seq1 = pF1KB4980.tfa, 2541 bp
seq2 = pF1KB4980/gi568815586r_56996575.tfa (gi568815586r:56996575_57208278), 211704 bp

>pF1KB4980 2541
>gi568815586r:56996575_57208278 (Chr12)

(complement)

1-116  (100001-100116)   100% ->
117-255  (100536-100674)   100% ->
256-339  (100965-101048)   100% ->
340-478  (101448-101586)   100% ->
479-531  (101699-101751)   100% ->
532-680  (101940-102088)   100% ->
681-812  (102680-102811)   100% ->
813-1001  (102940-103128)   100% ->
1002-1089  (103466-103553)   100% ->
1090-1212  (103693-103815)   100% ->
1213-1305  (105358-105450)   100% ->
1306-1512  (105783-105989)   100% ->
1513-1607  (108189-108283)   100% ->
1608-1744  (108376-108512)   100% ->
1745-1891  (108839-108985)   100% ->
1892-1955  (109201-109264)   100% ->
1956-2066  (109377-109487)   100% ->
2067-2159  (109682-109774)   100% ->
2160-2225  (111146-111211)   100% ->
2226-2354  (111301-111429)   100% ->
2355-2541  (111518-111704)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCTGTGGGGTCTGGTCTCCAAGATGCCCCCAGAAAAAGTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCTGTGGGGTCTGGTCTCCAAGATGCCCCCAGAAAAAGTGCAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTATGTCGACTTTCCCCAACACCTGCGGCATCTTCTGGGTGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTATGTCGACTTTCCCCAACACCTGCGGCATCTTCTGGGTGACTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGAGCCAGCCCTG         GGAGTTCCTGGTCGGCTCCGACGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGAGAGCCAGCCCTGGTG...CAGGGAGTTCCTGGTCGGCTCCGACGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCTGCTGCAACTTGGCTAGTGCCCTACTTTCAGACACTGTCCAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100561 TTCTGCTGCAACTTGGCTAGTGCCCTACTTTCAGACACTGTCCAGCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAGGCCTCGGTGGGAGAGCAGGGGGAGGGGAGCACCATCTTGCAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100611 TCAGGCCTCGGTGGGAGAGCAGGGGGAGGGGAGCACCATCTTGCAACACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGCACCCTTGAG         AGCATATATCAGAGGGACCCCCTGAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100661 TCAGCACCCTTGAGGTG...TAGAGCATATATCAGAGGGACCCCCTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTGGCCACTTTCAGACAAATACTTCAAGGAGAGAAAAAAGCTGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100992 CTGGTGGCCACTTTCAGACAAATACTTCAAGGAGAGAAAAAAGCTGTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAACAG         TTCCGCCACTTGCCAATGCCTTTCCACTGGAAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101042 GGAACAGGTA...TAGTTCCGCCACTTGCCAATGCCTTTCCACTGGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAAGAACTCAAGTTTAAGACAGGCTTGCGGAGGCTGCAGCACCGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101482 AGGAAGAACTCAAGTTTAAGACAGGCTTGCGGAGGCTGCAGCACCGAGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGGAGATCCACCTTCTCCGAGAAGCCCTGCAGAAGGGGGCTGAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101532 GGGGAGATCCACCTTCTCCGAGAAGCCCTGCAGAAGGGGGCTGAGGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAAG         TGTCTCTGCACAGCTTGATAGAAACTCCTGCTAATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101582 CCAAGGTG...CAGTGTCTCTGCACAGCTTGATAGAAACTCCTGCTAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGACTGGGCCAAGTGAG         GCCCTGGCCATGCTACTGCAGGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101735 GGACTGGGCCAAGTGAGGTG...TAGGCCCTGGCCATGCTACTGCAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACCACTGGAGAGCTAGAGGCAGCCAAAGCCCTAGTGCTGAAGAGGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101964 ACCACTGGAGAGCTAGAGGCAGCCAAAGCCCTAGTGCTGAAGAGGATCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATTTGGAAACGGCAGCAGCAGCTGGCAGGGAATGGCGCACCGTTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102014 GATTTGGAAACGGCAGCAGCAGCTGGCAGGGAATGGCGCACCGTTTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAGCCTGGCCCCACTCCAGGAGAG         GTGTGAAAGCCTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102064 AGAGCCTGGCCCCACTCCAGGAGAGGTT...CAGGTGTGAAAGCCTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GACATTTATTCCCAGCTACAGCAGGAGGTAGGGGCGGCTGGTGGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102696 