seq1 = pF1KB4505.tfa, 3516 bp
seq2 = pF1KB4505/gi568815592r_169120198.tfa (gi568815592r:169120198_169350784), 230587 bp

>pF1KB4505 3516
>gi568815592r:169120198_169350784 (Chr6)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-609  (101812-102368)   100% ->
610-694  (104504-104588)   100% ->
695-891  (108827-109023)   100% ->
892-1032  (110193-110333)   100% ->
1033-1129  (111090-111186)   100% ->
1130-1300  (112990-113160)   100% ->
1301-1477  (113439-113615)   100% ->
1478-1651  (115878-116051)   100% ->
1652-1779  (117768-117895)   100% ->
1780-1932  (117969-118121)   100% ->
1933-2151  (118587-118805)   100% ->
2152-2259  (121106-121213)   100% ->
2260-2419  (122504-122663)   100% ->
2420-2538  (124487-124605)   99% ->
2539-2773  (125406-125640)   100% ->
2774-3001  (127310-127537)   100% ->
3002-3273  (128317-128588)   100% ->
3274-3371  (129258-129355)   100% ->
3372-3516  (130448-130593)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTGGAGGCTGGTCCTGCTGGCTCTGTGGGTGTGGCCCAGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTGGAGGCTGGTCCTGCTGGCTCTGTGGGTGTGGCCCAGCACGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AG         CTGGTCACCAGGACAAAGACACGACCTTCGACCTTTTCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTG...CAGCTGGTCACCAGGACAAAGACACGACCTTCGACCTTTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTATCAGCAACATCAACCGCAAGACCATTGGCGCCAAGCAGTTCCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GTATCAGCAACATCAACCGCAAGACCATTGGCGCCAAGCAGTTCCGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCGACCCCGGCGTGCCGGCTTACCGCTTCGTGCGCTTTGACTACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCCGACCCCGGCGTGCCGGCTTACCGCTTCGTGCGCTTTGACTACATCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCGGTGAACGCAGATGACCTCAGCAAGATCACCAAGATCATGCGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 ACCGGTGAACGCAGATGACCTCAGCAAGATCACCAAGATCATGCGGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGGGCTTCTTCCTCACGGCCCAGCTCAAGCAGGACGGCAAGTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 AGGAGGGCTTCTTCCTCACGGCCCAGCTCAAGCAGGACGGCAAGTCCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCACGCTGTTGGCTCTGGAGGGCCCCGGTCTCTCCCAGAGGCAGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 GGCACGCTGTTGGCTCTGGAGGGCCCCGGTCTCTCCCAGAGGCAGTTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATCGTCTCCAACGGCCCCGCGGACACGCTGGATCTCACCTACTGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 GATCGTCTCCAACGGCCCCGCGGACACGCTGGATCTCACCTACTGGATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGGCACCCGGCATGTGGTCTCCCTGGAGGACGTCGGCCTGGCTGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 ACGGCACCCGGCATGTGGTCTCCCTGGAGGACGTCGGCCTGGCTGACTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGTGGAAGAACGTCACCGTGCAGGTGGCTGGCGAGACCTACAGCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CAGTGGAAGAACGTCACCGTGCAGGTGGCTGGCGAGACCTACAGCTTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGTGGGCTGCGACCTCATAGACAGCTTCGCTCTGGACGAGCCCTTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CGTGGGCTGCGACCTCATAGACAGCTTCGCTCTGGACGAGCCCTTCTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCACCTGCAGGCGGAAAAGAGCCGGATGTACGTGGCCAAAGGCTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 AGCACCTGCAGGCGGAAAAGAGCCGGATGTACGTGGCCAAAGGCTCTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGAGAGAGTCACTTCAGG         GGTTTGCTTCAGAACGTCCACCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102351 AGAGAGAGTCACTTCAGGGTA...CAGGGTTTGCTTCAGAACGTCCACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGTGTTTGAAAACTCTGTGGAAGATATTCTAAGCAAGAAGGGTTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104527 AGTGTTTGAAAACTCTGTGGAAGATATTCTAAGCAAGAAGGGTTGCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAGGCCAGGGAG         CTGAGATCAACGCCATCAGTGAGAACACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104577 AAGGCCAGGGAGGTA...CAGCTGAGATCAACGCCATCAGTGAGAACACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GAGACGCTGCGCCTGGGTCCGCATGTCACCACCGAGTACGTGGGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108856 