seq1 = pF1KB4636.tfa, 3378 bp
seq2 = pF1KB4636/gi568815592r_31539134.tfa (gi568815592r:31539134_31751763), 212630 bp

>pF1KB4636 3378
>gi568815592r:31539134_31751763 (Chr6)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-226  (102137-102254)   100% ->
227-423  (102369-102565)   100% ->
424-477  (102800-102853)   100% ->
478-552  (103013-103087)   100% ->
553-788  (103938-104173)   100% ->
789-918  (105241-105370)   100% ->
919-1116  (106160-106357)   100% ->
1117-1369  (106566-106818)   100% ->
1370-1447  (107162-107239)   100% ->
1448-1560  (107570-107682)   100% ->
1561-1648  (107787-107874)   100% ->
1649-1935  (108649-108935)   100% ->
1936-2227  (109361-109652)   100% ->
2228-2397  (109819-109988)   100% ->
2398-2451  (110172-110225)   100% ->
2452-2554  (110342-110444)   100% ->
2555-2679  (110536-110660)   100% ->
2680-2826  (110826-110972)   100% ->
2827-2886  (111060-111119)   100% ->
2887-3030  (111236-111379)   100% ->
3031-3138  (111458-111565)   100% ->
3139-3285  (112118-112264)   100% ->
3286-3378  (112538-112630)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCTAATGATAGTACCAGTACCGCTGTGGAGGAGCCTGACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCTAATGATAGTACCAGTACCGCTGTGGAGGAGCCTGACAGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGTGTTGGTGAAGACCTTGGACTCTCAAACTCGTACCTTTATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGTGTTGGTGAAGACCTTGGACTCTCAAACTCGTACCTTTATTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCCCAG         ATGAATGTAAAAGAGTTTAAGGAGCACATTGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCCCAGGTG...CAGATGAATGTAAAAGAGTTTAAGGAGCACATTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTCTGTCAGCATCCCATCTGAAAAACAACGGCTCATTTACCAGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102170 GCCTCTGTCAGCATCCCATCTGAAAAACAACGGCTCATTTACCAGGGACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTTCTGCAAGATGATAAGAAGCTTCAGGAATACA         ATGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102220 AGTTCTGCAAGATGATAAGAAGCTTCAGGAATACAGTA...CAGATGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGGAAAGGTTATCCACCTGGTGGAACGGGCTCCTCCTCAGACTCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102375 GGGGAAAGGTTATCCACCTGGTGGAACGGGCTCCTCCTCAGACTCACCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTTCTGGGGCATCTTCTGGGACGGGGTCTGCCTCAGCCACTCATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102425 CCTTCTGGGGCATCTTCTGGGACGGGGTCTGCCTCAGCCACTCATGGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGATCCCCCCCTGGTACTCGGGGGCCTGGGGCCTCTGTTCATGACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102475 GGGATCCCCCCCTGGTACTCGGGGGCCTGGGGCCTCTGTTCATGACCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGCCAACAGCTATGTCATGGTTGGAACCTTCAATCTTCCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102525 ATGCCAACAGCTATGTCATGGTTGGAACCTTCAATCTTCCTGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTGACGGCTCTGCTGTGGATGTTCACATCAACATGGAACAGGCCCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102800 AGTGACGGCTCTGCTGTGGATGTTCACATCAACATGGAACAGGCCCCGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAG         AGTGAGCCCCGGGTACGGCTGGTGATGGCTCAGCACA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 TCAGGTA...TAGAGTGAGCCCCGGGTACGGCTGGTGATGGCTCAGCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATCAGGGATATACAGACCTTACTATCCCGGATGGAG         TGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103050 TGATCAGGGATATACAGACCTTACTATCCCGGATGGAGGTA...CAGTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CGAGGAGGGCCCCAACCGCAGCACAGTCAGCCGCCCCCGCAGCCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103941 CGAGGAGGGCCCCAACCGCAGCACAGTCAGCCGCCCCCGCAGCCACCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGACCCCGGAGCCAGTAGCCTTGAGCTCTCAAACATCAGAACCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103991 TGTGACCCCGGAGCCAGTAGCCTTGAGCTCTCAAACATCAGAACCAGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAAGTGAAGCACCTCCCCGGGAGCCCATGGAGGCAGAAGAAGTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104041 