seq1 = pF1KB4394.tfa, 2502 bp
seq2 = pF1KB4394/gi568815583f_73898013.tfa (gi568815583f:73898013_74145005), 246993 bp

>pF1KB4394 2502
>gi568815583f:73898013_74145005 (Chr15)

1-129  (96801-96929)   100% ->
130-602  (99992-100464)   100% ->
603-1183  (124816-125396)   100% ->
1184-1254  (126845-126915)   100% ->
1255-1513  (135144-135402)   100% ->
1514-1566  (136466-136518)   100% ->
1567-1717  (144977-145127)   100% ->
1718-2502  (146209-146993)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCTGCACCCGCCCGATCTCCGAGGCCCCAGCAGGACCCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96801 ATGGAGCCTGCACCCGCCCGATCTCCGAGGCCCCAGCAGGACCCCGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCAGGAGCCCACCATGCCTCCCCCCGAGACCCCCTCTGAAGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96851 GCCCCAGGAGCCCACCATGCCTCCCCCCGAGACCCCCTCTGAAGGCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCCAGCCCCAGCCCCAGCCCTACAGAG         CGAGCCCCCGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  96901 AGCCCAGCCCCAGCCCCAGCCCTACAGAGGTA...CAGCGAGCCCCCGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCGGAGGAGGAGTTCCAGTTTCTGCGCTGCCAGCAATGCCAGGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100004 TCGGAGGAGGAGTTCCAGTTTCTGCGCTGCCAGCAATGCCAGGCGGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGTGCCCGAAGCTGCTGCCTTGTCTGCACACGCTGTGCTCAGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100054 CAAGTGCCCGAAGCTGCTGCCTTGTCTGCACACGCTGTGCTCAGGATGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGGCGTCGGGCATGCAGTGCCCCATCTGCCAGGCGCCCTGGCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100104 TGGAGGCGTCGGGCATGCAGTGCCCCATCTGCCAGGCGCCCTGGCCCCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGTGCAGACACACCCGCCCTGGATAACGTCTTTTTCGAGAGTCTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100154 GGTGCAGACACACCCGCCCTGGATAACGTCTTTTTCGAGAGTCTGCAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGCCTGTCGGTGTACCGGCAGATTGTGGATGCGCAGGCTGTGTGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100204 GCGCCTGTCGGTGTACCGGCAGATTGTGGATGCGCAGGCTGTGTGCACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCTGCAAAGAGTCGGCCGACTTCTGGTGCTTTGAGTGCGAGCAGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 GCTGCAAAGAGTCGGCCGACTTCTGGTGCTTTGAGTGCGAGCAGCTCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCGCCAAGTGCTTCGAGGCACACCAGTGGTTCCTCAAGCACGAGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100304 TGCGCCAAGTGCTTCGAGGCACACCAGTGGTTCCTCAAGCACGAGGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCCCTAGCAGAGCTGCGCAACCAGTCGGTGCGTGAGTTCCTGGACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100354 GCCCCTAGCAGAGCTGCGCAACCAGTCGGTGCGTGAGTTCCTGGACGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCGCAAGACCAACAACATCTTCTGCTCCAACCCCAACCACCGCACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 CCCGCAAGACCAACAACATCTTCTGCTCCAACCCCAACCACCGCACCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACGCTGACCAG         CATCTACTGCCGAGGATGTTCCAAGCCGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100454 ACGCTGACCAGGTG...CAGCATCTACTGCCGAGGATGTTCCAAGCCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GTGCTGCTCGTGCGCGCTCCTTGACAGCAGCCACAGTGAGCTCAAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124846 GTGCTGCTCGTGCGCGCTCCTTGACAGCAGCCACAGTGAGCTCAAGTGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACATCAGCGCAGAGATCCAGCAGCGACAGGAGGAGCTGGACGCCATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124896 ACATCAGCGCAGAGATCCAGCAGCGACAGGAGGAGCTGGACGCCATGACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAGGCGCTGCAGGAGCAGGATAGTGCCTTTGGCGCGGTTCACGCGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124946 