seq1 = pF1KB4700.tfa, 2718 bp
seq2 = pF1KB4700/gi568815580r_27852156.tfa (gi568815580r:27852156_28277022), 424867 bp

>pF1KB4700 2718
>gi568815580r:27852156_28277022 (Chr18)

(complement)

53-172  (129231-129350)   98% ->
173-399  (263114-263340)   100% ->
400-546  (265031-265177)   100% ->
547-702  (267151-267306)   100% ->
703-847  (271030-271174)   100% ->
848-1020  (273854-274026)   100% ->
1021-1158  (283386-283523)   100% ->
1159-1344  (284183-284368)   100% ->
1345-1598  (286673-286926)   99% ->
1599-1741  (288357-288499)   100% ->
1742-1975  (291262-291495)   100% ->
1976-2209  (291790-292023)   99% ->
2210-2349  (293940-294079)   100% ->
2350-2514  (313502-313666)   100% ->
2515-2718  (324664-324867)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     53 TGCTTCAGGCGTCTGTAGAGGCTTCTGGTGAAATCGCATTATGCAAGACT
        || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129231 TGTTGCAGGCGTCTGTAGAGGCTTCTGGTGAAATCGCATTATGCAAGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    103 GGATTTCCTGAAGATGTTTACAGTGCAGTCTTATCGAAGGATGTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129281 GGATTTCCTGAAGATGTTTACAGTGCAGTCTTATCGAAGGATGTGCATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    153 AGGACAGCCTCTTCTCAATG         TGAAGTTTAGCAACTGCAATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 129331 AGGACAGCCTCTTCTCAATGGTA...CAGTGAAGTTTAGCAACTGCAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194 GAAAAAGAAAAGTACAATATGAGAGCAGTGAGCCTGCAGATTTTAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263135 GAAAAAGAAAAGTACAATATGAGAGCAGTGAGCCTGCAGATTTTAAGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244 GATGAAGATGGCATGGTGTATGCCGTGAGAAGCTTTCCACTCTCTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263185 GATGAAGATGGCATGGTGTATGCCGTGAGAAGCTTTCCACTCTCTTCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    294 GCATGCCAAGTTCCTGATATATGCCCAAGACAAAGAGACCCAGGAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263235 GCATGCCAAGTTCCTGATATATGCCCAAGACAAAGAGACCCAGGAAAAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344 GGCAAGTGGCAGTAAAATTGAGCCTGAAGCCAACCTTAACTGAGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263285 GGCAAGTGGCAGTAAAATTGAGCCTGAAGCCAACCTTAACTGAGGAGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    394 GTGAAG         GAGTCAGCAGAAGTTGAAGAAATAGTGTTCCCAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263335 GTGAAGGTA...AAGGAGTCAGCAGAAGTTGAAGAAATAGTGTTCCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    435 ACAATTCAGTAAGCACAGTGGCCACCTACAAAGGCAGAAGAGAGACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265066 ACAATTCAGTAAGCACAGTGGCCACCTACAAAGGCAGAAGAGAGACTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485 TCATCCCTCCAATCAACTTGCCAGAAAACTCCAGGGGACCTTTTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265116 TCATCCCTCCAATCAACTTGCCAGAAAACTCCAGGGGACCTTTTCCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    535 GAGCTTGTCAGG         ATCAGGTCTGATAGAGATAAAAACCTTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 265166 GAGCTTGTCAGGGTA...CAGATCAGGTCTGATAGAGATAAAAACCTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576 ACTGCGGTACAGTGTAACTGGGCCAGGAGCTGACCAGCCTCCAACTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267180 ACTGCGGTACAGTGTAACTGGGCCAGGAGCTGACCAGCCTCCAACTGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    626 TCTTCATTATCAACCCCATCTCGGGTCAGCTGTCGGTGACAAAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267230 TCTTCATTATCAACCCCATCTCGGGTCAGCTGTCGGTGACAAAGCCCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    676 GATCGCGAGCAGATAGCCCGGTTTCAT         TTGAGGGCACATGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 267280 GATCGCGAGCAGATAGCCCGGTTTCATGTA...CAGTTGAGGGCACATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    717 AGTAGATATTAATGGAAATCAAGTGGAGAACCCCATTGACATTGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271044 AGTAGATATTAATGGAAATCAAGTGGAGAACCCCATTGACATTGTCATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    767 ATGTTATTGACATGAATGACAACAGACCTGAGTTCTTACACCAGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271094 ATGTTATTGACATGAATGACAACAGACCTGAGTTCTTACACCAGGTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    817 