AAAGTGAAGCACCTCCCCGGGAGCCCATGGAGGCAGAAGAAGTGGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGTGCCCCAGCCCAGAACCCGGAGCTCACTCCTGGCCCAGCCCCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104091 CGTGCCCCAGCCCAGAACCCGGAGCTCACTCCTGGCCCAGCCCCAGCGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCCAACACCTGCCCCGGAAACAAATGCACCCAA         CCATCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104141 CCCAACACCTGCCCCGGAAACAAATGCACCCAAGTG...CAGCCATCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCCCTGCGGAGTATGTCGAGGTGCTCCAGGAGCTACAGCGGCTGGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105249 CCCCTGCGGAGTATGTCGAGGTGCTCCAGGAGCTACAGCGGCTGGAGAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGCCTCCAGCCCTTCTTGCAGCGCTACTACGAGGTTCTGGGTGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105299 CGCCTCCAGCCCTTCTTGCAGCGCTACTACGAGGTTCTGGGTGCTGCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACCACGGACTACAATAACAAT         CACGAGGGCCGGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105349 CACCACGGACTACAATAACAATGTG...CAGCACGAGGGCCGGGAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATCAGCGGTTGATCAACTTGGTAGGGGAGAGCCTGCGACTGCTGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106179 ATCAGCGGTTGATCAACTTGGTAGGGGAGAGCCTGCGACTGCTGGGCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCTTTGTTGCACTGTCTGACCTGCGCTGCAATCTGGCCTGCACGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106229 ACCTTTGTTGCACTGTCTGACCTGCGCTGCAATCTGGCCTGCACGCCCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACGACACCTGCATGTGGTCCGGCCTATGTCTCACTACACCACCCCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106279 ACGACACCTGCATGTGGTCCGGCCTATGTCTCACTACACCACCCCCATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGCTCCAGCAGGCAGCCATTCCCATACAG         ATCAATGTGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106329 TGCTCCAGCAGGCAGCCATTCCCATACAGGTG...CAGATCAATGTGGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACCACTGTGACCATGACAGGAAATGGGACTCGGCCCCCCCCAACTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106578 ACCACTGTGACCATGACAGGAAATGGGACTCGGCCCCCCCCAACTCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGCAGAGGCACCTCCCCCTGGTCCTGGGCAGGCCTCATCCGTGGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106628 TGCAGAGGCACCTCCCCCTGGTCCTGGGCAGGCCTCATCCGTGGCTCCGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTTCTACCAATGTCGAGTCCTCAGCTGAGGGGGCTCCCCCGCCAGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106678 CTTCTACCAATGTCGAGTCCTCAGCTGAGGGGGCTCCCCCGCCAGGTCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTCCCCCGCCAGCCACCAGCCACCCGAGGGTCATCCGGATTTCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106728 GCTCCCCCGCCAGCCACCAGCCACCCGAGGGTCATCCGGATTTCCCACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAGTGTGGAACCCGTGGTCATGATGCACATGAACATTCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106778 GAGTGTGGAACCCGTGGTCATGATGCACATGAACATTCAAGGTG...CAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ATTCTGGCACACAGCCTGGTGGTGTTCCGAGTGCTCCCACTGGCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107162 ATTCTGGCACACAGCCTGGTGGTGTTCCGAGTGCTCCCACTGGCCCCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGACCCCCTGGTCATGGCCAAACCCTGG         GACAGCAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 107212 GGACCCCCTGGTCATGGCCAAACCCTGGGTA...CAGGACAGCAGGTGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGGCTTCCCAACAGCTCCAACCCGGGTGGTGATTGCCCGGCCCACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107583 AGGCTTCCCAACAGCTCCAACCCGGGTGGTGATTGCCCGGCCCACTCCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CACAGGCTCGGCCTTCCCATCCTGGAGGGCCCCCAGTCTCTGGGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107633 CACAGGCTCGGCCTTCCCATCCTGGAGGGCCCCCAGTCTCTGGGACACTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561          CAGGGCGCCGGTCTGGGTACCAATGCCTCGTTGGCCCAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107683 