CAGGCGCTGCAGGAGCAGGATAGTGCCTTTGGCGCGGTTCACGCGCAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCACGCGGCCGTCGGCCAGCTGGGCCGCGCGCGTGCCGAGACCGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124996 GCACGCGGCCGTCGGCCAGCTGGGCCGCGCGCGTGCCGAGACCGAGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGATCCGCGAGCGCGTGCGCCAGGTGGTAGCTCACGTGCGGGCTCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125046 TGATCCGCGAGCGCGTGCGCCAGGTGGTAGCTCACGTGCGGGCTCAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CGCGAGCTGCTGGAGGCTGTGGACGCGCGGTACCAGCGCGACTACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125096 CGCGAGCTGCTGGAGGCTGTGGACGCGCGGTACCAGCGCGACTACGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GATGGCCAGTCGGCTGGGCCGCCTGGATGCTGTGCTGCAGCGCATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125146 GATGGCCAGTCGGCTGGGCCGCCTGGATGCTGTGCTGCAGCGCATCCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CGGGCAGCGCGCTGGTGCAGAGGATGAAGTGCTACGCCTCGGACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125196 CGGGCAGCGCGCTGGTGCAGAGGATGAAGTGCTACGCCTCGGACCAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTGCTGGACATGCACGGTTTCCTGCGCCAGGCGCTCTGCCGCCTGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125246 GTGCTGGACATGCACGGTTTCCTGCGCCAGGCGCTCTGCCGCCTGCGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGAGGAGCCCCAGAGCCTGCAAGCTGCCGTGCGCACCGATGGCTTCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125296 GGAGGAGCCCCAGAGCCTGCAAGCTGCCGTGCGCACCGATGGCTTCGACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGTTCAAGGTGCGCCTGCAGGACCTCAGCTCTTGCATCACCCAGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125346 AGTTCAAGGTGCGCCTGCAGGACCTCAGCTCTTGCATCACCCAGGGGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 G         ATGCAGCTGTATCCAAGAAAGCCAGCCCAGAGGCTGCCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125396 GGTA...CAGATGCAGCTGTATCCAAGAAAGCCAGCCCAGAGGCTGCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CACTCCCAGGGACCCTATTGACGTTGACCTG         GATGTCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 126885 CACTCCCAGGGACCCTATTGACGTTGACCTGGTG...CAGGATGTCTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ATACAACGACAGCCCAGAAGAGGAAGTGCAGCCAGACCCAGTGCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135154 ATACAACGACAGCCCAGAAGAGGAAGTGCAGCCAGACCCAGTGCCCCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AAGGTCATCAAGATGGAGTCTGAGGAGGGGAAGGAGGCAAGGTTGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135204 AAGGTCATCAAGATGGAGTCTGAGGAGGGGAAGGAGGCAAGGTTGGCTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GAGCTCCCCGGAGCAGCCCAGGCCCAGCACCTCCAAGGCAGTCTCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135254 GAGCTCCCCGGAGCAGCCCAGGCCCAGCACCTCCAAGGCAGTCTCACCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CCCACCTGGATGGACCGCCTAGCCCCAGGAGCCCCGTCATAGGAAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135304 CCCACCTGGATGGACCGCCTAGCCCCAGGAGCCCCGTCATAGGAAGTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GTCTTCCTGCCCAACAGCAACCACGTGGCCAGTGGCGCCGGGGAGGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 135354 GTCTTCCTGCCCAACAGCAACCACGTGGCCAGTGGCGCCGGGGAGGCAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514         AGGAACGCGTTGTGGTGATCAGCAGCTCGGAAGACTCAGATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135404 TA...CAGAGGAACGCGTTGTGGTGATCAGCAGCTCGGAAGACTCAGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CCGAAAACTCG         TCCTCCCGAGAGCTGGATGACAGCAGCAGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 136508 CCGAAAACTCGGTG...CAGTCCTCCCGAGAGCTGGATGACAGCAGCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GAGTCCAGTGACCTCCAGCTGGAAGGCCCCAGCACCCTCAGGGTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145007 