seq1 = pF1KB5008.tfa, 882 bp
seq2 = pF1KB5008/gi568815588f_69351595.tfa (gi568815588f:69351595_69606975), 255381 bp

>pF1KB5008 882
>gi568815588f:69351595_69606975 (Chr10)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-282  (132097-132282)   100% ->
283-357  (133547-133621)   100% ->
358-453  (144000-144095)   100% ->
454-570  (146686-146802)   100% ->
571-618  (152844-152891)   100% ->
619-735  (154530-154646)   100% ->
736-882  (155235-155381)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGCGGGGACTCGGAGCAGGTGCGCTACTGCGCGCGCTTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCGCGGGGACTCGGAGCAGGTGCGCTACTGCGCGCGCTTCTCCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTGGCTCAAGTTTTCACTTATCATCTATTCCACCGTGTTCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 CCTCTGGCTCAAGTTTTCACTTATCATCTATTCCACCGTGTTCTGGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      CTGATTGGGGCCCTGGTCCTGTCTGTGGGCATCTATGCAGAGGTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGCTGATTGGGGCCCTGGTCCTGTCTGTGGGCATCTATGCAGAGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCGGCAGAAATATAAAACCCTTGAAAGTGCCTTCCTGGCTCCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132142 GAGCGGCAGAAATATAAAACCCTTGAAAGTGCCTTCCTGGCTCCAGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCCTCATCCTCCTGGGCGTCGTCATGTTCATGGTCTCCTTCATTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132192 CATCCTCATCCTCCTGGGCGTCGTCATGTTCATGGTCTCCTTCATTGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTGGCGTCCCTCCGTGACAACCTGTACCTTCTCCAAGCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 132242 TGCTGGCGTCCCTCCGTGACAACCTGTACCTTCTCCAAGCAGTG...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCATGTACATCCTTGGGATCTGCCTCATCATGGAGCTCATTGGTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133547 TTCATGTACATCCTTGGGATCTGCCTCATCATGGAGCTCATTGGTGGCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGGCCTTGACCTTCCGGAACCAG         ACCATTGACTTCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 133597 GGTGGCCTTGACCTTCCGGAACCAGGTG...TAGACCATTGACTTCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGACAACATTCGAAGAGGAATTGAGAACTACTATGATGATCTGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144016 ACGACAACATTCGAAGAGGAATTGAGAACTACTATGATGATCTGGACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAAACATCATGGACTTTGTTCAGAAAAAG         TTCAAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 144066 AAAAACATCATGGACTTTGTTCAGAAAAAGGTG...CAGTTCAAGTGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCGGGGAGGACTACCGAGATTGGAGCAAGAATCAGTACCACGACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146697 TGGCGGGGAGGACTACCGAGATTGGAGCAAGAATCAGTACCACGACTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGCCCCTGGACCCCTGGCCTGTGGGGTGCCCTACACCTGCTGCATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146747 GTGCCCCTGGACCCCTGGCCTGTGGGGTGCCCTACACCTGCTGCATCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACACG         ACAGAAGTTGTCAACACCATGTGTGGCTACAAAAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146797 AACACGGTA...CAGACAGAAGTTGTCAACACCATGTGTGGCTACAAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TATCGACAAGGAG         CGTTTCAGTGTGCAGGATGTCATCTACG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 152879 TATCGACAAGGAGGTA...CAGCGTTTCAGTGTGCAGGATGTCATCTACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGCGGGGCTGCACCAACGCCGTGATCATCTGGTTCATGGACAACTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154558 TGCGGGGCTGCACCAACGCCGTGATCATCTGGTTCATGGACAACTACACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCATGGCGGGCATCCTCCTGGGCATCCTGCTTCCCCAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 154608 ATCATGGCGGGCATCCTCCTGGGCATCCTGCTTCCCCAGGTG...CAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTGGGGGTGCTGCTGACGCTGCTGTACATCACCCGGGTGGAGGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155237 CCTGGGGGTGCTGCTGACGCTGCTGTACATCACCCGGGTGGAGGACATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCATGGAGCACTCTGTCACTGATGGGCTCCTGGGGCCCGGTGCCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155287 TCATGGAGCACTCTGTCACTGATGGGCTCCTGGGGCCCGGTGCCAAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    838 AGCGTGGAGGCGGCAGGCACGGGATGCTGCTTGTGCTACCCCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155337 AGCGTGGAGGCGGCAGGCACGGGATGCTGCTTGTGCTACCCCAAT