seq1 = pF1KB4274.tfa, 1941 bp
seq2 = pF1KB4274/gi568815579f_36612384.tfa (gi568815579f:36612384_36820665), 208282 bp

>pF1KB4274 1941
>gi568815579f:36612384_36820665 (Chr19)

1-136  (99996-100129)   97% ->
137-223  (100398-100484)   100% ->
224-1941  (106565-108282)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGGGATCAGTGTCTTTCAATGATGTGACTGTGGACTTCACTCA
        || -||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATT CT AGGGATCAGTGTCTTTCAATGATGTGACTGTGGACTTCACTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGTGGCAGCACCTGGATCATGCTCAGAAGACTCTATATATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 GGAGGAGTGGCAGCACCTGGATCATGCTCAGAAGACTCTATATATGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGTTGGAAAACTATTGCCACCTCATCTCTGTGG         GGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100094 TGATGTTGGAAAACTATTGCCACCTCATCTCTGTGGGTA...CAGGGTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACATGACCAAACCTGATGTGATCCTCAAGTTGGAACGAGGAGAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100403 CACATGACCAAACCTGATGTGATCCTCAAGTTGGAACGAGGAGAAGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATGGACATCATTTGCAGGTCATACCTGCTTGG         AAGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100453 ATGGACATCATTTGCAGGTCATACCTGCTTGGGTG...TAGAAGAAAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAAAGCTGAAGACTTTTTAGTGAAATTCAAGGAACACCAAGAGAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106574 GGAAAGCTGAAGACTTTTTAGTGAAATTCAAGGAACACCAAGAGAAGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTAGATCAGTTGTAAGCATCAACCACAAAAAACTGGTGAAGGAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106624 TCTAGATCAGTTGTAAGCATCAACCACAAAAAACTGGTGAAGGAGAAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAAATATATGAAAAGACATTTACTCTAGGCAAAAACCCTGTGAATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106674 TAAAATATATGAAAAGACATTTACTCTAGGCAAAAACCCTGTGAATTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAATCTACCTCCTGAATATGATACTCATGGAAGGATTTTGAAAAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106724 AAAATCTACCTCCTGAATATGATACTCATGGAAGGATTTTGAAAAATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCAGAATTAATCATCAGTAATCTAAATCCTGCAAGAAAGAGACTTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106774 TCAGAATTAATCATCAGTAATCTAAATCCTGCAAGAAAGAGACTTAGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTATAATGGATATGGGAAATCACTCCTGAGTACTAAACAAGAGACTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106824 GTATAATGGATATGGGAAATCACTCCTGAGTACTAAACAAGAGACTACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATCCTGAAGTCAAATCCCATAATCAAAGTGCCAGAGCTTTCAGTCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106874 ATCCTGAAGTCAAATCCCATAATCAAAGTGCCAGAGCTTTCAGTCATAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAGTTCTTATGCAGTATCAGAAAACGGAAACTCCAGCACAGTCATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106924 GAAGTTCTTATGCAGTATCAGAAAACGGAAACTCCAGCACAGTCATTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ATATAATGACTGTGAGAAATCATTCCTTCAAAGGGGAGGCCTGATTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106974 ATATAATGACTGTGAGAAATCATTCCTTCAAAGGGGAGGCCTGATTACAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ATAGTAGACCTTACAAAGGAGAAAACCCATCTGTATATAATAAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107024 ATAGTAGACCTTACAAAGGAGAAAACCCATCTGTATATAATAAAAAAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGAGCAACCAATATTGAAAAAAAACATACATGCAATGAATGTGGGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107074 AGAGCAACCAATATTGAAAAAAAACATACATGCAATGAATGTGGGAAATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTTCTGCAGGAAATCAGTATTGATTCTGCATCAGGGAATTCACTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107124 TTTCTGCAGGAAATCAGTATTGATTCTGCATCAGGGAATTCACTCAGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AAAAACCCTATCAATGTCATCAATGTGGAAATGCATTTAGAAGGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107174 AAAAACCCTATCAATGTCATCAATGTGGAAATGCATTTAGAAGGAAATCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TATCTCATTGATCATCAGAGGACTCACACAGGAGAGAAACCCTTTGTTTG
