seq1 = pF1KB4600.tfa, 918 bp
seq2 = pF1KB4600/gi568815584r_21111226.tfa (gi568815584r:21111226_21334193), 222968 bp

>pF1KB4600 918
>gi568815584r:21111226_21334193 (Chr14)

(complement)

1-241  (100001-100241)   100% ->
242-356  (103122-103236)   100% ->
357-404  (103828-103875)   100% ->
405-562  (121077-121234)   100% ->
563-676  (122271-122384)   100% ->
677-837  (122628-122788)   100% ->
838-918  (122888-122968)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCAACGTTACCAACAAGACAGATCCTCGCTCCATGAACTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCAACGTTACCAACAAGACAGATCCTCGCTCCATGAACTCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTATTCATTGGGAATCTCAACACTCTTGTGGTCAAGAAATCTGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTATTCATTGGGAATCTCAACACTCTTGTGGTCAAGAAATCTGATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCAATCTTTTCGAAGTATGGCAAAATTGTGGGCTGCTCTGTTCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCAATCTTTTCGAAGTATGGCAAAATTGTGGGCTGCTCTGTTCATAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTTGCCTTCGTTCAGTATGTTAATGAGAGAAATGCCCGGGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTTTGCCTTCGTTCAGTATGTTAATGAGAGAAATGCCCGGGCTGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCAGGAGAGGATGGCAGAATGATTGCTGGCCAGGTTTTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100201 AGCAGGAGAGGATGGCAGAATGATTGCTGGCCAGGTTTTAGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATTAACCTGGCTGCAGAGCCAAAAGTGAACCGAGGAAAAGCAGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103122 ATATTAACCTGGCTGCAGAGCCAAAAGTGAACCGAGGAAAAGCAGGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAACGATCTGCAGCGGAGATGTACGGGTCAGTAACAGAACACCCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103172 AAACGATCTGCAGCGGAGATGTACGGGTCAGTAACAGAACACCCTTCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTCCCCTCTACTCAG         CTCCTCTTTTGACTTGGACTATGACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103222 GTCCCCTCTACTCAGGTC...CAGCTCCTCTTTTGACTTGGACTATGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCAACGGGACTATTATGATAG         GATGTACAGTTACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103854 TTCAACGGGACTATTATGATAGGTA...TAGGATGTACAGTTACCCAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGTGTACCTCCTCCTCCTCCTATTGCTCGGGCTGTAGTGCCCTCGAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121096 CGTGTACCTCCTCCTCCTCCTATTGCTCGGGCTGTAGTGCCCTCGAAACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAGCGTGTATCAGGAAACACTTCACGAAGGGGCAAAAGTGGCTTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121146 TCAGCGTGTATCAGGAAACACTTCACGAAGGGGCAAAAGTGGCTTCAATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTAAGAGTGGACAGCGGGGATCTTCCAAGTCTGGAAAGT         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121196 CTAAGAGTGGACAGCGGGGATCTTCCAAGTCTGGAAAGTGTA...AAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGGAGATGACCTTCAGGCCATTAAGAAGGAGCTGACCCAGATAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122273 AAAGGAGATGACCTTCAGGCCATTAAGAAGGAGCTGACCCAGATAAAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAAGTGGATTCTCTCCTGGAAAACCTGGAAAAAATTGAAAAGGAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122323 AAAAGTGGATTCTCTCCTGGAAAACCTGGAAAAAATTGAAAAGGAACAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCAAACAAGCAG         TAGAGATGAAGAATGATAAGTCAGAAGAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122373 GCAAACAAGCAGGTA...CAGTAGAGATGAAGAATGATAAGTCAGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGCAGAGCAGCAGCTCCGTGAAGAAAGATGAGACTAATGTGAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122657 GAGCAGAGCAGCAGCTCCGTGAAGAAAGATGAGACTAATGTGAAGATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTCTGAGGGGGGTGCAGATGACTCTGCTGAGGAGGGGGACCTACTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122707 GTCTGAGGGGGGTGCAGATGACTCTGCTGAGGAGGGGGACCTACTGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGATGATAATGAAGATCGGGGGGATGACCAG         CTGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 122757 ATGATGATAATGAAGATCGGGGGGATGACCAGGTG...CAGCTGGAGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCAAGGATGATGAAAAAGAGGCTGAGGAAGGAGAGGATGACAGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122897 ATCAAGGATGATGAAAAAGAGGCTGAGGAAGGAGAGGATGACAGAGACAG

    950     .    :    .    :
    897 CGCCAATGGCGAGGATGACTCT
        ||||||||||||||||||||||
 122947 CGCCAATGGCGAGGATGACTCT