seq1 = pF1KB4796.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KB4796/gi568815584f_52630475.tfa (gi568815584f:52630475_52871103), 240629 bp

>pF1KB4796 669
>gi568815584f:52630475_52871103 (Chr14)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-90  (114378-114410)   100% ->
91-144  (115952-116005)   100% ->
145-242  (120209-120306)   100% ->
243-303  (126077-126137)   100% ->
304-340  (126845-126881)   100% ->
341-380  (127269-127308)   100% ->
381-431  (127400-127450)   100% ->
432-504  (129208-129280)   100% ->
505-598  (138366-138459)   100% ->
599-669  (140559-140629)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGTGAAGCTGGAGTTCCCTTCCCTTCCACAGTGCAAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGACGTGAAGCTGGAGTTCCCTTCCCTTCCACAGTGCAAGGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGAG         GAGTGGACCTACCCTATGAGACGAGAGATGCAG 
        |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CGCCGAGGTG...CAGGAGTGGACCTACCCTATGAGACGAGAGATGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91         GAAATTTTACCTGGATTGTTCTTAGGCCCATATTCATCTGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114412 TA...TAGGAAATTTTACCTGGATTGTTCTTAGGCCCATATTCATCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATGAAAAGCAAG         CTACCTGTACTACAGAAACATGGAATAAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 115994 ATGAAAAGCAAGGTA...CAGCTACCTGTACTACAGAAACATGGAATAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CCATATAATATGCATACGACAAAATATTGAAGCAAACTTTATTAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120238 CCATATAATATGCATACGACAAAATATTGAAGCAAACTTTATTAAACCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACTTTCAGCAGTTATTTAG         ATATTTAGTCCTGGATATTGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 120288 ACTTTCAGCAGTTATTTAGGTA...CAGATATTTAGTCCTGGATATTGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GATAATCCAGTTGAAAATATAATACGTTTTTTCCCTATG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 126099 GATAATCCAGTTGAAAATATAATACGTTTTTTCCCTATGGTA...CAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 TAAGGAATTTATTGATGGGAGCTTACAAATGGGAG         GAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126847 TAAGGAATTTATTGATGGGAGCTTACAAATGGGAGGTA...CAGGAAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    347 TTCTTGTGCATGGAAATGCAGGGATCTCCAGAAG         TGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 127275 TTCTTGTGCATGGAAATGCAGGGATCTCCAGAAGGTA...CAGTGCAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 TTTGTTATTGCATACATTATGGAAACATTTGGAATGAAGTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127407 TTTGTTATTGCATACATTATGGAAACATTTGGAATGAAGTACAGGTA...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432    AGATGCTTTTGCTTATGTTCAAGAAAGAAGATTTTGTATTAATCCTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129205 CAGAGATGCTTTTGCTTATGTTCAAGAAAGAAGATTTTGTATTAATCCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479 ATGCTGGATTTGTCCATCAACTTCAG         GAATATGAAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 129255 ATGCTGGATTTGTCCATCAACTTCAGGTA...TAGGAATATGAAGCCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    520 TACCTAGCAAAATTAACAATACAGATGATGTCACCACTCCAGATAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138381 TACCTAGCAAAATTAACAATACAGATGATGTCACCACTCCAGATAGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570 GTCATTATCTGTTCATTCTGGTACCACAG         GCAGTTTGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 138431 GTCATTATCTGTTCATTCTGGTACCACAGGTA...TAGGCAGTTTGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    611 GAACACATGAAGAAGAGGATGATTTTGGAACCATGCAAGTGGCGACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140571 GAACACATGAAGAAGAGGATGATTTTGGAACCATGCAAGTGGCGACTGCA

    750     .
    661 CAGAATGGC
        |||||||||
 140621 CAGAATGGC