GTG...CAGCAGGGCGCCGGTCTGGGTACCAATGCCTCGTTGGCCCAGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGTGAGCGGCCTTGTGGGGCAGCTTCTTATGCAGCCAGTCCTTGTGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107828 GGTGAGCGGCCTTGTGGGGCAGCTTCTTATGCAGCCAGTCCTTGTGGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1649       CTCAGGGGACCCCAGGTATGGCTCCACCGCCAGCCCCTGCCACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107878 ...CAGCTCAGGGGACCCCAGGTATGGCTCCACCGCCAGCCCCTGCCACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCTTCTGCCAGTGCTGGCACCACCAACACAGCTACCACAGCTGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108693 GCTTCTGCCAGTGCTGGCACCACCAACACAGCTACCACAGCTGGCCCCGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TCCTGGGGGGCCTGCCCAGCCTCCACCCACCCCTCAACCCTCCATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108743 TCCTGGGGGGCCTGCCCAGCCTCCACCCACCCCTCAACCCTCCATGGCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ATCTTCAGTTCTCTCAGCTTCTGGGGAACCTGCTAGGGCCTGCAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108793 ATCTTCAGTTCTCTCAGCTTCTGGGGAACCTGCTAGGGCCTGCAGGGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GGGGCTGGAGGGTCTGGTGTGGCTTCTCCCACCATCACTGTGGCGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108843 GGGGCTGGAGGGTCTGGTGTGGCTTCTCCCACCATCACTGTGGCGATGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGGTGTCCCTGCCTTTCTCCAAGGCATGACTGACTTCTTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108893 TGGTGTCCCTGCCTTTCTCCAAGGCATGACTGACTTCTTGCAGGTG...C

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1936   GCAACACAGACAGCCCCTCCACCACCCCCACCTCCTCCACCCCCACCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109359 AGGCAACACAGACAGCCCCTCCACCACCCCCACCTCCTCCACCCCCACCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CCTGCCCCAGAGCAGCAGACCATGCCCCCACCAGGCTCCCCTTCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109409 CCTGCCCCAGAGCAGCAGACCATGCCCCCACCAGGCTCCCCTTCTGGTGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CGCAGGGAGTCCTGGAGGCCTGGGTCTTGAGAGCCTGTCACCGGAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109459 CGCAGGGAGTCCTGGAGGCCTGGGTCTTGAGAGCCTGTCACCGGAGTTTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 TTACCTCAGTGGTGCAGGGTGTGCTCAGCTCCCTGCTGGGCTCCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109509 TTACCTCAGTGGTGCAGGGTGTGCTCAGCTCCCTGCTGGGCTCCCTGGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GCTCGGGCTGGCAGCAGTGAAAGTATTGCTGCCTTCATACAACGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109559 GCTCGGGCTGGCAGCAGTGAAAGTATTGCTGCCTTCATACAACGCCTCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TGGATCCAGCAACATCTTTGAGCCTGGAGCTGATGGGGCCCTTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109609 TGGATCCAGCAACATCTTTGAGCCTGGAGCTGATGGGGCCCTTGGTG...

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2228    GATTCTTTGGGGCCTTGCTTTCTCTTCTGTGCCAGAACTTCTCTATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109816 CAGGATTCTTTGGGGCCTTGCTTTCTCTTCTGTGCCAGAACTTCTCTATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GTGGACGTAGTGATGCTTCTCCATGGGCATTTCCAGCCACTACAACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109866 GTGGACGTAGTGATGCTTCTCCATGGGCATTTCCAGCCACTACAACGGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCAGCCCCAGCTGCGATCCTTCTTCCACCAGCACTACCTGGGTGGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109916 CCAGCCCCAGCTGCGATCCTTCTTCCACCAGCACTACCTGGGTGGTCAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 AGCCCACACCCAGTAACATCCGG         ATGGCAACCCACACATTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109966 AGCCCACACCCAGTAACATCCGGGTA...CAGATGGCAACCCACACATTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 ATCACGGGGCTAGAAGAGTATGTGCGGGAGAGTTTT         TCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110190 ATCACGGGGCTAGAAGAGTATGTGCGGGAGAGTTTTGTG...CAGTCCTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GGTGCAGGTTCAGCCAGGTGTGGACATCATCCGGACAAACCTGGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110347 