GACATTTATTCCCAGCTACAGCAGGAGGTAGGGGCGGCTGGTGGGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAGCCCAAGACCCGGGCATCGCTGACTGGCCGGCTGGATGAAGTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102746 TGAGCCCAAGACCCGGGCATCGCTGACTGGCCGGCTGGATGAAGTCCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAACCCTCGTCACCAG         TTGCTTCCTGGTGGAGAAGCAGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102796 GAACCCTCGTCACCAGGTA...CAGTTGCTTCCTGGTGGAGAAGCAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCCCAGGTACTGAAGACTCAGACCAAGTTCCAGGCTGGAGTTCGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102965 CCCCAGGTACTGAAGACTCAGACCAAGTTCCAGGCTGGAGTTCGATTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTTGGGCTTGAGGTTCCTGGGGGCCCCAGCCAAGCCTCCGCTGGTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103015 GTTGGGCTTGAGGTTCCTGGGGGCCCCAGCCAAGCCTCCGCTGGTCAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGACATGGTGACAGAGAAGCAGGCGCGGGAGCTGAGTGTGCCTCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103065 CCGACATGGTGACAGAGAAGCAGGCGCGGGAGCTGAGTGTGCCTCAGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCTGGGGCTGGAGC         AGAAAGCACTGGAGAAATCATCAACAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103115 CCTGGGGCTGGAGCGTA...CAGAGAAAGCACTGGAGAAATCATCAACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CACTGTGCCCTTGGAGAACAGCATTCCTGGGAACTGCTGCTCTGCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103493 CACTGTGCCCTTGGAGAACAGCATTCCTGGGAACTGCTGCTCTGCCCTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCAAGAACCTG         CTTCTCAAGAAGATCAAGCGGTGTGAGCGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103543 TCAAGAACCTGGTG...CAGCTTCTCAAGAAGATCAAGCGGTGTGAGCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAGGGCACTGAGTCTGTCACAGAGGAGAAGTGCGCTGTGCTCTTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103723 AAGGGCACTGAGTCTGTCACAGAGGAGAAGTGCGCTGTGCTCTTCTCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CAGCTTCACACTTGGCCCCGGCAAACTCCCCATCCAGCTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103773 CAGCTTCACACTTGGCCCCGGCAAACTCCCCATCCAGCTCCAGGTG...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1213   GCCCTGTCTCTGCCCCTGGTGGTCATCGTCCATGGCAACCAAGACAAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105356 AGGCCCTGTCTCTGCCCCTGGTGGTCATCGTCCATGGCAACCAAGACAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AATGCCAAAGCCACTATCCTGTGGGACAATGCCTTCTCTGAGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105406 AATGCCAAAGCCACTATCCTGTGGGACAATGCCTTCTCTGAGATGGTG..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306     GACCGCGTGCCCTTTGTGGTGGCTGAGCGGGTGCCCTGGGAGAAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105456 .CAGGACCGCGTGCCCTTTGTGGTGGCTGAGCGGGTGCCCTGGGAGAAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGTGTGAAACTCTGAACCTGAAGTTCATGGCTGAGGTGGGGACCAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105829 TGTGTGAAACTCTGAACCTGAAGTTCATGGCTGAGGTGGGGACCAACCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGGCTGCTCCCAGAGCACTTCCTCTTCCTGGCCCAGAAGATCTTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105879 GGGCTGCTCCCAGAGCACTTCCTCTTCCTGGCCCAGAAGATCTTCAATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAACAGCCTCAGTATGGAGGCCTTCCAGCACCGTTCTGTGTCCTGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105929 CAACAGCCTCAGTATGGAGGCCTTCCAGCACCGTTCTGTGTCCTGGTCGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGTTCAACAAG         GAGATCCTGCTGGGCCGTGGCTTCACCTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105979 AGTTCAACAAGGTC...TAGGAGATCCTGCTGGGCCGTGGCTTCACCTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TGGCAGTGGTTTGATGGTGTCCTGGACCTCACCAAACGCTGTCTCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108219 TGGCAGTGGTTTGATGGTGTCCTGGACCTCACCAAACGCTGTCTCCGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CTACTGGTCTGACCG         GCTGATCATTGGCTTCATCAGCAAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108269 