seq1 = pF1KB4426.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KB4426/gi568815596r_216576754.tfa (gi568815596r:216576754_216794775), 218022 bp

>pF1KB4426 816
>gi568815596r:216576754_216794775 (Chr2)

(complement)

1-337  (100001-100337)   100% ->
338-567  (115697-115926)   100% ->
568-687  (116545-116664)   100% ->
688-816  (117894-118022)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTTGCTCACCGCGGTCCTCCTGCTGCTGGCCGCCTATGCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTTGCTCACCGCGGTCCTCCTGCTGCTGGCCGCCTATGCGGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCAGAGCCTGGGCTCCTTCGTGCACTGCGAGCCCTGCGACGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCAGAGCCTGGGCTCCTTCGTGCACTGCGAGCCCTGCGACGAGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTCTCCATGTGCCCCCCCAGCCCCCTGGGCTGCGAGCTGGTCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTCTCCATGTGCCCCCCCAGCCCCCTGGGCTGCGAGCTGGTCAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGGCTGCGGCTGCTGCATGACCTGCGCCCTGGCCGAGGGGCAGTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGGCTGCGGCTGCTGCATGACCTGCGCCCTGGCCGAGGGGCAGTCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCGTCTACACCGAGCGCTGCGCCCAGGGGCTGCGCTGCCTCCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCGTCTACACCGAGCGCTGCGCCCAGGGGCTGCGCTGCCTCCCCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGACGAGGAGAAGCCGCTGCACGCCCTGCTGCACGGCCGCGGGGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGACGAGGAGAAGCCGCTGCACGCCCTGCTGCACGGCCGCGGGGTTTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCAACGAAAAGAGCTACCGCGAGCAAGTCAAGATCG         AGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100301 CTCAACGAAAAGAGCTACCGCGAGCAAGTCAAGATCGGTG...CAGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACTCCCGTGAGCACGAGGAGCCCACCACCTCTGAGATGGCCGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115701 AGACTCCCGTGAGCACGAGGAGCCCACCACCTCTGAGATGGCCGAGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTACTCCCCCAAGATCTTCCGGCCCAAACACACCCGCATCTCCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115751 CCTACTCCCCCAAGATCTTCCGGCCCAAACACACCCGCATCTCCGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGGCTGAAGCAGTGAAGAAGGACCGCAGAAAGAAGCTGACCCAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115801 AAGGCTGAAGCAGTGAAGAAGGACCGCAGAAAGAAGCTGACCCAGTCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTTTGTCGGGGGAGCCGAGAACACTGCCCACCCCCGGATCATCTCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115851 GTTTGTCGGGGGAGCCGAGAACACTGCCCACCCCCGGATCATCTCTGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGAGATGAGACAGGAGTCTGAGCAG         GGCCCCTGCCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115901 CTGAGATGAGACAGGAGTCTGAGCAGGTG...CAGGGCCCCTGCCGCAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CACATGGAGGCTTCCCTGCAGGAGCTCAAAGCCAGCCCACGCATGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116560 CACATGGAGGCTTCCCTGCAGGAGCTCAAAGCCAGCCCACGCATGGTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCGTGCTGTGTACCTGCCCAATTGTGACCGCAAAGGATTCTACAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116610 CCGTGCTGTGTACCTGCCCAATTGTGACCGCAAAGGATTCTACAAGAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCAG         TGCAAACCTTCCCGTGGCCGCAAGCGTGGCATCTGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 116660 AGCAGGTA...CAGTGCAAACCTTCCCGTGGCCGCAAACGTGGCATCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TGGTGCGTGGACAAGTACGGGATGAAGCTGCCAGGCATGGAGTACGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117930 TGGTGCGTGGACAAGTACGGGATGAAGCTGCCAGGCATGGAGTACGTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGGGGACTTTCAGTGCCACACCTTCGACAGCAGCAACGTTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117980 CGGGGACTTTCAGTGCCACACCTTCGACAGCAGCAACGTTGAG