AATGGGACAGTTCCTGAGGGATCAAAGCCTG         GAACATATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 271144 AATGGGACAGTTCCTGAGGGATCAAAGCCTGGTA...TAGGAACATATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    858 GATGACCGTAACAGCAATTGATGCTGACGATCCCAATGCCCTCAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273864 GATGACCGTAACAGCAATTGATGCTGACGATCCCAATGCCCTCAATGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    908 TGTTGAGGTACAGAATCGTGTCTCAGGCTCCAAGCACCCCTTCACCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273914 TGTTGAGGTACAGAATCGTGTCTCAGGCTCCAAGCACCCCTTCACCCAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    958 ATGTTTACAATCAACAATGAGACTGGTGACATCATCACAGTGGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273964 ATGTTTACAATCAACAATGAGACTGGTGACATCATCACAGTGGCAGCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1008 ACTTGATCGAGAA         AAAGTGCAACAGTATACGTTAATAATTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 274014 ACTTGATCGAGAAGTA...TAGAAAGTGCAACAGTATACGTTAATAATTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1049 AAGCTACAGACATGGAAGGCAATCCCACATATGGCCTTTCAAACACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283414 AAGCTACAGACATGGAAGGCAATCCCACATATGGCCTTTCAAACACAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1099 ACGGCCGTCATCACAGTGACAGATGTCAATGACAATCCTCCAGAGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283464 ACGGCCGTCATCACAGTGACAGATGTCAATGACAATCCTCCAGAGTTTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1149 TGCCATGACG         TTTTATGGTGAAGTTCCTGAGAACAGGGTAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 283514 TGCCATGACGGTG...CAGTTTTATGGTGAAGTTCCTGAGAACAGGGTAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1190 ACATCATAGTAGCTAATCTAACTGTGACCGATAAGGATCAACCCCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284214 ACATCATAGTAGCTAATCTAACTGTGACCGATAAGGATCAACCCCATACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1240 CCAGCCTGGAACGCAGTGTACAGAATCAGTGGCGGAGATCCTACTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284264 CCAGCCTGGAACGCAGTGTACAGAATCAGTGGCGGAGATCCTACTGGACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1290 GTTCGCCATCCAGACCGACCCAAACAGCAACGACGGGTTAGTCACCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284314 GTTCGCCATCCAGACCGACCCAAACAGCAACGACGGGTTAGTCACCGTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1340 TCAAA         CCAATCGACTTTGAAACAAATAGGATGTTTGTCCTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284364 TCAAAGTA...CAGCCAATCGACTTTGAAACAAATAGGATGTTTGTCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1381 ACTGTTGCTGCAGAAAATCAAGTGCCATTAGCCAAGGGAATTCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286709 ACTGTTGCTGCAGAAAATCAAGTGCCATTAGCCAAGGGAATTCAGCACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1431 GCCTCAGTCAACTGCAACCGTGTCTGTTACAGTTATTGACGTAAATGAAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286759 CCCTCAGTCAACTGCAACCGTGTCTGTTACAGTTATTGACGTAAATGAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1481 ACCCTTATTTTGCCCCCAATCCTAAGATCATTCGCCAAGAAGAAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286809 ACCCTTATTTTGCCCCCAATCCTAAGATCATTCGCCAAGAAGAAGGGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1531 CATGCCGGTACCATGTTGACAACATTCACTGCTCAGGACCCAGATCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286859 CATGCCGGTACCATGTTGACAACATTCACTGCTCAGGACCCAGATCGATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1581 TATGCAGCAAAATATTAG         ATACACTAAATTATCTGATCCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 286909 TATGCAGCAAAATATTAGGTA...TAGATACACTAAATTATCTGATCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1622 CCAATTGGCTAAAAATAGATCCTGTGAATGGACAAATAACTACAATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288380 CCAATTGGCTAAAAATAGATCCTGTGAATGGACAAATAACTACAATTGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1672 GTTTTGGACCGAGAATCACCAAATGTGAAAAACAATATATATAATGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288430 GTTTTGGACCGAGAATCACCAAATGTGAAAAACAATATATATAATGCTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1722 TTTCCTTGCTTCTGACAATG         GAATTCCTCCTATGAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 288480 TTTCCTTGCTTCTGACAATGGTA...CAGGAATTCCTCCTATGAGTGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1763 