seq1 = pF1KB5068.tfa, 1641 bp
seq2 = pF1KB5068/gi568815591r_44466005.tfa (gi568815591r:44466005_44673895), 207891 bp

>pF1KB5068 1641
>gi568815591r:44466005_44673895 (Chr7)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-222  (100152-100313)   100% ->
223-383  (100846-101006)   100% ->
384-554  (101152-101322)   100% ->
555-645  (101459-101549)   100% ->
646-890  (102160-102404)   100% ->
891-1010  (103019-103138)   100% ->
1011-1124  (103768-103881)   100% ->
1125-1219  (103993-104087)   100% ->
1220-1293  (104693-104766)   100% ->
1294-1383  (104904-104993)   100% ->
1384-1489  (105673-105778)   100% ->
1490-1566  (107372-107448)   100% ->
1567-1641  (107817-107891)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACTCTGAAGCACTGGGCTTCGAACACATGGGCCTCGATCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGACTCTGAAGCACTGGGCTTCGAACACATGGGCCTCGATCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCCTTCAG         GCTGTCACCGATCTGGGCTGGTCGCGACCTA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCCTTCAGGTA...TAGGCTGTCACCGATCTGGGCTGGTCGCGACCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCTGATCCAGGAGAAGGCCATCCCACTGGCCCTAGAAGGGAAGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100183 CGCTGATCCAGGAGAAGGCCATCCCACTGGCCCTAGAAGGGAAGGACCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGCTCGGGCCCGCACGGGCTCCGGGAAGACGGCCGCTTATGCTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100233 CTGGCTCGGGCCCGCACGGGCTCCGGGAAGACGGCCGCTTATGCTATTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGCTGCAGCTGTTGCTCCATAGGAAGGCG         ACAGGTCCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100283 GATGCTGCAGCTGTTGCTCCATAGGAAGGCGGTG...CAGACAGGTCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTAGAACAGGCAGTGAGAGGCCTTGTTCTTGTTCCTACCAAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 TGGTAGAACAGGCAGTGAGAGGCCTTGTTCTTGTTCCTACCAAGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCACGGCAAGCACAGTCCATGATTCAGCAGCTGGCTACCTACTGTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100906 GCACGGCAAGCACAGTCCATGATTCAGCAGCTGGCTACCTACTGTGCTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGATGTCCGAGTGGCCAATGTCTCAGCTGCTGAAGACTCAGTCTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100956 GGATGTCCGAGTGGCCAATGTCTCAGCTGCTGAAGACTCAGTCTCTCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 G         AGCTGTGCTGATGGAGAAGCCAGATGTGGTAGTAGGGACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101006 GGTG...CAGAGCTGTGCTGATGGAGAAGCCAGATGTGGTAGTAGGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCATCTCGCATATTAAGCCACTTGCAGCAAGACAGCCTGAAACTTCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 CCATCTCGCATATTAAGCCACTTGCAGCAAGACAGCCTGAAACTTCGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCCCTGGAGCTTTTGGTGGTGGACGAAGCTGACCTTCTTTTTTCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101242 CTCCCTGGAGCTTTTGGTGGTGGACGAAGCTGACCTTCTTTTTTCCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTTTGAAGAAGAGCTCAAGAGTCTCCTCTG         TCACTTGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101292 GCTTTGAAGAAGAGCTCAAGAGTCTCCTCTGGTA...CAGTCACTTGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGGATTTACCAGGCTTTTCTCATGTCAGCTACTTTTAACGAGGACGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101469 CGGATTTACCAGGCTTTTCTCATGTCAGCTACTTTTAACGAGGACGTACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGCACTCAAGGAGCTGATATTACATAACCCG         GTTACCCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101519 AGCACTCAAGGAGCTGATATTACATAACCCGGTA...CAGGTTACCCTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGTTACAGGAGTCCCAGCTGCCTGGGCCAGACCAGTTACAGCAGTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102170 AGTTACAGGAGTCCCAGCTGCCTGGGCCAGACCAGTTACAGCAGTTTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGTCTGTGAGACTGAGGAAGACAAATTCCTCCTGCTGTATGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102220 