seq1 = pF1KB4563.tfa, 2730 bp
seq2 = pF1KB4563/gi568815591f_127552374.tfa (gi568815591f:127552374_128192055), 639682 bp

>pF1KB4563 2730
>gi568815591f:127552374_128192055 (Chr7)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-228  (134240-134389)   100% ->
229-349  (142455-142575)   100% ->
350-428  (146502-146580)   100% ->
429-589  (148790-148950)   100% ->
590-681  (150062-150153)   100% ->
682-840  (150792-150950)   100% ->
841-947  (152466-152572)   100% ->
948-1038  (155184-155274)   98% ->
1039-1152  (168914-169027)   100% ->
1153-1242  (255111-255200)   100% ->
1243-1343  (291951-292051)   100% ->
1344-1454  (335529-335639)   100% ->
1455-1527  (352374-352446)   100% ->
1528-1669  (376815-376956)   100% ->
1670-1779  (438574-438683)   100% ->
1780-1968  (522129-522317)   100% ->
1969-2110  (528987-529128)   99% ->
2111-2234  (532351-532474)   100% ->
2235-2304  (533338-533407)   100% ->
2305-2418  (534565-534678)   100% ->
2419-2622  (537116-537319)   100% ->
2623-2667  (539464-539508)   100% ->
2668-2730  (539620-539682)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCTCCGCGCAGAGCGGCGGCTCCTCCGGGGGACCCGCGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCTCCGCGCAGAGCGGCGGCTCCTCCGGGGGACCCGCGGTCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGTGCAGCGGGGCATCATCAAGATG         GTCCTCTCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 CACCGTGCAGCGGGGCATCATCAAGATGGTG...TAGGTCCTCTCAGGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGCCATCATTGTCCGAGGTCAGCCTCGTGGTGGGCCTCCTCCTGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134253 GCGCCATCATTGTCCGAGGTCAGCCTCGTGGTGGGCCTCCTCCTGAGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGATCAACCTCAGCAACATTCGTGCTGGAAATCTTGCTCGCCGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134303 CAGATCAACCTCAGCAACATTCGTGCTGGAAATCTTGCTCGCCGGGCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCCACACAACCTGATGCAAAGGATACCCCTGATGAG         CCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 134353 CGCCACACAACCTGATGCAAAGGATACCCCTGATGAGGTA...CAGCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGCATTTCCAGCTCGAGAGTTCCTTCGAAAGAAGCTGATTGGGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142459 GGGCATTTCCAGCTCGAGAGTTCCTTCGAAAGAAGCTGATTGGGAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTGTTTCACGATAGAAAACAAGACTCCCCAGGGGCGAGAGTATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142509 GTCTGTTTCACGATAGAAAACAAGACTCCCCAGGGGCGAGAGTATGGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATCTACCTTGGAAAAG         ATACCAATGGGGAAAACATTGCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 142559 GATCTACCTTGGAAAAGGTG...CAGATACCAATGGGGAAAACATTGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AATCACTGGTTGCAGAGGGCTTAGCCACCCGGAGAGAAGGCATGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146526 AATCACTGGTTGCAGAGGGCTTAGCCACCCGGAGAGAAGGCATGAGAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATAA         TCCTGAGCAGAACCGGCTTTCAGAATGTGAAGAACA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146576 AATAAGTA...CAGTCCTGAGCAGAACCGGCTTTCAGAATGTGAAGAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGCAAAGGCAGCCAAGAAAGGGATGTGGAGTGAGGGGAACGGTTCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148826 AGCAAAGGCAGCCAAGAAAGGGATGTGGAGTGAGGGGAACGGTTCACATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTATCCGGGATCTCAAGTATACCATTGAAAACCCAAGGCACTTTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148876 CTATCCGGGATCTCAAGTATACCATTGAAAACCCAAGGCACTTTGTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCACACCACCAGAAGCCTGTTAATG         CTATCATCGAGCATGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 148926 TCACACCACCAGAAGCCTGTTAATGGTG...CAGCTATCATCGAGCATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCGGGACGGCAGTGTGGTCAGGGCCCTGCTCCTCCCAGATTACTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150078 GCGGGACGGCAGTGTGGTCAGGGCCCTGCTCCTCCCAGATTACTACCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTACAGTCATGCTGTCAGGCATCAAG         TGCCCAACTTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 150128 TTACAGTCATGCTGTCAGGCATCAAGGTC...TAGTGCCCAACTTTTCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGGGAAGCAGATGGCAGTGAAACTCCAGAGCCTTTTGCTGCAGAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150807 CGGGAAGCAGATGGCAGTGAAACTCCAGAGCCTTTTGCTGCAGAAGCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ATTTTTCACTGAGTCGCGACTGCTTCAGAGAGATGTTCAGATCATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150857 ATTTTTCACTGAGTCGCGACTGCTTCAGAGAGATGTTCAGATCATTCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGAGCTGCCACAACCAGAACATTCTGGGTACCATCCTTCATCCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 150907 AGAGCTGCCACAACCAGAACATTCTGGGTACCATCCTTCATCCAGTG...