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 107224 TATCTCATTGATCATCAGAGAACTCACACAGGAGAGAAACCCTTTGTTTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAATGAATGTGGTAAGTCCTTCCGCCTCAAGACAGCCCTCACTGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107274 CAATGAATGTGGTAAGTCCTTCCGCCTCAAGACAGCCCTCACTGATCATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGAGAACACACACAGGGGAGAAATCGTATGAATGTCTGCAATGTAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107324 AGAGAACACACACAGGGGAGAAATCGTATGAATGTCTGCAATGTAGGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCCTTCAGATTGAAGTCACACCTCATTCGTCATCAGAGAACTCACACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107374 GCCTTCAGATTGAAGTCACACCTCATTCGTCATCAGAGAACTCACACGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGAGAAACCATATGAGTGTAATGACTGTGGGAAGTCCTTCCGCCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107424 AGAGAAACCATATGAGTGTAATGACTGTGGGAAGTCCTTCCGCCAGAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CAACACTCTCTCTACATCAGAGAATCCATACAGGTGAGAAACCCTATATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 107474 CAACACTCTCTCTACATCAGAGAATCCATACAGGTGAGAAACCCTACATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TGTAAAGAATGTGGGAAGTCCTTTCACCAGAAGGCAAATCTTACTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107524 TGTAAAGAATGTGGGAAGTCCTTTCACCAGAAGGCAAATCTTACTGTACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TCAGAGAACTCATACAGGGGAAAAGCCCTATATTTGTAATGAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107574 TCAGAGAACTCATACAGGGGAAAAGCCCTATATTTGTAATGAATGTGGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AATCCTTCTCCCAGAAGACAACCCTTGCTCTTCATGAGAAAACTCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107624 AATCCTTCTCCCAGAAGACAACCCTTGCTCTTCATGAGAAAACTCATAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GAGGAGAAACCCTATATTTGTAGTGAATGTGGAAAGTCCTTCCGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107674 GAGGAGAAACCCTATATTTGTAGTGAATGTGGAAAGTCCTTCCGCCAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GACAACCCTTGTAGCACATCAGAGAACACATACAGGGGAGAAATCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107724 GACAACCCTTGTAGCACATCAGAGAACACATACAGGGGAGAAATCTTATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AATGTCCTCACTGTGGGAAGGCCTTTAGAATGAAGTCATACCTCATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107774 AATGTCCTCACTGTGGGAAGGCCTTTAGAATGAAGTCATACCTCATTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CATCACCGAACTCACACAGGAGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107824 CATCACCGAACTCACACAGGAGAGAAACCATATGAATGTAATGAATGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TAAATCATTCAGTCAAAAGACAAATCTCAATCTACATCAGAGAATTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107874 TAAATCATTCAGTCAAAAGACAAATCTCAATCTACATCAGAGAATTCATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CAGGGGAGAAACCCTATGTTTGTAATGAATGTGGGAAGTCCTTTCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107924 CAGGGGAGAAACCCTATGTTTGTAATGAATGTGGGAAGTCCTTTCGCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AAAGCAACCCTCACTGTACATCAGAAAATACATACCGGCCAGAAATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107974 AAAGCAACCCTCACTGTACATCAGAAAATACATACCGGCCAGAAATCCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 TGAATGTCCTCAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAGGAAGTCATATCTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108024 TGAATGTCCTCAGTGTGGGAAAGCCTTTAGCAGGAAGTCATATCTCATTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 ATCATCAAAGAACTCATACGGGAGAGAAACCATATAAATGTAGTGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108074 ATCATCAAAGAACTCATACGGGAGAGAAACCATATAAATGTAGTGAATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 GGAAAGTGCTTCCGCCAGAAGACAAATCTTATTGTACATCAGAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108124 GGAAAGTGCTTCCGCCAGAAGACAAATCTTATTGTACATCAGAGAACTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 CACAGGTGAGAAACCCTATGTTTGTAATGAGTGTGGTAAGTCTTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108174 CACAGGTGAGAAACCCTATGTTTGTAATGAGTGTGGTAAGTCTTTCAGTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 ATAAGAGAAACCTCATTGTCCATCAAAGAACTCACAAGGGAGAAAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108224 ATAAGAGAAACCTCATTGTCCATCAAAGAACTCACAAGGGAGAAAACATT

   1950     .
   1933 GAAATGCAA
        |||||||||
 108274 GAAATGCAA