GAGACGCTGCGCCTGGGTCCGCATGTCACCACCGAGTACGTGGGCCCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTCGGAGAGGAGGCCCGAGGTGTGCGAACGCTCGTGCGAGGAGCTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108906 CTCGGAGAGGAGGCCCGAGGTGTGCGAACGCTCGTGCGAGGAGCTGGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACATGGTCCAGGAGCTCTCGGGGCTCCACGTCCTCGTGAACCAGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108956 ACATGGTCCAGGAGCTCTCGGGGCTCCACGTCCTCGTGAACCAGCTCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGAACCTCAAGAGAGTG         TCGAATGATAACCAGTTTCTCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109006 GAGAACCTCAAGAGAGTGGTG...CAGTCGAATGATAACCAGTTTCTCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGAGCTCATTGGTGGCCCTCCTAAGACAAGGAACATGTCAGCTTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110216 GGAGCTCATTGGTGGCCCTCCTAAGACAAGGAACATGTCAGCTTGCTGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGGATGGCCGGTTCTTTGCGGAAAATGAAACGTGGGTGGTGGACAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110266 AGGATGGCCGGTTCTTTGCGGAAAATGAAACGTGGGTGGTGGACAGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ACCACGTGTACCTGCAAG         AAATTTAAAACCATTTGCCACCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110316 ACCACGTGTACCTGCAAGGTG...TAGAAATTTAAAACCATTTGCCACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AATCACCTGCCCGCCTGCAACCTGCGCCAGTCCATCCTTTGTGGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111113 AATCACCTGCCCGCCTGCAACCTGCGCCAGTCCATCCTTTGTGGAAGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AATGCTGCCCTTCCTGCCTCCACT         CGGTGGACGGTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 111163 AATGCTGCCCTTCCTGCCTCCACTGTG...CAGCGGTGGACGGTGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGCTGGTCTCCGTGGGCAGAGTGGACCCAGTGCTCCGTGACGTGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113007 GGCTGGTCTCCGTGGGCAGAGTGGACCCAGTGCTCCGTGACGTGTGGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGGGACCCAGCAGAGAGGCCGGTCCTGTGACGTCACCAGCAACACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113057 TGGGACCCAGCAGAGAGGCCGGTCCTGTGACGTCACCAGCAACACCTGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGGGGCCCTCCATCCAGACACGGGCTTGCAGTCTGAGCAAGTGTGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113107 TGGGGCCCTCCATCCAGACACGGGCTTGCAGTCTGAGCAAGTGTGACACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CGCA         TCCGGCAGGACGGCGGCTGGAGCCACTGGTCACCTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113157 CGCAGTG...TAGTCCGGCAGGACGGCGGCTGGAGCCACTGGTCACCTTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GTCTTCATGCTCTGTGACCTGTGGAGTTGGCAATATCACACGCATCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113476 GTCTTCATGCTCTGTGACCTGTGGAGTTGGCAATATCACACGCATCCGTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCTGCAACTCCCCAGTGCCCCAGATGGGGGGCAAGAATTGCAAAGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113526 TCTGCAACTCCCCAGTGCCCCAGATGGGGGGCAAGAATTGCAAAGGGAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGCCGGGAGACCAAAGCCTGCCAGGGCGCCCCATGCCCAA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 113576 GGCCGGGAGACCAAAGCCTGCCAGGGCGCCCCATGCCCAAGTA...CAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CGATGGCCGCTGGAGCCCCTGGTCCCCGTGGTCGGCCTGCACTGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115879 CGATGGCCGCTGGAGCCCCTGGTCCCCGTGGTCGGCCTGCACTGTCACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GTGCCGGTGGGATCCGGGAGCGCACCCGGGTCTGCAACAGCCCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115929 GTGCCGGTGGGATCCGGGAGCGCACCCGGGTCTGCAACAGCCCTGAGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CAGTACGGAGGGAAGGCCTGCGTGGGGGATGTGCAGGAGCGTCAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115979 CAGTACGGAGGGAAGGCCTGCGTGGGGGATGTGCAGGAGCGTCAGATGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CAACAAGAGGAGCTGCCCCGTGG         ATGGCTGTTTATCCAACC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 116029 CAACAAGAGGAGCTGCCCCGTGGGTG...CAGATGGCTGTTTATCCAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CCTGCTTCCCGGGAGCCCAGTGCAGCAGCTTCCCCGATGGGTCCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117786 