seq1 = pF1KB5006.tfa, 1377 bp
seq2 = pF1KB5006/gi568815586f_2695140.tfa (gi568815586f:2695140_2903255), 208116 bp

>pF1KB5006 1377
>gi568815586f:2695140_2903255 (Chr12)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-250  (101999-102143)   100% ->
251-393  (102590-102732)   100% ->
394-514  (103567-103687)   100% ->
515-671  (103949-104105)   100% ->
672-762  (104711-104801)   100% ->
763-846  (104900-104983)   100% ->
847-1032  (105253-105438)   100% ->
1033-1272  (105978-106217)   100% ->
1273-1377  (108012-108116)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGCCGAGGAGATGAAGGCGACCGAGAGCGGGGCGCAGTCGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGCCGAGGAGATGAAGGCGACCGAGAGCGGGGCGCAGTCGGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCCCATGGAGGGAGTGGACATCAGCCCCAAACAGGACGAAGGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCCCATGGAGGGAGTGGACATCAGCCCCAAACAGGACGAAGGCGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAAG         GTCATCAAGAGAGAGGGCACAGGTACAGAGATGCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAAGGTG...CAGGTCATCAAGAGAGAGGGCACAGGTACAGAGATGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGATTGGGGACCGAGTCTTTGTCCACTACACTGGCTGGCTATTAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102035 ATGATTGGGGACCGAGTCTTTGTCCACTACACTGGCTGGCTATTAGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACAAAGTTTGACTCCAGTCTGGATCGCAAGGACAAATTCTCCTTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102085 CACAAAGTTTGACTCCAGTCTGGATCGCAAGGACAAATTCTCCTTTGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGGAAAAG         GGGAGGTCATCAAGGCTTGGGACATTGCCATA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102135 TGGGAAAAGGTA...CAGGGGAGGTCATCAAGGCTTGGGACATTGCCATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCACCATGAAGGTGGGGGAGGTGTGCCACATCACCTGCAAACCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102622 GCCACCATGAAGGTGGGGGAGGTGTGCCACATCACCTGCAAACCAGAATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCCTACGGTTCAGCAGGCAGTCCTCCAAAGATTCCCCCCAATGCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102672 TGCCTACGGTTCAGCAGGCAGTCCTCCAAAGATTCCCCCCAATGCCACGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTATTTGAG         GTGGAGTTGTTTGAGTTTAAGGGAGAAGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102722 TTGTATTTGAGGTG...CAGGTGGAGTTGTTTGAGTTTAAGGGAGAAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGACGGAAGAGGAAGATGGCGGAATCATTCGCAGAATACAGACTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103597 CTGACGGAAGAGGAAGATGGCGGAATCATTCGCAGAATACAGACTCGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAAGGCTATGCTAAGCCCAATGAGGGTGCTATCGTGGAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103647 TGAAGGCTATGCTAAGCCCAATGAGGGTGCTATCGTGGAGGGTG...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGCACTGGAAGGGTACTACAAGGACAAGCTCTTTGACCAGCGGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103949 TTGCACTGGAAGGGTACTACAAGGACAAGCTCTTTGACCAGCGGGAGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGCTTTGAGATTGGCGAGGGGGAGAACCTGGATCTGCCTTATGGTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103999 CGCTTTGAGATTGGCGAGGGGGAGAACCTGGATCTGCCTTATGGTCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGGGCCATTCAGCGCATGGAGAAAGGAGAACATTCCATCGTGTACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104049 GAGGGCCATTCAGCGCATGGAGAAAGGAGAACATTCCATCGTGTACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCCCAG         CTATGCTTTTGGCAGTGTTGGGAAGGAAAAGTTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104099 AGCCCAGGTG...CAGCTATGCTTTTGGCAGTGTTGGGAAGGAAAAGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAAATCCCACCAAATGCTGAGCTGAAATATGAATTACACCTCAAGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104745 CAAATCCCACCAAATGCTGAGCTGAAATATGAATTACACCTCAAGAGTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAAAAG         GCCAAGGAGTCTTGGGAGATGAATTCAGAAGAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104795 TGAAAAGGTA...CAGGCCAAGGAGTCTTGGGAGATGAATTCAGAAGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTGGAACAGAGCACCATAGTGAAAGAGCGGGGCACTGTGTACTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104934 AGCTGGAACAGAGCACCATAGTGAAAGAGCGGGGCACTGTGTACTTCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847          GAAGGTAAATACAAGCAAGCTTTACTACAGTATAAGAAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104984 GTG...CAGGAAGGTAAATACAAGCAAGCTTTACTACAGTATAAGAAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CGTGTCTTGGCTGGAATATGAGTCTAGTTTTTCCAATGAGGAAGCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105294 CGTGTCTTGGCTGGAATATGAGTCTAGTTTTTCCAATGAGGAAGCACAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGCACAGGCCCTTCGACTGGCCTCTCACCTCAACCTGGCCATGTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105344 AAGCACAGGCCCTTCGACTGGCCTCTCACCTCAACCTGGCCATGTGTCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGAAACTACAGGCCTTCTCTGCTGCCATTGAAAGCTGTAACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105394 CTGAAACTACAGGCCTTCTCTGCTGCCATTGAAAGCTGTAACAAGGTG..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033     GCCCTAGAACTGGACAGCAACAACGAGAAGGGCCTCTTCCGCCGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105444 .TAGGCCCTAGAACTGGACAGCAACAACGAGAAGGGCCTCTTCCGCCGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAGAGGCCCACCTGGCCGTGAATGACTTTGAACTGGCACGGGCTGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106024 GAGAGGCCCACCTGGCCGTGAATGACTTTGAACTGGCACGGGCTGATTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CAGAAGGTCCTGCAGCTCTACCCCAACAACAAAGCCGCCAAGACCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106074 CAGAAGGTCCTGCAGCTCTACCCCAACAACAAAGCCGCCAAGACCCAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGCTGTGTGCCAGCAGCGGATCCGAAGGCAGCTTGCCCGGGAGAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106124 GGCTGTGTGCCAGCAGCGGATCCGAAGGCAGCTTGCCCGGGAGAAGAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCTATGCCAATATGTTTGAGAGGCTGGCTGAGGAGGAGAACAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106174 TCTATGCCAATATGTTTGAGAGGCTGGCTGAGGAGGAGAACAAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273    GCCAAGGCAGAGGCTTCCTCAGGAGACCATCCCACTGACACAGAGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108009 CAGGCCAAGGCAGAGGCTTCCTCAGGAGACCATCCCACTGACACAGAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAAGGAGGAGCAGAAGAGCAACACGGCAGGGAGCCAGTCTCAGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108059 GAAGGAGGAGCAGAAGAGCAACACGGCAGGGAGCCAGTCTCAGGTGGAGA

   1450     .
   1370 CAGAAGCA
        ||||||||
 108109 CAGAAGCA