seq1 = pF1KB4592.tfa, 1803 bp
seq2 = pF1KB4592/gi568815587r_111642053.tfa (gi568815587r:111642053_111866361), 224309 bp

>pF1KB4592 1803
>gi568815587r:111642053_111866361 (Chr11)

(complement)

1-114  (100001-100114)   100% ->
115-205  (100978-101068)   100% ->
206-306  (101457-101557)   100% ->
307-539  (105311-105543)   100% ->
540-687  (106411-106558)   100% ->
688-843  (110912-111067)   100% ->
844-958  (111268-111382)   100% ->
959-1029  (111793-111863)   100% ->
1030-1164  (112785-112919)   100% ->
1165-1338  (114030-114203)   100% ->
1339-1399  (118348-118408)   100% ->
1400-1554  (122832-122986)   100% ->
1555-1697  (123697-123839)   100% ->
1698-1789  (124218-124309)   100% ->
1790-1803  (124750-124763)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGCGCATCAGAGCTCGGGACCGGCCCAGGAGCAGCGGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGCGCATCAGAGCTCGGGACCGGCCCAGGAGCAGCGGGTGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGATGATTCGCTATACCCGATCGCGGTTTTAATCGACGAGCTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGATGATTCGCTATACCCGATCGCGGTTTTAATCGACGAGCTCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAAGACGTGCAG         CTCCGACTCAACAGTATTAAGAAGTTA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAAGACGTGCAGGTA...AAGCTCCGACTCAACAGTATTAAGAAGTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAACAATTGCCCTAGCACTTGGAGTAGAAAGGACCCGAAGTGAATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101005 TCAACAATTGCCCTAGCACTTGGAGTAGAAAGGACCCGAAGTGAATTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCATTTCTTACAG         ATACAATTTATGATGAAGATGAGGTAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101055 GCCATTTCTTACAGGTA...CAGATACAATTTATGATGAAGATGAGGTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TATTAGCTCTTGCTGAGCAGCTGGGAAATTTCACTGGCCTAGTGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101484 TATTAGCTCTTGCTGAGCAGCTGGGAAATTTCACTGGCCTAGTGGGAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGACTTTGCCCACTGTCTGCTG         CCTCCTTTGGAAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101534 CCTGACTTTGCCCACTGTCTGCTGGTG...CAGCCTCCTTTGGAAAATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCAACTGTGGAAGAGACTGTTGTTCGTGACAAGGCTGTGGAGTCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105328 GGCAACTGTGGAAGAGACTGTTGTTCGTGACAAGGCTGTGGAGTCCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GACAGATCTCCCAGGAGCATACTCCTGTTGCTCTGGAAGCTTATTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105378 GACAGATCTCCCAGGAGCATACTCCTGTTGCTCTGGAAGCTTATTTTGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTCTGGTGAAACGCTTAGCAAGTGGGGATTGGTTCACCTCTCGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105428 CCTCTGGTGAAACGCTTAGCAAGTGGGGATTGGTTCACCTCTCGCACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCATGTGGTTTGTTCAGCGTTTGCTATCCCAGGGCATCAAATGCTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105478 TGCATGTGGTTTGTTCAGCGTTTGCTATCCCAGGGCATCAAATGCTGTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGCAGAAATCAGACA         GCAATTCCGTTCCTTGTGCTCAGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105528 AAGCAGAAATCAGACAGTA...CAGGCAATTCCGTTCCTTGTGCTCAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACACACCAATGGTACGACGTGCTGCTGCTTCCAAATTGGGTGAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106436 GACACACCAATGGTACGACGTGCTGCTGCTTCCAAATTGGGTGAATTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAAGTTTTGGAATTAGACAGTGTGAAAAGTGAAATTGTTCCACTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106486 AAAAGTTTTGGAATTAGACAGTGTGAAAAGTGAAATTGTTCCACTGTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTAGTCTAGCTTCAGATGAACAG         GATTCAGTGCGCCTCCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106536 CTAGTCTAGCTTCAGATGAACAGGTA...TAGGATTCAGTGCGCCTCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCTGTGGAAGCTTGTGTCAGTATTGCCCAGTTATTGTCTCAGGATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110930 GCTGTGGAAGCTTGTGTCAGTATTGCCCAGTTATTGTCTCAGGATGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAGACTTTGGTGATGCCTACACTTCGACAAGCAGCAGAAGATAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110980 TGAGACTTTGGTGATGCCTACACTTCGACAAGCAGCAGAAGATAAATCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCGCGTTCGCTATATGGTGGCTGACAGATTTTCAGAG         CTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111030 