GGTGCAGGTTCAGCCAGGTGTGGACATCATCCGGACAAACCTGGAATTTC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TCCAAGAGCAGTTTAATAGCATTGCTGCGCATGTGCTGCATTGCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 110397 TCCAAGAGCAGTTTAATAGCATTGCTGCGCATGTGCTGCATTGCACAGGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2555        ATAGTGGATTTGGGGCCCGGTTGCTGGAGTTGTGTAACCAAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110447 C...CAGATAGTGGATTTGGGGCCCGGTTGCTGGAGTTGTGTAACCAAGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CCTGTTTGAATGCCTGGCCCTAAACCTGCACTGCTTGGGGGGACAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110579 CCTGTTTGAATGCCTGGCCCTAAACCTGCACTGCTTGGGGGGACAGCAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TGGAGCTTGCTGCTGTTATCAATGGCCGAATT         CGTCGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110629 TGGAGCTTGCTGCTGTTATCAATGGCCGAATTGTA...CAGCGTCGTATG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 TCTCGTGGGGTGAATCCCTCCTTGGTGAGCTGGCTGACCACTATGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110835 TCTCGTGGGGTGAATCCCTCCTTGGTGAGCTGGCTGACCACTATGATGGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 ACTGAGGCTTCAGGTGGTACTGGAGCACATGCCTGTAGGCCCTGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110885 ACTGAGGCTTCAGGTGGTACTGGAGCACATGCCTGTAGGCCCTGATGCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 TTCTCAGATACGTTCGCAGGGTTGGTGATCCCCCCCAG         CCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 110935 TTCTCAGATACGTTCGCAGGGTTGGTGATCCCCCCCAGGTA...CAGCCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 CTTCCTGAGGAGCCAATGGAAGTTCAGGGAGCAGAAAGAGCTTCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111063 CTTCCTGAGGAGCCAATGGAAGTTCAGGGAGCAGAAAGAGCTTCCCCTGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 GCCTCAG         CGGGAGAATGCTTCCCCAGCCCCTGGAACAACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111113 GCCTCAGGTA...CAGCGGGAGAATGCTTCCCCAGCCCCTGGAACAACAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 CAGAAGAGGCCATGTCCCGAGGTCCACCTCCTGCTCCTGAGGGGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111270 CAGAAGAGGCCATGTCCCGAGGTCCACCTCCTGCTCCTGAGGGGGGCTCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 CGGGATGAACAGGATGGAGCTTCAGCTGAGACAGAACCTTGGGCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111320 CGGGATGAACAGGATGGAGCTTCAGCTGAGACAGAACCTTGGGCAGCTGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 AGTCCCCCCA         GAATGGGTCCCTATTATCCAGCAGGACATTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111370 AGTCCCCCCAGTA...CAGGAATGGGTCCCTATTATCCAGCAGGACATTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 AGAGCCAGCGGAAGGTGAAACCGCAGCCCCCTCTGAGTGATGCCTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111489 AGAGCCAGCGGAAGGTGAAACCGCAGCCCCCTCTGAGTGATGCCTACCTC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 AGTGGTATGCCTGCCAAGAGACGCAAG         ACGATGCAGGGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111539 AGTGGTATGCCTGCCAAGAGACGCAAGGTT...CAGACGATGCAGGGTGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 GGGCCCCCAGCTGCTTCTCTCAGAGGCTGTGAGCCGGGCAGCTAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112132 GGGCCCCCAGCTGCTTCTCTCAGAGGCTGTGAGCCGGGCAGCTAAGGCAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 CCGGAGCTCGGCCCCTGACGAGCCCCGAGAGCCTGAGCCGGGACCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112182 CCGGAGCTCGGCCCCTGACGAGCCCCGAGAGCCTGAGCCGGGACCTGGAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3253 GCACCAGAGGTTCAGGAGAGCTACAGGCAGCAG         CTCCGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112232 GCACCAGAGGTTCAGGAGAGCTACAGGCAGCAGGTG...TAGCTCCGGTC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3294 TGATATACAAAAACGACTGCAGGAAGACCCCAACTACAGTCCCCAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112546 TGATATACAAAAACGACTGCAGGAAGACCCCAACTACAGTCCCCAGCGCT

   3550     .    :    .    :    .    :    .
   3344 TCCCCAATGCCCAGCGGGCCTTTGCTGATGATCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112596 TCCCCAATGCCCAGCGGGCCTTTGCTGATGATCCT