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841    AATGGCAACATCACAGAGCTCCTCCTGAAGGAAGGTTTCGCACGCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152463 CAGAATGGCAACATCACAGAGCTCCTCCTGAAGGAAGGTTTCGCACGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTGGACTGGTCGATTGCAGTTTACACCCGGGGCGCAGAAAAGCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152513 TGTGGACTGGTCGATTGCAGTTTACACCCGGGGCGCAGAAAAGCTGAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CGGCAGAGAG         GGTTGCCAAAGAGCGCAGGCTGAGAATATGG
        ||||||||||>>>...>>>| |||||||||||||||||||||||||||||
 152563 CGGCAGAGAGGTA...CAGGTTTGCCAAAGAGCGCAGGCTGAGAATATGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGAGACTATGTGGCTCCCACAGCTAATTTGGACCAAAAGGACAAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155215 AGAGACTATGTGGCTCCCACAGCTAATTTGGACCAAAAGGACAAGCAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGTTGCCAAG         GTGATGCAGGTTCTGAATGCTGATGCCATTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 155265 TGTTGCCAAGGTG...CAGGTGATGCAGGTTCTGAATGCTGATGCCATTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTGTGAAGCTGAACTCAGGCGATTACAAGACGATTCACCTGTCCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168945 TTGTGAAGCTGAACTCAGGCGATTACAAGACGATTCACCTGTCCAGCATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CGACCACCGAGGCTGGAGGGGGAGAACACCCAG         GATAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 168995 CGACCACCGAGGCTGGAGGGGGAGAACACCCAGGTG...TAGGATAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAAGAAACTGCGTCCCCTGTATGACATTCCTTACATGTTTGAGGCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255119 CAAGAAACTGCGTCCCCTGTATGACATTCCTTACATGTTTGAGGCCCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AATTTCTTCGAAAAAAGCTTATTGGGAAGAAG         GTCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 255169 AATTTCTTCGAAAAAAGCTTATTGGGAAGAAGGTA...CAGGTCAATGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ACGGTGGACTACATTAGACCAGCCAGCCCAGCCACAGAGACAGTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291960 ACGGTGGACTACATTAGACCAGCCAGCCCAGCCACAGAGACAGTGCCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTTTTCAGAGCGTACCTGTGCCACTGTCACCATTGGAGGAAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 292010 CTTTTCAGAGCGTACCTGTGCCACTGTCACCATTGGAGGAATGTG...CA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1344  AAACATTGCTGAGGCTCTTGTCAGCAAAGGTCTAGCCACAGTGATCAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335528 GAAACATTGCTGAGGCTCTTGTCAGCAAAGGTCTAGCCACAGTGATCAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TACCGGCAGGATGATGACCAGAGATCATCACACTACGATGAACTGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 335578 TACCGGCAGGATGATGACCAGAGATCATCACACTACGATGAACTGCTTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TGCAGAGGCCAG         AGCTATTAAGAATGGCAAAGGATTGCATA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 335628 TGCAGAGGCCAGGTA...CAGAGCTATTAAGAATGGCAAAGGATTGCATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCAAGAAGGAAGTGCCTATCCACCGTGTTGCAGATATATCTGGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 352403 GCAAGAAGGAAGTGCCTATCCACCGTGTTGCAGATATATCTGGGGTG...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1528    GATACCCAAAAAGCAAAGCAGTTCCTGCCTTTTCTTCAGCGGGCAGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376812 CAGGATACCCAAAAAGCAAAGCAGTTCCTGCCTTTTCTTCAGCGGGCAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TCGTTCTGAAGCTGTGGTGGAATACGTCTTCAGTGGTTCTCGTCTCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376862 TCGTTCTGAAGCTGTGGTGGAATACGTCTTCAGTGGTTCTCGTCTCAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCTATTTGCCAAAGGAAACTTGCCTTATCACCTTCTTGCTTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 376912 TCTATTTGCCAAAGGAAACTTGCCTTATCACCTTCTTGCTTGCAGGTA..

