seq1 = pF1KB4626.tfa, 2310 bp
seq2 = pF1KB4626/gi568815581r_29474705.tfa (gi568815581r:29474705_29689378), 214674 bp

>pF1KB4626 2310
>gi568815581r:29474705_29689378 (Chr17)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-186  (105763-105896)   100% ->
187-299  (106342-106454)   100% ->
300-405  (106576-106681)   100% ->
406-623  (107235-107452)   100% ->
624-718  (107543-107637)   100% ->
719-761  (107999-108041)   100% ->
762-788  (110391-110417)   100% ->
789-837  (110600-110648)   100% ->
838-910  (111008-111080)   100% ->
911-1008  (111637-111734)   100% ->
1009-1120  (112132-112243)   100% ->
1121-1254  (112383-112516)   100% ->
1255-1407  (112705-112857)   100% ->
1408-1638  (112929-113159)   100% ->
1639-1692  (113248-113301)   100% ->
1693-1779  (113481-113567)   100% ->
1780-1853  (113676-113749)   100% ->
1854-2036  (113909-114091)   100% ->
2037-2100  (114237-114300)   100% ->
2101-2310  (114465-114674)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGAAAGGGGCCGCGAGCGGAGGTGTGTGCGGACTGCAGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCGAAAGGGGCCGCGAGCGGAGGTGTGTGCGGACTGCAGCGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GG         ACCCTGGCTGGGCATCCATCAGCAGGGGTGTGCTGGTGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTA...CAGACCCTGGCTGGGCATCCATCAGCAGGGGTGTGCTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGACGAGTGCTGCAGCGTGCACCGGAGCCTGGGACGCCACATCTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105802 GTGACGAGTGCTGCAGCGTGCACCGGAGCCTGGGACGCCACATCTCCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCAAGCACCTTCGCCACAGCGCCTGGCCTCCCACGCTGCTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105852 GTCAAGCACCTTCGCCACAGCGCCTGGCCTCCCACGCTGCTGCAGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     ATGGTGCACACGCTTGCCAGCAACGGGGCCAACTCCATCTGGGAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105902 .CAGATGGTGCACACGCTTGCCAGCAACGGGGCCAACTCCATCTGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCCCTGCTGGACCCCGCACAAGTGCAGAGCGGCCGGCGTAAAGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106388 ACTCCCTGCTGGACCCCGCACAAGTGCAGAGCGGCCGGCGTAAAGCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCCCAAGACAAAGTCCA         CCCCATCAAGTCAGAGTTCATCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106438 CCCCAAGACAAAGTCCAGTG...CAGCCCCATCAAGTCAGAGTTCATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCCAAGTACCAGATGCTGGCATTTGTGCACAAGCTTCCCTGCCGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106600 GGCCAAGTACCAGATGCTGGCATTTGTGCACAAGCTTCCCTGCCGGGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGATGGAGTCACCGCCAAAGACCTCAGCAAG         CAACTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106650 ATGATGGAGTCACCGCCAAAGACCTCAGCAAGGTT...TAGCAACTACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGAGCGTGCGGACAGGCAACCTGGAGACATGTCTGCGCCTGCTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107244 TCGAGCGTGCGGACAGGCAACCTGGAGACATGTCTGCGCCTGCTCTCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGTGCCCAGGCCAACTTCTTCCACCCAGAGAAGGGCACCACACCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107294 GGGTGCCCAGGCCAACTTCTTCCACCCAGAGAAGGGCACCACACCTCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGTGGCTGCCAAGGCAGGACAGACACTGCAGGCCGAGCTGCTTGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107344 ACGTGGCTGCCAAGGCAGGACAGACACTGCAGGCCGAGCTGCTTGTAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATGGGGCTGACCCTGGCTCCCCTGATGTTAATGGCCGCACACCCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107394 TATGGGGCTGACCCTGGCTCCCCTGATGTTAATGGCCGCACACCCATTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTATGCCAG         GCAGGCGGGGCACCATGAGCTGGCGGAAAGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107444 