CAGGAACGCTGCAGATCTATTTACTTGATATTAATGACAATGCCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291283 CAGGAACGCTGCAGATCTATTTACTTGATATTAATGACAATGCCCCTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1813 GTGTTACCTCAAGAGGCAGAGACTTGCGAAACTCCAGACCCCAATTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291333 GTGTTACCTCAAGAGGCAGAGACTTGCGAAACTCCAGACCCCAATTCAAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1863 TAATATTACAGCACTTGATTATGACATTGATCCAAATGCTGGACCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291383 TAATATTACAGCACTTGATTATGACATTGATCCAAATGCTGGACCATTTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1913 CTTTTGATCTTCCTTTATCTCCAGTGACTATTAAGAGAAATTGGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291433 CTTTTGATCTTCCTTTATCTCCAGTGACTATTAAGAGAAATTGGACCATC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1963 ACTCGGCTTAATG         GTGATTTTGCTCAGCTTAATTTAAAGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 291483 ACTCGGCTTAATGGTA...TAGGTGATTTTGCTCAGCTTAATTTAAAGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2004 AAAATTTCTTGAAGCTGGTATCTATGAAGTTCCCATCATAATCACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291818 AAAATTTCTTGAAGCTGGTATCTATGAAGTTCCCATCATAATCACAGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2054 CGGGTAATCCTCCCAAATCAAATATTTCCATCCTGCGCGTGAAGGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 291868 CGGGTAATCCTCCCAAATCAAATATTTCCATCCTGCGTGTGAAGGTTTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2104 CAGTGTGACTCCAACGGGGACTGCACAGATGTGGACAGGATTGTGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291918 CAGTGTGACTCCAACGGGGACTGCACAGATGTGGACAGGATTGTGGGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2154 GGGGCTTGGCACCGGTGCCATCATTGCCATCCTGCTCTGCATCATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291968 GGGGCTTGGCACCGGTGCCATCATTGCCATCCTGCTCTGCATCATCATCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2204 TGCTTA         TCCTTGTGCTGATGTTTGTGGTATGGATGAAACGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292018 TGCTTAGTG...TAGTCCTTGTGCTGATGTTTGTGGTATGGATGAAACGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2245 CGGGATAAAGAACGCCAGGCCAAACAACTTTTAATTGATCCAGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293975 CGGGATAAAGAACGCCAGGCCAAACAACTTTTAATTGATCCAGAAGATGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2295 TGTAAGAGATAATATTTTAAAATATGATGAAGAAGGTGGAGGAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294025 TGTAAGAGATAATATTTTAAAATATGATGAAGAAGGTGGAGGAGAAGAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2345 ACCAG         GACTATGACTTGAGCCAGCTGCAGCAGCCTGACACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294075 ACCAGGTG...CAGGACTATGACTTGAGCCAGCTGCAGCAGCCTGACACT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2386 GTGGAGCCTGATGCCATCAAGCCTGTGGGAATCCGACGAATGGATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 313538 GTGGAGCCTGATGCCATCAAGCCTGTGGGAATCCGACGAATGGATGAAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2436 ACCCATCCACGCCGAGCCCCAGTATCCGGTCCGATCTGCAGCCCCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 313588 ACCCATCCACGCCGAGCCCCAGTATCCGGTCCGATCTGCAGCCCCACACC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2486 CTGGAGACATTGGGGACTTCATTAATGAG         GGCCTTAAAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 313638 CTGGAGACATTGGGGACTTCATTAATGAGGTA...CAGGGCCTTAAAGCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2527 GCTGACAATGACCCCACAGCTCCACCATATGACTCCCTGTTAGTGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324676 GCTGACAATGACCCCACAGCTCCACCATATGACTCCCTGTTAGTGTTTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2577 CTATGAAGGCAGTGGCTCCACTGCTGGGTCCTTGAGCTCCCTTAATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324726 CTATGAAGGCAGTGGCTCCACTGCTGGGTCCTTGAGCTCCCTTAATTCCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2627 CAAGTAGTGGTGGTGAGCAGGACTATGATTACCTGAACGACTGGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324776 CAAGTAGTGGTGGTGAGCAGGACTATGATTACCTGAACGACTGGGGGCCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :
   2677 CGGTTCAAGAAACTTGCTGACATGTATGGTGGAGGTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 324826 CGGTTCAAGAAACTTGCTGACATGTATGGTGGAGGTGATGAC