTCTTGGCAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 GATTGGGGATGCTATTCGGATGATAGTCAGAGGGACTCTTGGCAGCTGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCAGCAGCAGTGAAT         GCCTTGAAGACAGTACCATGGGAAGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103920 GCAGCAGCAGTGAATGTA...CAGGCCTTGAAGACAGTACCATGGGAAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTTGCAGACACAGTGGCAAGGGTTCTTCGGGGATGTCTGGAAAACATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104207 GTTGCAGACACAGTGGCAAGGGTTCTTCGGGGATGTCTGGAAAACATGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGAAGCTGATTGCATTCCCAAAGAGCAGCTGAGCACATCATTTCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104257 GGAAGCTGATTGCATTCCCAAAGAGCAGCTGAGCACATCATTTCAGTGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCACCAAATGGGTTGATTACTCTAACAAATATGGCTTTGGGTACCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104307 TCACCAAATGGGTTGATTACTCTAACAAATATGGCTTTGGGTACCAGCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TCAGACCACACCGTCGGTGTCCTTTTCAACAATGGTGCTCACATGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104357 TCAGACCACACCGTCGGTGTCCTTTTCAACAATGGTGCTCACATGAGCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCTTCCAGACAAAAA         AACAGTTCACTATTACGCAGAGCTTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104407 CCTTCCAGACAAAAAGTA...TAGAACAGTTCACTATTACGCAGAGCTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GCCAATGCTCAGTTTTCCCAGCAACAGATGCTCCTGAGCAATTTATTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104572 GCCAATGCTCAGTTTTCCCAGCAACAGATGCTCCTGAGCAATTTATTAGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CAAGTGACGGTGCTGAAATACTTTTCTCATTACATGGAGGAGAACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104622 CAAGTGACGGTGCTGAAATACTTTTCTCATTACATGGAGGAGAACCTCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGAT         GGTGGAGATCTGCCTAGTGTTACTGATATTCGAAGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104672 GGATGTA...CAGGGTGGAGATCTGCCTAGTGTTACTGATATTCGAAGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTCGGCTCTACCTCCTTCAGTGGCTAAAATCTGATAAGGCCCTAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104976 CTCGGCTCTACCTCCTTCAGTGGCTAAAATCTGATAAGGCCCTAATGATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CTCTTTAATGATGGCACCTTTCAG         GTGAATTTCTACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105026 CTCTTTAATGATGGCACCTTTCAGGTA...AAGGTGAATTTCTACCATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TCATACAAAAATCATCATCTGTAGCCAAAATGAAGAATACCTTCTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105203 TCATACAAAAATCATCATCTGTAGCCAAAATGAAGAATACCTTCTCACCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ACATCAATGAGGATAGGATATCTACAACTTTCAGGCTGACAACTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105253 ACATCAATGAGGATAGGATATCTACAACTTTCAGGCTGACAACTCTGCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ATGTCTGGCTGTTCATCAGAATTAAAAAATCGAATGGAATATGCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105303 ATGTCTGGCTGTTCATCAGAATTAAAAAATCGAATGGAATATGCCCTGAA

   2150     .    :    .    :
   2034 CATGCTCTTACAAAGATGTAAC
        ||||||||||||||||||||||
 105353 CATGCTCTTACAAAGATGTAAC