seq1 = pF1KB4270.tfa, 1257 bp
seq2 = pF1KB4270/gi568815592r_96698475.tfa (gi568815592r:96698475_96899731), 201257 bp

>pF1KB4270 1257
>gi568815592r:96698475_96899731 (Chr6)

(complement)

1-1257  (100001-101257)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTTCTCGGCAGTGTTGACTGCGTTCCATACCGGGACATCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTTCTCGGCAGTGTTGACTGCGTTCCATACCGGGACATCCAACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACATTTGTCATGTATGAAAACACCTACATGAATATTACACTCCCTCCAC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACATTTGTCGTGTATGAAAACACCTACATGAATATTACACTCCCTCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATTCCAGCATCCTGACCTCAGTCCATTGCTTAGATATAGTTTTGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATTCCAGCATCCTGACCTCAGTCCATTGCTTAGATATAGTTTTGAAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGCTCCCACTGGTTTGAGTTCCTTGACCGTGAATAGTACAGCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGCTCCCACTGGTTTGAGTTCCTTGACCGTGAATAGTACAGCTGTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACAACACCAGCAGCATTTAAGAGCCTAAACTTGCCTCTTCAGATCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACAACACCAGCAGCATTTAAGAGCCTAAACTTGCCTCTTCAGATCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTCTGCTATAATGATATTCATTCTGTTTGTGTCTTTTCTTGGGAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTCTGCTATAATGATATTCATTCTGTTTGTGTCTTTTCTTGGGAACTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTGTTTGCCTCATGGTTTACCAAAAAGCTGCCATGAGGTCTGCAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTGTTTGCCTCATGGTTTACCAAAAAGCTGCCATGAGGTCTGCAATTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCCTCCTTGCCAGCCTAGCTTTTGCAGACATGTTGCTTGCAGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCCTCCTTGCCAGCCTAGCTTTTGCAGACATGTTGCTTGCAGTGCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACATGCCCTTTGCCCTGGTAACTATTCTTACTACCCGATGGATTTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACATGCCCTTTGCCCTGGTAACTATTCTTACTACCCGATGGATTTTTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAATTCTTCTGTAGGGTATCTGCTATGTTTTTCTGGTTATTTGTGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAATTCTTCTGTAGGGTATCTGCTATGTTTTTCTGGTTATTTGTGATAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGAGTAGCCATCCTGCTCATCATTAGCATAGATAGGTTCCTTATTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGAGTAGCCATCCTGCTCATCATTAGCATAGATAGGTTCCTTATTATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCAGAGGCAGGATAAGCTAAACCCATATAGAGCTAAGGTTCTGATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCAGAGGCAGGATAAGCTAAACCCATATAGAGCTAAGGTTCTGATTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTTCTTGGGCAACTTCCTTTTGTGTAGCTTTTCCTTTAGCCGTAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTTCTTGGGCAACTTCCTTTTGTGTAGCTTTTCCTTTAGCCGTAGGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCCGACCTGCAGATACCTTCCCGAGCTCCCCAGTGTGTGTTTGGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCCGACCTGCAGATACCTTCCCGAGCTCCCCAGTGTGTGTTTGGGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAACCAATCCAGGCTACCAGGCTTATGTGATTTTGATTTCTCTCATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAACCAATCCAGGCTACCAGGCTTATGTGATTTTGATTTCTCTCATTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTCATACCCTTCCTGGTAATACTGTACTCATTTATGGGCATACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTTCATACCCTTCCTGGTAATACTGTACTCATTTATGGGCATACTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACCCTTCGGCACAATGCCTTGAGGATCCATAGCTACCCTGAAGGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACCCTTCGGCACAATGCCTTGAGGATCCATAGCTACCCTGAAGGTATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCTCAGCCAGGCCAGCAAACTGGGTCTCATGAGTCTGCAGAGACCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCTCAGCCAGGCCAGCAAACTGGGTCTCATGAGTCTGCAGAGACCTTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGATGAGCATTGACATGGGCTTTAAAACACGTGCCTTCACCACTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGATGAGCATTGACATGGGCTTTAAAACACGTGCCTTCACCACTATTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATTCTCTTTGCTGTCTTCATTGTCTGCTGGGCCCCATTCACCACTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATTCTCTTTGCTGTCTTCATTGTCTGCTGGGCCCCATTCACCACTTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCCTTGTGGCAACATTCAGTAAGCACTTTTACTATCAGCACAACTTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCCTTGTGGCAACATTCAGTAAGCACTTTTACTATCAGCACAACTTTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGATTAGCACCTGGCTACTGTGGCTCTGCTACCTCAAGTCTGCATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGATTAGCACCTGGCTACTGTGGCTCTGCTACCTCAAGTCTGCATTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCCGCTGATCTACTACTGGAGGATTAAGAAATTCCATGATGCTTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCCGCTGATCTACTACTGGAGGATTAAGAAATTCCATGATGCTTGCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACATGATGCCTAAGTCCTTCAAGTTTTTGCCGCAGCTCCCTGGTCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACATGATGCCTAAGTCCTTCAAGTTTTTGCCGCAGCTCCCTGGTCACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGCGACGGATACGTCCTAGTGCTGTCTATGTGTGTGGGGAACATCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGCGACGGATACGTCCTAGTGCTGTCTATGTGTGTGGGGAACATCGGAC

   1250     .
   1251 GGTGGTG
        |||||||
 101251 GGTGGTG