CTATGCCAGGTG...CAGGCAGGCGGGGCACCATGAGCTGGCGGAAAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTTGAGTGCCAATATGAGCTCACTGACCGGCTGGCCTTCTACCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107575 TGGTTGAGTGCCAATATGAGCTCACTGACCGGCTGGCCTTCTACCTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGACGCAAGCCGG         ATCACAAGAATGGGCATTACATCATCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107625 GGACGCAAGCCGGGTG...CAGATCACAAGAATGGGCATTACATCATCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACAGATGGCTGACAG         ATCTCGGCAAAAGTGCATGTCTCAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108027 ACAGATGGCTGACAGGTG...TAGATCTCGGCAAAAGTGCATGTCTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 G         CCTTGACTTATCCGAATTGGCCAAAGCTGCTAAGAAGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110417 GGTA...CAGCCTTGACTTATCCGAATTGGCCAAAGCTGCTAAGAAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTGCAGGCG         CTCAGCAACCGGCTTTTTGAGGAACTCGCCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110640 CTGCAGGCGGTA...CAGCTCAGCAACCGGCTTTTTGAGGAACTCGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGACGTGTATGACGAGGTGGATCGAAGAGAAAATGATGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111040 GGACGTGTATGACGAGGTGGATCGAAGAGAAAATGATGCAGGTG...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TGTGGCTGGCTACCCAAAACCACAGCACTCTGGTGACAGAGCGCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111637 TGTGGCTGGCTACCCAAAACCACAGCACTCTGGTGACAGAGCGCAGTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GTGCCCTTCCTGCCTGTTAACCCGGAATACTCAGCCACGCGGAATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111687 GTGCCCTTCCTGCCTGTTAACCCGGAATACTCAGCCACGCGGAATCAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1009        GGGCGACAAAAGCTGGCCCGCTTTAATGCCCGAGAGTTTGCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111737 G...CAGGGGCGACAAAAGCTGGCCCGCTTTAATGCCCGAGAGTTTGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CCTTGATCATCGACATTCTCAGTGAGGCCAAGCGGAGACAGCAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112175 CCTTGATCATCGACATTCTCAGTGAGGCCAAGCGGAGACAGCAGGGCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AGCCTGAGCAGCCCCACAG         ACAACCTCGAGCTGTCTCTGCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 112225 AGCCTGAGCAGCCCCACAGGTG...CAGACAACCTCGAGCTGTCTCTGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GAGCCAGAGTGACCTCGACGACCAACACGACTACGACAGCGTGGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112405 GAGCCAGAGTGACCTCGACGACCAACACGACTACGACAGCGTGGCCTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 ACGAGGACACAGACCAGGAGCCCCTGCGCAGCACCGGCGCCACTCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112455 ACGAGGACACAGACCAGGAGCCCCTGCGCAGCACCGGCGCCACTCGGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AACCGGGCCCGG         AGCATGGACTCCTCGGACTTGTCTGACGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 112505 AACCGGGCCCGGGTC...CAGAGCATGGACTCCTCGGACTTGTCTGACGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 GGCTGTGACGCTGCAGGAGTACCTGGAGCTGAAGAAGGCCCTGGCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112734 GGCTGTGACGCTGCAGGAGTACCTGGAGCTGAAGAAGGCCCTGGCTACAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CGGAGGCAAAGGTGCAGCAGCTCATGAAGGTCAACAGTAGCCTGAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112784 CGGAGGCAAAGGTGCAGCAGCTCATGAAGGTCAACAGTAGCCTGAGCGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAGCTCCGGAGGCTGCAGCGAGAG         ATCCACAAGCTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112834 GAGCTCCGGAGGCTGCAGCGAGAGGTG...TAGATCCACAAGCTGCAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GGAGAACCTGCAGCTCCGGCAGCCTCCAGGGCCGGTGCCCACACCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112946 