CCTGCTTCCCGGGAGCCCAGTGCAGCAGCTTCCCCGATGGGTCCTGGTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TGCGGCTCCTGCCCTGTGGGCTTCTTGGGCAATGGCACCCACTGTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117836 TGCGGCTCCTGCCCTGTGGGCTTCTTGGGCAATGGCACCCACTGTGAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CCTGGACGAG         TGTGCCCTGGTCCCCGACATCTGCTTCTCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 117886 CCTGGACGAGGTG...CAGTGTGCCCTGGTCCCCGACATCTGCTTCTCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CCAGCAAGGTGCCTCGCTGTGTCAACACTCAGCCTGGCTTCCACTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118000 CCAGCAAGGTGCCTCGCTGTGTCAACACTCAGCCTGGCTTCCACTGCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CCCTGCCCGCCCCGATACAGAGGGAACCAGCCCGTCGGGGTCGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118050 CCCTGCCCGCCCCGATACAGAGGGAACCAGCCCGTCGGGGTCGGCCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 AGCAGCCAAGACGGAAAAGCAA         GTGTGTGAGCCCGAAAACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 118100 AGCAGCCAAGACGGAAAAGCAAGTA...TAGGTGTGTGAGCCCGAAAACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CATGCAAGGACAAGACACACAACTGCCACAAGCACGCGGAGTGCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118606 CATGCAAGGACAAGACACACAACTGCCACAAGCACGCGGAGTGCATCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CTGGGCCACTTCAGCGACCCCATGTACAAGTGCGAGTGCCAGACAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118656 CTGGGCCACTTCAGCGACCCCATGTACAAGTGCGAGTGCCAGACAGGCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 CGCGGGCGACGGGCTCATCTGCGGGGAGGACTCGGACCTGGACGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118706 CGCGGGCGACGGGCTCATCTGCGGGGAGGACTCGGACCTGGACGGCTGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CCAACCTCAATCTGGTCTGCGCCACCAACGCCACCTACCACTGCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118756 CCAACCTCAATCTGGTCTGCGCCACCAACGCCACCTACCACTGCATCAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152          GATAACTGCCCCCATCTGCCAAATTCTGGGCAGGAAGACTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118806 GTG...CAGGATAACTGCCCCCATCTGCCAAATTCTGGGCAGGAAGACTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 TGACAAGGACGGGATTGGCGATGCCTGTGATGATGACGATGACAATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121147 TGACAAGGACGGGATTGGCGATGCCTGTGATGATGACGATGACAATGACG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GTGTGACCGATGAGAAG         GACAACTGCCAGCTCCTCTTCAAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121197 GTGTGACCGATGAGAAGGTA...CAGGACAACTGCCAGCTCCTCTTCAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 CCCCGCCAGGCTGACTATGACAAGGATGAGGTTGGGGACCGCTGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122528 CCCCGCCAGGCTGACTATGACAAGGATGAGGTTGGGGACCGCTGTGACAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 CTGCCCTTACGTGCACAACCCTGCCCAGATCGACACAGACAACAATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122578 CTGCCCTTACGTGCACAACCCTGCCCAGATCGACACAGACAACAATGGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 AGGGTGACGCCTGCTCCGTGGACATTGATGGGGACG         ATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 122628 AGGGTGACGCCTGCTCCGTGGACATTGATGGGGACGGTG...CAGATGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 TTCAATGAACGAGACAACTGTCCCTACGTCTACAACACTGACCAGAGGGA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 124492 TTCAATGAACGAGACAATTGTCCCTACGTCTACAACACTGACCAGAGGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 CACGGATGGTGACGGTGTGGGGGATCACTGTGACAACTGCCCCCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124542 CACGGATGGTGACGGTGTGGGGGATCACTGTGACAACTGCCCCCTGGTGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 ACAACCCTGACCAG         ACCGACGTGGACAATGACCTTGTTGGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 124592 ACAACCCTGACCAGGTG...TAGACCGACGTGGACAATGACCTTGTTGGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 GACCAGTGTGACAACAACGAGGACATAGATGACGACGGCCACCAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125433 