seq1 = pF1KB4699.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KB4699/gi568815591r_112983612.tfa (gi568815591r:112983612_113184721), 201110 bp

>pF1KB4699 1110
>gi568815591r:112983612_113184721 (Chr7)

(complement)

1-1110  (100001-101110)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAACTATAGCCATGCAGCTGACAACATTTTGCAAAATCTCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAACTATAGCCATGCAGCTGACAACATTTTGCAAAATCTCTCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTAACAGCCTTTCTGAAACTGACTTCCTTGGGTTTCATAATAGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTAACAGCCTTTCTGAAACTGACTTCCTTGGGTTTCATAATAGGAGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGGTGGGCAACCTCCTGATCTCCATTTTGCTAGTGAAAGATAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGGTGGGCAACCTCCTGATCTCCATTTTGCTAGTGAAAGATAAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCATAGAGCACCTTACTACTTCCTGTTGGATCTTTGCTGTTCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGCATAGAGCACCTTACTACTTCCTGTTGGATCTTTGCTGTTCAGATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCAGATCTGCAATTTGTTTCCCATTTGTGTTCAACTCTGTCAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCAGATCTGCAATTTGTTTCCCATTTGTGTTCAACTCTGTCAAAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTCTACCTGGACTTATGGGACTCTGACTTGCAAAGTGATTGCCTTTCTG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTCTACCTGGACTTATGGGACTCTGACTTGCAAAGTGATTGCCTTTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGTTTTGTCCTGTTTCCACACTGCTTTCATGCTCTTCTGCATCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGTTTTGTCCTGTTTCCACACTGCTTTCATGCTCTTCTGCATCAGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCAGATACTTAGCTATCGCCCATCACCGCTTCTATACAAAGAGGCTGA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCAGATATTTAGCTATCGCCCATCACCGCTTCTATACAAAGAGGCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTTTGGACGTGTCTGGCTGTGATCTGTATGGTGTGGACTCTGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTTTGGACGTGTCTGGCTGTGATCTGTATGGTGTGGACTCTGTCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCATGGCATTTCCCCCGGTTTTAGACGTGGGCACTTACTCATTCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCATGGCATTTCCCCCGGTTTTAGACGTGGGCACTTACTCATTCATTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGGAAGATCAATGCACCTTCCAACACCGCTCCTTCAGGGCTAATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGGAAGATCAATGCACCTTCCAACACCGCTCCTTCAGGGCTAATGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTTAGGATTTATGCTGCTTCTTGCTCTCATCCTCCTAGCCACACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTTAGGATTTATGCTGCTTCTTGCTCTCATCCTCCTAGCCACACAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTCTACCTCAAGCTGATATTTTTCGTCCACGATCGAAGAAAAATGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTCTACCTCAAGCTGATATTTTTCGTCCACGATCGAAGAAAAATGAAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGTCCAGTTTGTAGCAGCAGTCAGCCAGAACTGGACTTTTCATGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGTCCAGTTTGTAGCAGCAGTCAGCCAGAACTGGACTTTTCATGGTCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAGCCAGTGGCCAGGCAGCTGCCAATTGGCTAGCAGGATTTGGAAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAGCCAGTGGCCAGGCAGCTGCCAATTGGCTAGCAGGATTTGGAAGGGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCACACCACCCACCTTGCTGGGCATCAGGCAAAATGCAAACACCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCACACCACCCACCTTGCTGGGCATCAGGCAAAATGCAAACACCACAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGAAGAAGGCTATTGGTCTTAGACGAGTTCAAAATGGAGAAAAGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGAAGAAGGCTATTGGTCTTAGACGAGTTCAAAATGGAGAAAAGAATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCAGAATGTTCTATATAATGACTTTTCTGTTTCTAACCTTGTGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCAGAATGTTCTATATAATGACTTTTCTGTTTCTAACCTTGTGGGGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACCTGGTGGCCTGTTATTGGAGAGTTTTTGCAAGAGGGCCTGTAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACCTGGTGGCCTGTTATTGGAGAGTTTTTGCAAGAGGGCCTGTAGTACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGGGGGATTTCTAACAGCTGCTGTCTGGATGAGTTTTGCCCAAGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGGGGGATTTCTAACAGCTGCTGTCTGGATGAGTTTTGCCCAAGCAGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCAATCCTTTTGTCTGCATTTTCTCAAACAGGGAGCTGAGGCGCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCAATCCTTTTGTCTGCATTTTCTCAAACAGGGAGCTGAGGCGCTGTTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGCACAACCCTTCTTTACTGCAGAAAATCCAGGTTACCAAGGGAACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGCACAACCCTTCTTTACTGCAGAAAATCCAGGTTACCAAGGGAACCTTA

   1100     .    :
   1101 CTGTGTTATA
        ||||||||||
 101101 CTGTGTTATA