seq1 = pF1KB4998.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KB4998/gi568815581r_76636164.tfa (gi568815581r:76636164_76837160), 200997 bp

>pF1KB4998 663
>gi568815581r:76636164_76837160 (Chr17)

(complement)

1-362  (100001-100362)   99% ->
363-663  (100697-100997)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTACGGCCGCCCCCCTCCCGATGTGGAGGGTATGACCTCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTACGGCCGCCCCCCTCCCGATGTGGAGGGTATGACCTCCCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGACAACCTGACCTACCGCACCTCGCCCGACACGCTGAGGCGCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGACAACCTGACCTACCGCACCTCGCCCGACACGCTGAGGCGCGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGAGAAGTACGGGCGCGTCGGCGACGTGTACATCCCGCGGGATCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100101 TCGAGAAGTACGGGCGCGTCGGCGACGTGTACATCCCGCGGGACCGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCAAGGAGTCCCGCGGCTTCGCCTTCGTTCGCTTTCACGACAAGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCAAGGAGTCCCGCGGCTTCGCCTTCGTTCGCTTTCACGACAAGCGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCTGAGGACGCTATGGATGCCATGGACGGGGCCGTGCTGGACGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCTGAGGACGCTATGGATGCCATGGACGGGGCCGTGCTGGACGGCCGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGCGGGTGCAAATGGCGCGCTACGGCCGCCCCCCGGACTCACACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGCGGGTGCAAATGGCGCGCTACGGCCGCCCCCCGGACTCACACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCGCCGGGGACCGCCACCCCGCAGGTACGGGGGCGGTGGCTACGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCGCCGGGGACCGCCACCCCGCAGGTACGGGGGCGGTGGCTACGGACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGGAGCCGCAG         CCCTAGGCGGCGTCGCCGCAGCCGATCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGGAGCCGCAGGTA...CAGCCCTAGGCGGCGTCGCCGCAGCCGATCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAGTCGGAGCCGTTCCAGGTCTCGCAGCCGATCTCGCTACAGCCGCTCG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100726 GGAGTCGGAGTCGTTCCAGGTCTCGCAGCCGATCTCGCTACAGCCGCTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTCTCGGTCCCGCACTCGTTCTCGATCTCGGTCGACCTCCAAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100776 AAGTCTCGGTCCCGCACTCGTTCTCGATCTCGGTCGACCTCCAAGTCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATCCGCACGAAGGTCCAAGTCCAAGTCCTCGTCGGTCTCCAGATCTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100826 ATCCGCACGAAGGTCCAAGTCCAAGTCCTCGTCGGTCTCCAGATCTCGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGCGGTCCAGGTCCCGGTCTCGGTCCAGGAGTCCTCCCCCAGTGTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100876 CGCGGTCCAGGTCCCGGTCTCGGTCCAGGAGTCCTCCCCCAGTGTCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGGGAATCCAAATCCAGGTCGCGATCGAAGAGTCCCCCCAAGTCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100926 AGGGAATCCAAATCCAGGTCGCGATCGAAGAGTCCCCCCAAGTCTCCTGA

    650     .    :    .    :
    642 AGAGGAAGGAGCGGTGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||
 100976 AGAGGAAGGAGCGGTGTCCTCT