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670     GCATTGAATGCCCCAGAGGAGCCCGAAACCTCCCAGGCTTGGTGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376962 .CAGGCATTGAATGCCCCAGAGGAGCCCGAAACCTCCCAGGCTTGGTGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GGAAGGAGAGCCCTTCAGCGAGGAAGCTACACTTTTCACCAAGGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438620 GGAAGGAGAGCCCTTCAGCGAGGAAGCTACACTTTTCACCAAGGAACTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TGCTGCAGCGAGAG         GTGGAGGTGGAGGTGGAGAGCATGGAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 438670 TGCTGCAGCGAGAGGTA...CAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGAGCATGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 AAGGCCGGCAACTTTATCGGCTGGCTGCACATCGACGGTGCCAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 522156 AAGGCCGGCAACTTTATCGGCTGGCTGCACATCGACGGTGCCAACCTGTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 CGTCCTGCTGGTGGAGCACGCGCTCTCCAAGGTCCACTTCACCGCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 522206 CGTCCTGCTGGTGGAGCACGCGCTCTCCAAGGTCCACTTCACCGCCGAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 GCAGCTCCTACTACAAGTCCCTGCTGTCTGCCGAGGAGGCCGCAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 522256 GCAGCTCCTACTACAAGTCCCTGCTGTCTGCCGAGGAGGCCGCAAAGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AAGAAAGAGAAG         GTCTGGGCCCACTATGAGGAGCAGCCCGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 522306 AAGAAAGAGAAGGTA...CAGGTCTGGGCCCACTATGAGGAGCAGCCCGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GGAGGAGGTGATGCCAGTGCTGGAGGAGAAGGAGCGATCTGCTAGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529016 GGAGGAGGTGATGCCAGTGCTGGAGGAGAAGGAGCGATCTGCTAGCTACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AGCCCGTGTTTGTGACCGAGATCACTGATGACCTGCACTTCTACGTGCAG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 529066 AGCCCGTGTTTGTGACTGAGATCACTGATGACCTGCACTTCTACGTGCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GATGTGGAGACCG         GCACCCAGTTGGAGAAGCTGATGGAGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 529116 GATGTGGAGACCGGTG...CAGGCACCCAGTTGGAGAAGCTGATGGAGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CATGCGCAATGACATTGCCAGTCACCCCCCTGTAGAGGGCTCCTATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 532379 CATGCGCAATGACATTGCCAGTCACCCCCCTGTAGAGGGCTCCTATGCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 CCCGCAGGGGAGAGTTCTGCATTGCCAAATTTGTAGATGGAGAATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 532429 CCCGCAGGGGAGAGTTCTGCATTGCCAAATTTGTAGATGGAGAATGGTA.

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2235      GTACCGTGCCCGAGTAGAGAAAGTCGAGTCTCCTGCCAAAATACA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 532479 ..CAGGTACCGTGCCCGAGTAGAGAAAGTCGAGTCTCCTGCCAAAATACA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 TGTCTTCTACATTGACTACGGCAAC         AGAGAGGTCCTGCCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 533383 TGTCTTCTACATTGACTACGGCAACGTG...CAGAGAGAGGTCCTGCCAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 CCACCCGCCTGGGTACCCTATCACCTGCCTTCAGCACTCGGGTGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 534581 CCACCCGCCTGGGTACCCTATCACCTGCCTTCAGCACTCGGGTGCTGCCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 GCTCAAGCCACGGAGTATGCCTTCGCCTTCATCCAGGTGCCCCAAGAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 534631 GCTCAAGCCACGGAGTATGCCTTCGCCTTCATCCAGGTGCCCCAAGATGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2419        GATGATGCCCGCACGGACGCCGTGGACAGCGTAGTTCGGGATA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 534681 G...CAGGATGATGCCCGCACGGACGCCGTGGACAGCGTAGTTCGGGATA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 TCCAGAACACTCAGTGCCTGCTCAACGTGGAACACCTGAGTGCCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 537159 TCCAGAACACTCAGTGCCTGCTCAACGTGGAACACCTGAGTGCCGGCTGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 CCCCATGTCACCCTGCAGTTTGCAGATTCCAAGGGCGATGTGGGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 537209 CCCCATGTCACCCTGCAGTTTGCAGATTCCAAGGGCGATGTGGGGCTGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CTTGGTGAAGGAAGGGCTGGTCATGGTGGAGGTGCGCAAGGAGAAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 537259 CTTGGTGAAGGAAGGGCTGGTCATGGTGGAGGTGCGCAAGGAGAAACAGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 TCCAGAAAGTG         ATCACAGAATACCTGAATGCCCAAGAGTCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 537309 TCCAGAAAGTGGTA...CAGATCACAGAATACCTGAATGCCCAAGAGTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GCCAAGAGCGCCAGG         CTGAACCTGTGGCGCTATGGAGACTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 539494 GCCAAGAGCGCCAGGGTG...CAGCTGAACCTGTGGCGCTATGGAGACTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .
   2694 TCGAGCTGATGATGCAGACGAATTTGGCTACAGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 539646 TCGAGCTGATGATGCAGACGAATTTGGCTACAGCCGC