CTACTGGTCTGACCGGTG...CAGGCTGATCATTGGCTTCATCAGCAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGTACGTTACTAGCCTTCTTCTCAATGAGCCCGACGGAACCTTTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108402 AGTACGTTACTAGCCTTCTTCTCAATGAGCCCGACGGAACCTTTCTCCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CGCTTCAGCGACTCAGAGATTGGGGGCATCACCATTGCCCATGTCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108452 CGCTTCAGCGACTCAGAGATTGGGGGCATCACCATTGCCCATGTCATCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGGCCAGGATG         GCTCTCCACAGATAGAGAACATCCAGCCAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 108502 GGGCCAGGATGGTG...TAGGCTCTCCACAGATAGAGAACATCCAGCCAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCTCTGCCAAAGACCTGTCCATTCGCTCACTGGGGGACCGAATCCGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108869 TCTCTGCCAAAGACCTGTCCATTCGCTCACTGGGGGACCGAATCCGGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTTGCTCAGCTCAAAAATCTCTATCCCAAGAAGCCCAAGGATGAGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108919 CTTGCTCAGCTCAAAAATCTCTATCCCAAGAAGCCCAAGGATGAGGCTTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CCGGAGCCACTACAAGC         CTGAACAGATGGGTAAGGATGGCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108969 CCGGAGCCACTACAAGCGTG...CAGCTGAACAGATGGGTAAGGATGGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GGGGTTATGTCCCAGCTACCATCAAGATGACCGTGGAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109225 GGGGTTATGTCCCAGCTACCATCAAGATGACCGTGGAAAGGTG...CAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GACCAACCACTTCCTACCCCAGAGCTCCAGATGCCTACCATGGTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109378 GACCAACCACTTCCTACCCCAGAGCTCCAGATGCCTACCATGGTGCCTTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TTATGACCTTGGAATGGCCCCTGATTCCTCCATGAGCATGCAGCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109428 TTATGACCTTGGAATGGCCCCTGATTCCTCCATGAGCATGCAGCTTGGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CAGATATGGT         GCCCCAGGTGTACCCACCACACTCTCACTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109478 CAGATATGGTGTA...CAGGCCCCAGGTGTACCCACCACACTCTCACTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 ATCCCCCCGTATCAAGGCCTCTCCCCAGAAGAATCAGTCAACGTGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109713 ATCCCCCCGTATCAAGGCCTCTCCCCAGAAGAATCAGTCAACGTGTTGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGCCTTCCAGGA         GCCTCACCTGCAGATGCCCCCCAGCCTGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109763 AGCCTTCCAGGAGTA...CAGGCCTCACCTGCAGATGCCCCCCAGCCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 GCCAGATGAGCCTGCCCTTTGACCAGCCTCACCCCCA         GGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111175 GCCAGATGAGCCTGCCCTTTGACCAGCCTCACCCCCAGTG...CAGGGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 CTGCTGCCGTGCCAGCCTCAGGAGCATGCTGTGTCCAGCCCTGACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111305 CTGCTGCCGTGCCAGCCTCAGGAGCATGCTGTGTCCAGCCCTGACCCCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 GCTCTGCTCAGATGTGACCATGGTGGAAGACAGCTGCCTGAGCCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111355 GCTCTGCTCAGATGTGACCATGGTGGAAGACAGCTGCCTGAGCCAGCCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 TGACAGCGTTTCCTCAGGGCACTTG         GATTGGTGAAGACATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 111405 TGACAGCGTTTCCTCAGGGCACTTGGTG...CAGGATTGGTGAAGACATA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 TTCCCTCCTCTGCTGCCTCCCACTGAACAGGACCTCACTAAGCTTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111534 TTCCCTCCTCTGCTGCCTCCCACTGAACAGGACCTCACTAAGCTTCTCCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 GGAGGGGCAAGGGGAGTCGGGGGGAGGGTCCTTGGGGGCACAGCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111584 GGAGGGGCAAGGGGAGTCGGGGGGAGGGTCCTTGGGGGCACAGCCCCTCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 TGCAGCCCTCCCACTATGGGCAATCTGGGATCTCAATGTCCCACATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111634 TGCAGCCCTCCCACTATGGGCAATCTGGGATCTCAATGTCCCACATGGAC

   2700     .    :    .    :
   2521 CTAAGGGCCAACCCCAGTTGG
        |||||||||||||||||||||
 111684 CTAAGGGCCAACCCCAGTTGG