GTGGTCTGTGAGACTGAGGAAGACAAATTCCTCCTGCTGTATGCCCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGCTGTCATTGATTCGGGGCAAGTCTCTGCTCTTTGTCAACACTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102270 CAAGCTGTCATTGATTCGGGGCAAGTCTCTGCTCTTTGTCAACACTCTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AACGGAGTTACCGGCTACGCCTGTTCTTGGAACAGTTCAGCATCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102320 AACGGAGTTACCGGCTACGCCTGTTCTTGGAACAGTTCAGCATCCCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGTGTGCTCAATGGAGAGCTTCCACTGCGCTCCAG         GTGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102370 TGTGTGCTCAATGGAGAGCTTCCACTGCGCTCCAGGTC...CAGGTGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATCATCTCACAGTTCAACCAAGGCTTCTACGACTGTGTCATAGCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103025 CATCATCTCACAGTTCAACCAAGGCTTCTACGACTGTGTCATAGCAACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATGCTGAAGTCCTGGGGGCCCCAGTCAAGGGCAAGCGTCGGGGCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103075 ATGCTGAAGTCCTGGGGGCCCCAGTCAAGGGCAAGCGTCGGGGCCGAGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCCAAAGGGGACAA         GGCCTCTGATCCGGAAGCAGGTGTGGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103125 CCCAAAGGGGACAAGTG...CAGGGCCTCTGATCCGGAAGCAGGTGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCGGGGCATAGACTTCCACCATGTGTCTGCTGTGCTCAACTTTGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103795 CCGGGGCATAGACTTCCACCATGTGTCTGCTGTGCTCAACTTTGATCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCCCAACCCCTGAGGCCTACATCCATCGAGCTGGCAG         GACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103845 CCCCAACCCCTGAGGCCTACATCCATCGAGCTGGCAGGTA...CAGGACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCACGCGCTAACAACCCAGGCATAGTCTTAACCTTTGTGCTTCCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103997 GCACGCGCTAACAACCCAGGCATAGTCTTAACCTTTGTGCTTCCCACGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCAGTTCCACTTAGGCAAGATTGAGGAGCTTCTCAGTGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104047 GCAGTTCCACTTAGGCAAGATTGAGGAGCTTCTCAGTGGAGGTA...CAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGAACAGGGGCCCCATTCTGCTCCCCTACCAGTTCCGGATGGAGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104693 AGAACAGGGGCCCCATTCTGCTCCCCTACCAGTTCCGGATGGAGGAGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAGGGCTTCCGCTATCGCTGCAGG         GATGCCATGCGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104743 GAGGGCTTCCGCTATCGCTGCAGGGTG...CAGGATGCCATGCGCTCAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GACTAAGCAGGCCATTCGGGAGGCAAGATTGAAGGAGATCAAGGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104921 GACTAAGCAGGCCATTCGGGAGGCAAGATTGAAGGAGATCAAGGAAGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTCTGCATTCTGAGAAGCTTAAG         ACATACTTTGAAGACAAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104971 TTCTGCATTCTGAGAAGCTTAAGGTG...CAGACATACTTTGAAGACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCTAGGGACCTCCAGCTGCTGCGGCATGACCTACCTTTGCACCCCGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105691 CCTAGGGACCTCCAGCTGCTGCGGCATGACCTACCTTTGCACCCCGCAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGTGAAGCCCCACCTGGGCCATGTTCCTGACTACCTGG         TTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105741 GGTGAAGCCCCACCTGGGCCATGTTCCTGACTACCTGGGTG...CAGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CTCCTGCTCTCCGTGGCCTGGTGCGCCCTCACAAGAAGCGGAAGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107375 CTCCTGCTCTCCGTGGCCTGGTGCGCCCTCACAAGAAGCGGAAGAAGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TCTTCCTCTTGTAGGAAGGCCAAG         AGAGCAAAGTCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 107425 TCTTCCTCTTGTAGGAAGGCCAAGGTA...TAGAGAGCAAAGTCCCAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CCCACTGCGCAGCTTCAAGCACAAAGGAAAGAAATTCAGACCCACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107834 CCCACTGCGCAGCTTCAAGCACAAAGGAAAGAAATTCAGACCCACAGCCA

   1750     .
   1634 AGCCCTCC
        ||||||||
 107884 AGCCCTCC