seq1 = pF1KB4961.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KB4961/gi568815580f_54777586.tfa (gi568815580f:54777586_54989410), 211825 bp

>pF1KB4961 654
>gi568815580f:54777586_54989410 (Chr18)

1-153  (100001-100153)   100% ->
154-239  (101784-101869)   100% ->
240-343  (106748-106851)   100% ->
344-467  (110410-110533)   100% ->
468-654  (111639-111825)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGATGGAGACTATGATTATCTGATCAAACTCCTGGCCCTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGATGGAGACTATGATTATCTGATCAAACTCCTGGCCCTCGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAGGGGTGGGGAAGACAACATTTCTTTATAGATACACAGATAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCAGGGGTGGGGAAGACAACATTTCTTTATAGATACACAGATAATAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAATCCCAAATTCATCACTACAGTAGGAATAGACTTTCGGGAAAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAATCCCAAATTCATCACTACAGTAGGAATAGACTTTCGGGAAAAACGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTG         GTTTATAATGCACAAGGACCGAATGGATCTTCAGGGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGTG...CAGGTTTATAATGCACAAGGACCGAATGGATCTTCAGGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCATTTAAAGTGCATCTTCAGCTTTGGGACACTGCGGGACAAGAGCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101822 AGCATTTAAAGTGCATCTTCAGCTTTGGGACACTGCGGGACAAGAGCGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        GTTCCGGAGTCTCACCACTGCATTTTTCAGAGACGCCATGGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101872 A...CAGGTTCCGGAGTCTCACCACTGCATTTTTCAGAGACGCCATGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCTTATTAATGTTTGACCTCACCAGTCAACAGAGCTTCTTAAATGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106791 TTCTTATTAATGTTTGACCTCACCAGTCAACAGAGCTTCTTAAATGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAACTGGATGA         GCCAACTGCAAGCAAATGCTTATTGTGAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 106841 AAACTGGATGAGTA...AAGGCCAACTGCAAGCAAATGCTTATTGTGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCCAGATATAGTATTAATTGGCAACAAGGCAGACCTACCAGATCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110440 ATCCAGATATAGTATTAATTGGCAACAAGGCAGACCTACCAGATCAGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGTCAATGAACGGCAAGCTCGGGAACTGGCTGACAAATATGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110490 GAAGTCAATGAACGGCAAGCTCGGGAACTGGCTGACAAATATGGGTA...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    468    CATACCATATTTTGAAACAAGTGCAGCAACTGGACAGAATGTGGAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111636 TAGCATACCATATTTTGAAACAAGTGCAGCAACTGGACAGAATGTGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGCTGTAGAAACCCTTTTGGACTTAATCATGAAGCGAATGGAACAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111686 AAGCTGTAGAAACCCTTTTGGACTTAATCATGAAGCGAATGGAACAGTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGGAGAAGACACAAATCCCTGATACTGTCAATGGTGGAAATTCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111736 GTGGAGAAGACACAAATCCCTGATACTGTCAATGGTGGAAATTCTGGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTGGATGGGGAAAAGCCACCAGAGAAGAAATGTATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111786 CTTGGATGGGGAAAAGCCACCAGAGAAGAAATGTATCTGC