seq1 = pF1KB4658.tfa, 2418 bp
seq2 = pF1KB4658/gi568815576r_38012164.tfa (gi568815576r:38012164_38269426), 257263 bp

>pF1KB4658 2418
>gi568815576r:38012164_38269426 (Chr22)

(complement)

1-209  (100001-100209)   100% ->
210-425  (123774-123989)   100% ->
426-609  (126139-126322)   100% ->
610-797  (129258-129445)   100% ->
798-894  (134343-134439)   100% ->
895-1077  (136414-136596)   100% ->
1078-1186  (139865-139973)   100% ->
1187-1348  (140997-141158)   100% ->
1349-1427  (142978-143056)   100% ->
1428-1591  (146169-146332)   100% ->
1592-1742  (148518-148668)   100% ->
1743-1879  (153216-153352)   100% ->
1880-2034  (153746-153900)   100% ->
2035-2202  (155773-155940)   100% ->
2203-2276  (156850-156923)   100% ->
2277-2418  (157122-157263)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTTCTTTGGCCGCCTGGTCAATACCTTCAGTGGCGTCACCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTTCTTTGGCCGCCTGGTCAATACCTTCAGTGGCGTCACCAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCTCTAACCCATTCCGGGTGAAGGAGGTGGCTGTGGCCGACTACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCTCTAACCCATTCCGGGTGAAGGAGGTGGCTGTGGCCGACTACACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGAGTGACCGAGTTCGGGAGGAAGGGCAGCTGATTCTGTTCCAGAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGAGTGACCGAGTTCGGGAGGAAGGGCAGCTGATTCTGTTCCAGAACACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAACCGCACCTGGGACTGCGTCCTGGTCAACCCCAGGAACTCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAACCGCACCTGGGACTGCGTCCTGGTCAACCCCAGGAACTCACAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGATTCCG         ACTCTTCCAGCTGGAGTTGGAGGCTGACGCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGATTCCGGTG...CAGACTCTTCCAGCTGGAGTTGGAGGCTGACGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGTGAATTTCCATCAGTATTCTTCCCAGCTGCTACCCTTCTATGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123806 TAGTGAATTTCCATCAGTATTCTTCCCAGCTGCTACCCTTCTATGAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCCCTCAGGTCCTGCACACTGAGGTCCTGCAGCACCTGACCGACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123856 TCCCCTCAGGTCCTGCACACTGAGGTCCTGCAGCACCTGACCGACCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGTAACCACCCCAGCTGGTCAGTGGCCCACCTGGCTGTGGAGCTAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123906 CCGTAACCACCCCAGCTGGTCAGTGGCCCACCTGGCTGTGGAGCTAGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCGCGAGTGCTTCCATCACAGCCGTATCATCAG         CTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 123956 TCCGCGAGTGCTTCCATCACAGCCGTATCATCAGGTG...CAGCTGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATTGCGCGGAGAACGAGGAGGGCTGCACACCCCTGCACCTGGCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126146 AATTGCGCGGAGAACGAGGAGGGCTGCACACCCCTGCACCTGGCCTGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGGGTGATGGGGAGATCCTGGTGGAGCTGGTGCAGTACTGCCACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126196 CAAGGGTGATGGGGAGATCCTGGTGGAGCTGGTGCAGTACTGCCACACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATGGATGTCACCGACTACAAGGGAGAGACCGTCTTCCATTATGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126246 AGATGGATGTCACCGACTACAAGGGAGAGACCGTCTTCCATTATGCTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAGGGTGACAATTCTCAGGTGCTGCAG         CTCCTTGGAAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 126296 CAGGGTGACAATTCTCAGGTGCTGCAGGTG...CAGCTCCTTGGAAGGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCAGTGGCTGGCCTGAACCAGGTGAATAACCAAGGGCTGACCCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129272 CGCAGTGGCTGGCCTGAACCAGGTGAATAACCAAGGGCTGACCCCGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACCTGGCCTGCCAGCTGGGGAAGCAGGAGATGGTCCGCGTGCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129322 