GAGTCCAGTGACCTCCAGCTGGAAGGCCCCAGCACCCTCAGGGTCCTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CGAGAACCTTGCTGACCCCCAAGCAGAAGACAGACCTCTGGTTTTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145057 CGAGAACCTTGCTGACCCCCAAGCAGAAGACAGACCTCTGGTTTTCTTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 ACCTCAAGATTGACAATGAAA         CCCAGAAGATTAGCCAGCTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 145107 ACCTCAAGATTGACAATGAAAGTG...CAGCCCAGAAGATTAGCCAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GCTGCGGTGAACCGGGAAAGCAAGTTCCGCGTGGTCATCCAGCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146229 GCTGCGGTGAACCGGGAAAGCAAGTTCCGCGTGGTCATCCAGCCTGAAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CTTCTTCAGCATCTACTCCAAGGCCGTGTCCCTGGAGGTGGGGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146279 CTTCTTCAGCATCTACTCCAAGGCCGTGTCCCTGGAGGTGGGGCTGCAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 ACTTCCTCAGCTTTCTGAGCTCCATGCGCCGCCCTATCTTGGCCTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146329 ACTTCCTCAGCTTTCTGAGCTCCATGCGCCGCCCTATCTTGGCCTGCTAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AAGCTGTGGGGGCCTGGCCTCCCAAACTTCTTCCGGGCCCTGGAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146379 AAGCTGTGGGGGCCTGGCCTCCCAAACTTCTTCCGGGCCCTGGAGGACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 TAACAGGCTGTGGGAATTCCAGGAGGCCATCTCGGGCTTCCTGGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146429 TAACAGGCTGTGGGAATTCCAGGAGGCCATCTCGGGCTTCCTGGCTGCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 TGCCTCTCATCCGGGAGCGTGTGCCCGGGGCCAGCAGCTTCAAACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146479 TGCCTCTCATCCGGGAGCGTGTGCCCGGGGCCAGCAGCTTCAAACTCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 AACCTGGCCCAGACCTACCTGGCGAGAAACATGAGCGAGCGCAGCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146529 AACCTGGCCCAGACCTACCTGGCGAGAAACATGAGCGAGCGCAGCGCCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 GGCTGCCGTGCTGGCCATGCGTGACCTGTGCCGCCTCCTCGAGGTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146579 GGCTGCCGTGCTGGCCATGCGTGACCTGTGCCGCCTCCTCGAGGTCTCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 CGGGCCCCCAGCTGGCCCAGCATGTCTACCCCTTCAGTAGCCTGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146629 CGGGCCCCCAGCTGGCCCAGCATGTCTACCCCTTCAGTAGCCTGCAGTGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 TTTGCCTCCCTGCAGCCCCTGGTGCAGGCAGCTGTGCTGCCCCGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146679 TTTGCCTCCCTGCAGCCCCTGGTGCAGGCAGCTGTGCTGCCCCGGGCTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 GGCCCGCCTCCTGGCCCTACACAACGTGAGCTTCATGGAGCTGCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146729 GGCCCGCCTCCTGGCCCTACACAACGTGAGCTTCATGGAGCTGCTGAGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 CACACCGCCGTGACCGGCAGGGGGGCCTGAAGAAGTACAGCCGCTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146779 CACACCGCCGTGACCGGCAGGGGGGCCTGAAGAAGTACAGCCGCTATCTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 AGCCTGCAGACCACCACGTTGCCCCCTGCCCAGCCTGCTTTCAACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146829 AGCCTGCAGACCACCACGTTGCCCCCTGCCCAGCCTGCTTTCAACCTGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 GGCTCTGGGCACCTACTTTGAAGGCCTGTTGGAGGGTCCGGCGCTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146879 GGCTCTGGGCACCTACTTTGAAGGCCTGTTGGAGGGTCCGGCGCTGGCAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 GGGCAGAAGGAGTCTCCACCCCACTTGCTGGCCGTGGCTTGGCAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146929 GGGCAGAAGGAGTCTCCACCCCACTTGCTGGCCGTGGCTTGGCAGAGAGG

   2550     .    :    .
   2488 GCCTCCCAGCAGAGC
        |||||||||||||||
 146979 GCCTCCCAGCAGAGC