GACCAGTGTGACAACAACGAGGACATAGATGACGACGGCCACCAGAACAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 CCAGGACAACTGCCCCTACATCTCCAACGCCAACCAGGCTGACCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125483 CCAGGACAACTGCCCCTACATCTCCAACGCCAACCAGGCTGACCATGACA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 GAGACGGCCAGGGCGACGCCTGTGACCCTGATGATGACAACGATGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125533 GAGACGGCCAGGGCGACGCCTGTGACCCTGATGATGACAACGATGGCGTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 CCCGATGACAGGGACAACTGCCGGCTTGTGTTCAACCCAGACCAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125583 CCCGATGACAGGGACAACTGCCGGCTTGTGTTCAACCCAGACCAGGAGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 CTTGGACG         GTGATGGACGGGGTGATATTTGTAAAGATGATT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125633 CTTGGACGGTG...TAGGTGATGGACGGGGTGATATTTGTAAAGATGATT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 TTGACAATGACAACATCCCAGATATTGATGATGTGTGTCCTGAAAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127343 TTGACAATGACAACATCCCAGATATTGATGATGTGTGTCCTGAAAACAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 GCCATCAGTGAGACAGACTTCAGGAACTTCCAGATGGTCCCCTTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127393 GCCATCAGTGAGACAGACTTCAGGAACTTCCAGATGGTCCCCTTGGATCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 CAAAGGGACCACCCAAATTGATCCCAACTGGGTCATTCGCCATCAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127443 CAAAGGGACCACCCAAATTGATCCCAACTGGGTCATTCGCCATCAAGGCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 AGGAGCTGGTTCAGACAGCCAACTCGGACCCCGGCATCGCTGTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 127493 AGGAGCTGGTTCAGACAGCCAACTCGGACCCCGGCATCGCTGTAGGTG..

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3002     GTTTTGACGAGTTTGGGTCTGTGGACTTCAGTGGCACATTCTACGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127543 .CAGGTTTTGACGAGTTTGGGTCTGTGGACTTCAGTGGCACATTCTACGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 AAACACTGACCGGGACGACGACTATGCCGGCTTCGTCTTTGGTTACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128363 AAACACTGACCGGGACGACGACTATGCCGGCTTCGTCTTTGGTTACCAGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 CAAGCAGCCGCTTCTATGTGGTGATGTGGAAGCAGGTGACGCAGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128413 CAAGCAGCCGCTTCTATGTGGTGATGTGGAAGCAGGTGACGCAGACCTAC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 TGGGAGGACCAGCCCACGCGGGCCTATGGCTACTCCGGCGTGTCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128463 TGGGAGGACCAGCCCACGCGGGCCTATGGCTACTCCGGCGTGTCCCTCAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GGTGGTGAACTCCACCACGGGGACGGGCGAGCACCTGAGGAACGCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128513 GGTGGTGAACTCCACCACGGGGACGGGCGAGCACCTGAGGAACGCGCTGT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 GGCACACGGGGAACACGCCGGGGCAG         GTGCGAACCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 128563 GGCACACGGGGAACACGCCGGGGCAGGTG...CAGGTGCGAACCTTATGG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 CACGACCCCAGGAACATTGGCTGGAAGGACTACACGGCCTATAGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129273 CACGACCCCAGGAACATTGGCTGGAAGGACTACACGGCCTATAGGTGGCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 CCTGACTCACAGGCCCAAGACTGGCTACATCAG         AGTCTTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129323 CCTGACTCACAGGCCCAAGACTGGCTACATCAGGTG...TAGAGTCTTAG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 TGCATGAAGGAAAACAGGTCATGGCAGACTCAGGACCTATCTATGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130456 TGCATGAAGGAAAACAGGTCATGGCAGACTCAGGACCTATCTATGACCAA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 ACCTACGCTGGCGGGCGGCTGGGTCTATTTGTCTTCTCTCAAGAAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130506 ACCTACGCTGGCGGGCGGCTGGGTCTATTTGTCTTCTCTCAAGAAATGGT

   3650     .    :    .    :    .    :    .
   3480 CTATTTCTCAGACCTCAAGTACGAATGCAGAGAT ATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |-| |
 130556 CTATTTCTCAGACCTCAAGTACGAATGCAGAGGTGAGT