ACCTGGCCTGCCAGCTGGGGAAGCAGGAGATGGTCCGCGTGCTGCTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGCAATGCTCGGTGCAACATCATGGGCCCCAACGGCTACCCCATCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129372 TGCAATGCTCGGTGCAACATCATGGGCCCCAACGGCTACCCCATCCACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCCATGAAGTTCTCTCAGAAGGG         GTGTGCGGAGATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 129422 GGCCATGAAGTTCTCTCAGAAGGGGTA...CAGGTGTGCGGAGATGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCAGCATGGACAGCAGCCAGATCCACAGCAAAGACCCCCGTTACGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134360 TCAGCATGGACAGCAGCCAGATCCACAGCAAAGACCCCCGTTACGGAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCCCCCTCCACTGGGCCAAGAACGCAGAG         ATGGCCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 134410 AGCCCCCTCCACTGGGCCAAGAACGCAGAGGTG...CAGATGGCCCGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTGCTGAAACGGGGCTGCAACGTGAACAGCACCAGCTCCGCGGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136425 GCTGCTGAAACGGGGCTGCAACGTGAACAGCACCAGCTCCGCGGGGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGGCCCTGCACGTGGCGGTGATGCGCAACCGCTTCGACTGTGCCATAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136475 CGGCCCTGCACGTGGCGGTGATGCGCAACCGCTTCGACTGTGCCATAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGCTGACCCACGGGGCCAACGCGGATGCCCGCGGAGAGCACGGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136525 CTGCTGACCCACGGGGCCAACGCGGATGCCCGCGGAGAGCACGGCAACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCCGCTGCACCTGGCCATGTCG         AAAGACAACGTGGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136575 CCCGCTGCACCTGGCCATGTCGGTG...CAGAAAGACAACGTGGAGATGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCAAGGCCCTCATCGTGTTCGGAGCAGAAGTGGACACCCCGAATGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139884 TCAAGGCCCTCATCGTGTTCGGAGCAGAAGTGGACACCCCGAATGACTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGGGAGACTCCTACATTCCTAGCCTCCAAAATCGGCAGAC         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 139934 GGGGAGACTCCTACATTCCTAGCCTCCAAAATCGGCAGACGTA...AAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGTCACCAGGAAGGCGATCTTGACTCTGCTGAGAACCGTGGGGGCCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140998 TGTCACCAGGAAGGCGATCTTGACTCTGCTGAGAACCGTGGGGGCCGAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACTGCTTCCCACCCATCCACGGGGTCCCCGCGGAGCAGGGCTCTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141048 ACTGCTTCCCACCCATCCACGGGGTCCCCGCGGAGCAGGGCTCTGCAGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCACATCATCCCTTCTCCCTGGAAAGAGCTCAGCCCCCACCGATCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141098 CCACATCATCCCTTCTCCCTGGAAAGAGCTCAGCCCCCACCGATCAGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AAACAACCTAG         AACTACAGGATCTCATGCACATCTCACGGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 141148 AAACAACCTAGGTA...CAGAACTACAGGATCTCATGCACATCTCACGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCCGGAAGCCAGCGTTCATCCTGGGCTCCATGAGGGACGAGAAGCGGAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 143008 CCCGGAAGCCAGCGTTCATCCTGGGCTCCATGAGGGACGAGAAGCGGACG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1428         CCACGACCACCTGCTGTGCCTGGATGGAGGAGGAGTGAAAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143058 TA...CAGCCACGACCACCTGCTGTGCCTGGATGGAGGAGGAGTGAAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCTCATCATCATCCAGCTCCTCATCGCCATCGAGAAGGCCTCGGGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146211 CCTCATCATCATCCAGCTCCTCATCGCCATCGAGAAGGCCTCGGGTGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCACCAAGGACCTGTTTGACTGGGTGGCGGGCACCAGCACTGGAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146261 CCACCAAGGACCTGTTTGACTGGGTGGCGGGCACCAGCACTGGAGGCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CTGGCCCTGGCCATTCTGCACA         GTAAGTCCATGGCCTACAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 146311 CTGGCCCTGGCCATTCTGCACAGTG...TAGGTAAGTCCATGGCCTACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCGCGGCATGTACTTTCGCATGAAGGATGAGGTGTTCCGGGGCTCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148537 GCGCGGCATGTACTTTCGCATGAAGGATGAGGTGTTCCGGGGCTCCAGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCTACGAGTCGGGGCCCCTGGAGGAGTTCCTGAAGCGGGAGTTTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148587 CCTACGAGTCGGGGCCCCTGGAGGAGTTCCTGAAGCGGGAGTTTGGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CACACCAAGATGACGGACGTCAGGAAACCCAA         GGTGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 148637 CACACCAAGATGACGGACGTCAGGAAACCCAAGTA...CAGGGTGATGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GACAGGGACACTGTCTGACCGGCAGCCGGCTGAACTCCACCTCTTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153225 GACAGGGACACTGTCTGACCGGCAGCCGGCTGAACTCCACCTCTTCCGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ACTACGATGCTCCAGAAACTGTCCGGGAGCCTCGTTTCAACCAGAACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153275 ACTACGATGCTCCAGAAACTGTCCGGGAGCCTCGTTTCAACCAGAACGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AACCTCAGGCCTCCAGCTCAGCCCTCAG         ACCAGCTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 153325 AACCTCAGGCCTCCAGCTCAGCCCTCAGGTT...TAGACCAGCTGGTGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GCGGGCGGCCCGAAGCAGCGGGGCAGCTCCTACTTACTTCCGACCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153759 GCGGGCGGCCCGAAGCAGCGGGGCAGCTCCTACTTACTTCCGACCCAATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GGCGCTTCCTGGACGGTGGGCTGCTGGCCAACAACCCCACGCTGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153809 GGCGCTTCCTGGACGGTGGGCTGCTGGCCAACAACCCCACGCTGGATGCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 ATGACCGAGATCCATGAGTACAATCAGGACCTGATCCGCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 153859 ATGACCGAGATCCATGAGTACAATCAGGACCTGATCCGCAAGGTG...CA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2035  GGTCAGGCCAACAAGGTGAAGAAACTCTCCATCGTTGTCTCCCTGGGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155772 GGGTCAGGCCAACAAGGTGAAGAAACTCTCCATCGTTGTCTCCCTGGGGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CAGGGAGGTCCCCACAAGTGCCTGTGACCTGTGTGGATGTCTTCCGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155822 CAGGGAGGTCCCCACAAGTGCCTGTGACCTGTGTGGATGTCTTCCGTCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AGCAACCCCTGGGAGCTGGCCAAGACTGTTTTTGGGGCCAAGGAACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155872 AGCAACCCCTGGGAGCTGGCCAAGACTGTTTTTGGGGCCAAGGAACTGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CAAGATGGTGGTGGACTGT         TGCACGGATCCAGACGGGCGGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 155922 CAAGATGGTGGTGGACTGTGTG...CAGTGCACGGATCCAGACGGGCGGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CTGTGGACCGGGCACGGGCCTGGTGCGAGATGGTCGGCATCCAGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156872 CTGTGGACCGGGCACGGGCCTGGTGCGAGATGGTCGGCATCCAGTACTTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 AG         ATTGAACCCCCAGCTGGGGACGGACATCATGCTGGATGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156922 AGGTG...CAGATTGAACCCCCAGCTGGGGACGGACATCATGCTGGATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GGTCAGTGACACAGTGCTGGTCAACGCCCTCTGGGAGACCGAGGTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157161 GGTCAGTGACACAGTGCTGGTCAACGCCCTCTGGGAGACCGAGGTCTACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TCTATGAGCACCGCGAGGAGTTCCAGAAGCTCATCCAGCTGCTGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157211 TCTATGAGCACCGCGAGGAGTTCCAGAAGCTCATCCAGCTGCTGCTCTCA

   2550 
   2416 CCC
        |||
 157261 CCC