seq1 = pF1KB4667.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB4667/gi568815576f_22995696.tfa (gi568815576f:22995696_23223428), 227733 bp

>pF1KB4667 1065
>gi568815576f:22995696_23223428 (Chr22)

1-723  (100001-100723)   99% ->
724-1065  (127392-127733)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGATGTCGGCAAAGCTCAGAGGAAAAAGAAGCAGCCCGGCGGTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGATGTCGGCAAAGCTCAGAGGAAAAAGAAGCAGCCCGGCGGTCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGAATTGACCGCCACCTGCGCTCAGAGAGCCAGCGGCAACGCCGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGAATTGACCGCCACCTGCGCTCAGAGAGCCAGCGGCAACGCCGCGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGCTGCTCCTGCTGGGCACCAGCAACTCAGGCAAGAGCACCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGCTGCTCCTGCTGGGCACCAGCAACTCAGGCAAGAGCACCATCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAACAGATGAAGATCATCCACAGCGGCGGCTTCAACCTGGAGGCCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAACAGATGAAGATCATCCACAGCGGCGGCTTCAACCTGGAGGCCTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGTACAAGCCCCTCATCATCTACAATGCCATCGACTCGCTGACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGTACAAGCCCCTCATCATCTACAATGCCATCGACTCGCTGACCCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCCGGGCCCTGGCCGCCCTCAGGATCGACTTCCACAACCCCGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCCGGGCCCTGGCCGCCCTCAGGATCGACTTCCACAACCCCGACCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTACGATGCTGTGCAGCTCTTTGCGCTGACGGGCCCCGCTGAGAGCAA
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTACGACGCTGTGCAGCTCTTTGCGCTGACGGGCCCCGCTGAGAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCGAGATCACACCCGAGCTGCTGGGTGTCATGCGACGGCTCTGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCGAGATCACACCCGAGCTGCTGGGTGTCATGCGACGGCTCTGGGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCAGGGGCACAGGCCTGCTTCAGCCGCTCCAGCGAGTACCACCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCAGGGGCACAGGCCTGCTTCAGCCGCTCCAGCGAGTACCACCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACAACGCGGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGCATCGCCGCAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACAACGCGGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGCATCGCCGCAGCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTATATCCCCACTGTCGAGGACATCCTGCGCTCCCGGGACATGACCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTATATCCCCACTGTCGAGGACATCCTGCGCTCCCGGGACATGACCACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATTGTGGAGAACAAGTTCACCTTCAAGGAGCTCACCTTCAAGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCATTGTGGAGAACAAGTTCACCTTCAAGGAGCTCACCTTCAAGATGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACGTGGGGGGGCAGAGGTCAGAGCGCAAAAAGTGGATCCACTGCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACGTGGGGGGGCAGAGGTCAGAGCGCAAAAAGTGGATCCACTGCTTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGCGTCACAGCCATCATCTTCTGTGTGGAGCTCAGCGGCTACGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGCGTCACAGCCATCATCTTCTGTGTGGAGCTCAGCGGCTACGACCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACTCTACGAGGATAACCAGACA         AGTCGGATGGCAGAGAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100701 AACTCTACGAGGATAACCAGACAGTA...CAGAGTCGGATGGCAGAGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTGCGCCTCTTTGACTCCATCTGCAACAACAACTGGTTCATCAACACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127410 TTGCGCCTCTTTGACTCCATCTGCAACAACAACTGGTTCATCAACACCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACTCATCCTCTTCCTGAACAAGAAGGACCTGCTGGCAGAGAAGATCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127460 ACTCATCCTCTTCCTGAACAAGAAGGACCTGCTGGCAGAGAAGATCCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCATCCCGCTCACCATCTGCTTTCCCGAGTACAAGGGCCAGAACACGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127510 GCATCCCGCTCACCATCTGCTTTCCCGAGTACAAGGGCCAGAACACGTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGGAGGCCGCTGTCTACATCCAGCGGCAGTTTGAAGACCTGAACCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127560 GAGGAGGCCGCTGTCTACATCCAGCGGCAGTTTGAAGACCTGAACCGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAAGGAGACCAAGGAGATCTACTCCCACTTCACCTGCGCCACCGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127610 CAAGGAGACCAAGGAGATCTACTCCCACTTCACCTGCGCCACCGACACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTAACATCCAGTTTGTCTTCGACGCGGTGACAGACGTCATCATACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127660 GTAACATCCAGTTTGTCTTCGACGCGGTGACAGACGTCATCATACAGAAC

   1050     .    :    .    :
   1042 AATCTCAAGTACATTGGCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||
 127710 AATCTCAAGTACATTGGCCTTTGC