GGAGAACCTGCAGCTCCGGCAGCCTCCAGGGCCGGTGCCCACACCTCCAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TCCCCAGTGAACGGGCGGAACACACACCCATGGCGCCAGGCGGGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112996 TCCCCAGTGAACGGGCGGAACACACACCCATGGCGCCAGGCGGGAGCACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CACCGCAGGGATCGCCAGGCCTTTTCCATGTATGAACCTGGCTCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113046 CACCGCAGGGATCGCCAGGCCTTTTCCATGTATGAACCTGGCTCTGCCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GAAGCCCTTTGGGGGCCCCCCTGGGGACGAGCTCACTACGCGGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113096 GAAGCCCTTTGGGGGCCCCCCTGGGGACGAGCTCACTACGCGGCTGCAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CTTTCCACAGCACT         GAGCTAGAGGACGACGCCATCTATTCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 113146 CTTTCCACAGCACTGTG...CAGGAGCTAGAGGACGACGCCATCTATTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GTGCACGTCCCTGCTGGCCTTTACCGG         ATCCGGAAAGGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 113275 GTGCACGTCCCTGCTGGCCTTTACCGGGTA...CAGATCCGGAAAGGGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GTCTGCCTCAGCTGTGCCCTTCACTCCCTCCTCCCCGCTGCTGTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113495 GTCTGCCTCAGCTGTGCCCTTCACTCCCTCCTCCCCGCTGCTGTCCTGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 CCCAGGAGGGAAGCCGCCACACG         AGCAAGCTTTCCCGCCAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113545 CCCAGGAGGGAAGCCGCCACACGGTA...CAGAGCAAGCTTTCCCGCCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 GGCAGTGGAGCCGACAGTGACTATGAGAACACGCAAAGTGGGGACCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113694 GGCAGTGGAGCCGACAGTGACTATGAGAACACGCAAAGTGGGGACCCACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GCTGGG         GCTGGAAGGGAAGAGGTTTCTAGAGCTGGGCAAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113744 GCTGGGGTG...CAGGCTGGAAGGGAAGAGGTTTCTAGAGCTGGGCAAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 AGGAAGACTTCCACCCAGAGCTGGAAAGCCTGGATGGAGACCTAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113944 AGGAAGACTTCCACCCAGAGCTGGAAAGCCTGGATGGAGACCTAGATCCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 GGGCTTCCCAGCACAGAGGATGTCATCTTGAAGACAGAGCAGGTCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113994 GGGCTTCCCAGCACAGAGGATGTCATCTTGAAGACAGAGCAGGTCACCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 GAACATTCAGGAACTGTTGCGGGCAGCCCAGGAGTTCAAGCATGACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 114044 GAACATTCAGGAACTGTTGCGGGCAGCCCAGGAGTTCAAGCATGACAGGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2037        CTTCGTGCCCTGCTCAGAGAAGATCCATTTGGCTGTGACCGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114094 A...CAGCTTCGTGCCCTGCTCAGAGAAGATCCATTTGGCTGTGACCGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 ATGGCCTCCCTCTTCCCAAAG         AGGCCAGCCCTGGAGCCAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 114280 ATGGCCTCCCTCTTCCCAAAGGTA...CAGAGGCCAGCCCTGGAGCCAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 GCGGAGCTCACTGCGGCTGCTCAACGCCAGCGCCTACCGGCTGCAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114485 GCGGAGCTCACTGCGGCTGCTCAACGCCAGCGCCTACCGGCTGCAGAGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 AGTGCCGGAAGACAGTGCCCCCAGAGCCCGGCGCCCCAGTGGACTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114535 AGTGCCGGAAGACAGTGCCCCCAGAGCCCGGCGCCCCAGTGGACTTCCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 CTGCTGACTCAGCAGGTGATCCAGTGCGCCTATGACATCGCCAAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114585 CTGCTGACTCAGCAGGTGATCCAGTGCGCCTATGACATCGCCAAGGCTGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 CAAGCAGCTGGTCACCATCACCACCCGAGAGAAGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114635 CAAGCAGCTGGTCACCATCACCACCCGAGAGAAGAAGCAG