GGCGCGTTCGCTATATGGTGGCTGACAGATTTTCAGAGGTA...TAGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGAAAGCCATGGGTCCTAAAATCACCCTAAATGACCTCATCCCCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111271 CAGAAAGCCATGGGTCCTAAAATCACCCTAAATGACCTCATCCCCGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCAGAACCTACTTAAAGACTGTGAAGCTGAAGTCCGGGCAGCTGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111321 TCAGAACCTACTTAAAGACTGTGAAGCTGAAGTCCGGGCAGCTGCTGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACAAAGTAAAAG         AACTTGGTGAGAACTTGCCCATTGAAGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 111371 ACAAAGTAAAAGGTT...TAGAACTTGGTGAGAACTTGCCCATTGAAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGAGAGACCATAATTATGAATCAAATTCTGCCTTATATAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111822 AGAGAGACCATAATTATGAATCAAATTCTGCCTTATATAAAGGTA...TA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1030  GAATTAGTATCCGATACCAATCAACATGTCAAATCGGCTCTAGCTTCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112784 GGAATTAGTATCCGATACCAATCAACATGTCAAATCGGCTCTAGCTTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TAATTATGGGATTGTCTACTATTTTGGGCAAAGAAAATACCATTGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112834 TAATTATGGGATTGTCTACTATTTTGGGCAAAGAAAATACCATTGAACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTTCTACCTCTTTTCTTAGCTCAGTTAAAGGATGAG         TGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112884 CTTCTACCTCTTTTCTTAGCTCAGTTAAAGGATGAGGTG...CAGTGTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGACGTTCGTTTGAATATCATCTCCAATTTGGATTGTGTAAATGAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114035 TGACGTTCGTTTGAATATCATCTCCAATTTGGATTGTGTAAATGAAGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TTGGAATCCGTCAGCTCTCTCAGTCTCTCCTTCCTGCCATAGTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114085 TTGGAATCCGTCAGCTCTCTCAGTCTCTCCTTCCTGCCATAGTGGAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCAGAAGATGCCAAATGGAGGGTCCGCCTGGCCATCATTGAGTATATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114135 GCAGAAGATGCCAAATGGAGGGTCCGCCTGGCCATCATTGAGTATATGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCTGCTGGCAGGCCAGCTG         GGTGTGGAATTCTTTGATGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 114185 GCTGCTGGCAGGCCAGCTGGTG...TAGGGTGTGGAATTCTTTGATGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGCTGAATTCTTTATGTATGGCTTGGCTCGTGGACCATG         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 118370 AGCTGAATTCTTTATGTATGGCTTGGCTCGTGGACCATGGTG...CAGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TACGCCATCCGAGAAGCTGCCACCAACAACCTCATGAAACTAGTTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122834 TACGCCATCCGAGAAGCTGCCACCAACAACCTCATGAAACTAGTTCAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GTTTGGTACAGAGTGGGCCCAAAATACTATTGTTCCCAAAGTGTTAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122884 GTTTGGTACAGAGTGGGCCCAAAATACTATTGTTCCCAAAGTGTTAGTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TGGCAAATGATCCTAATTACTTGCATAGAATGACCACTTTATTCTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122934 TGGCAAATGATCCTAATTACTTGCATAGAATGACCACTTTATTCTGCATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AAT         GCACTGTCTGAGGCCTGTGGTCAGGAAATAACTACTAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122984 AATGTA...TAGGCACTGTCTGAGGCCTGTGGTCAGGAAATAACTACTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCAAATGCTGCCCATCGTATTAAAAATGGCAGGAGACCAAGTAGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123735 GCAAATGCTGCCCATCGTATTAAAAATGGCAGGAGACCAAGTAGCAAATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TTCGCTTCAATGTGGCCAAATCTCTACAAAAGATTGGACCAATTCTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123785 TTCGCTTCAATGTGGCCAAATCTCTACAAAAGATTGGACCAATTCTAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ACCAA         TGCTTTACAGGGAGAAGTGAAGCCAGTACTACAGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123835 ACCAAGTA...CAGTGCTTTACAGGGAGAAGTGAAGCCAGTACTACAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GTTAGGTCAAGATGAAGACATGGATGTCAAATACTTTGCACAGGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124254 GTTAGGTCAAGATGAAGACATGGATGTCAAATACTTTGCACAGGAAGCTA

   1900     .    :    .    :    .
   1784 TAAGTG         TTCTTGCATTGGCA
        ||||||>>>...>>>||||||||||||||
 124304 TAAGTGGTA...CAGTTCTTGCATTGGCA