seq1 = pF1KB4264.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KB4264/gi568815575r_109544032.tfa (gi568815575r:109544032_109783486), 239455 bp

>pF1KB4264 2133
>gi568815575r:109544032_109783486 (ChrX)

(complement)

1-351  (100001-100351)   100% ->
352-529  (100591-100768)   100% ->
530-639  (102112-102221)   100% ->
640-778  (102351-102489)   100% ->
779-929  (105072-105222)   100% ->
930-1053  (105376-105499)   100% ->
1054-1125  (109014-109085)   100% ->
1126-1265  (114314-114453)   100% ->
1266-1438  (115214-115386)   100% ->
1439-1513  (117993-118067)   100% ->
1514-1705  (120085-120276)   100% ->
1706-1820  (121842-121956)   100% ->
1821-1978  (123976-124133)   100% ->
1979-2133  (139301-139455)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACTTAAGCTAAATGTGCTCACCATTATTTTGCTGCCTGTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAACTTAAGCTAAATGTGCTCACCATTATTTTGCTGCCTGTCCACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTAATAACAATATACAGTGCCCTTATATTTATTCCATGGTATTTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTAATAACAATATACAGTGCCCTTATATTTATTCCATGGTATTTTCTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAATGCCAAGAAGAAAAACGCTATGGCAAAGAGAATAAAAGCTAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAATGCCAAGAAGAAAAACGCTATGGCAAAGAGAATAAAAGCTAAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTTCAGACAAACCTGGAAGTCCATATCGCTCTGTCACACACTTCGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTTCAGACAAACCTGGAAGTCCATATCGCTCTGTCACACACTTCGACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTAGCTGTAATAGACATCCCTGGAGCAGATACTCTGGATAAATTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTAGCTGTAATAGACATCCCTGGAGCAGATACTCTGGATAAATTATTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCATGCTGTATCCAAGTTTGGGAAGAAGGACAGCCTTGGGACCAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCATGCTGTATCCAAGTTTGGGAAGAAGGACAGCCTTGGGACCAGGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCTAAGTGAAGAAAATGAAATGCAGCCAAATGGAAAAGTTTTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCCTAAGTGAAGAAAATGAAATGCAGCCAAATGGAAAAGTTTTTAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 G         TTAATTCTTGGGAATTATAAATGGATGAACTATCTTGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTA...CAGTTAATTCTTGGGAATTATAAATGGATGAACTATCTTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGAATCGCAGAGTGAATAACTTTGGTAGTGGACTCACTGCACTGGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100631 TGAATCGCAGAGTGAATAACTTTGGTAGTGGACTCACTGCACTGGGACTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAACCAAAGAACACCATTGCCATCTTCTGTGAGACCAGGGCCGAATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100681 AAACCAAAGAACACCATTGCCATCTTCTGTGAGACCAGGGCCGAATGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GATTGCAGCACAGACCTGCTTTAAGTACAACTTTCCTC         TTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100731 GATTGCAGCACAGACCTGCTTTAAGTACAACTTTCCTCGTA...TAGTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGACTTTATATGCCACACTTGGCAAAGAAGCAGTAGTTCATGGGCTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 TGACTTTATATGCCACACTTGGCAAAGAAGCAGTAGTTCATGGGCTAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAATCTGAGGCTTCCTATCTGATTACCAGTGTTGAACTTCTGGAAAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 GAATCTGAGGCTTCCTATCTGATTACCAGTGTTGAACTTCTGGAAAGTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACTTAAG         ACTGCATTGTTAGATATCAGTTGTGTTAAACATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 ACTTAAGGTA...CAGACTGCATTGTTAGATATCAGTTGTGTTAAACATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCATTTATGTGGACAATAAGGCTATCAATAAAGCAGAGTACCCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102385 TCATTTATGTGGACAATAAGGCTATCAATAAAGCAGAGTACCCTGAAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTGAGATTCACAGCATGCAATCAGTAGAAGAGTTGGGATCTAACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102435 TTTGAGATTCACAGCATGCAATCAGTAGAAGAGTTGGGATCTAACCCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAACT         TGGGCATTCCTCCAAGTAGACCAACGCCTTCAGACA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102485 AAACTGTA...TAGTGGGCATTCCTCCAAGTAGACCAACGCCTTCAGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGCCATTGTTATGTATACTAGTGGTTCTACTGGCCGACCTAAGGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105108 TGGCCATTGTTATGTATACTAGTGGTTCTACTGGCCGACCTAAGGGAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATGATGCATCATAGCAATTTGATAGCTGGAATGACAGGCCAGTGTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105158 ATGATGCATCATAGCAATTTGATAGCTGGAATGACAGGCCAGTGTGAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AATACCTGGACTGGG         ACCGAAGGACACATATATTGGCTACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105208 AATACCTGGACTGGGGTA...TAGACCGAAGGACACATATATTGGCTACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCCTTTGGCTCATGTGCTAGAACTGACAGCAGAGATATCTTGCTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105402 TGCCTTTGGCTCATGTGCTAGAACTGACAGCAGAGATATCTTGCTTTACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TATGGCTGCAGGATTGGATATTCTTCTCCGCTTACACTCTCTGACCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105452 TATGGCTGCAGGATTGGATATTCTTCTCCGCTTACACTCTCTGACCAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1054        TCCAGCAAAATTAAAAAAGGAAGCAAAGGAGACTGTACTGTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105502 G...TAGTCCAGCAAAATTAAAAAAGGAAGCAAAGGAGACTGTACTGTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGAAGCCCACACTTATGGCTGCTGTTCCG         GAAATCATGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109057 TGAAGCCCACACTTATGGCTGCTGTTCCGGTG...CAGGAAATCATGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGAATTTATAAGAATGTTATGAGCAAAGTCCAAGAGATGAATTATATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114326 AGAATTTATAAGAATGTTATGAGCAAAGTCCAAGAGATGAATTATATTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAAAACTCTGTTCAAGATAGGGTATGATTACAAATTGGAACAGATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114376 GAAAACTCTGTTCAAGATAGGGTATGATTACAAATTGGAACAGATCAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGGGATATGATGCACCTCTTTGCAATCT         GTTACTGTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 114426 AGGGATATGATGCACCTCTTTGCAATCTGTA...AAGGTTACTGTTTAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAGGTCAAGGCCCTGCTGGGAGGGAATGTCCGCATGATGCTGTCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115227 AAGGTCAAGGCCCTGCTGGGAGGGAATGTCCGCATGATGCTGTCTGGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCCCGCTATCTCCTCAGACACACCGATTCATGAATGTCTGCTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115277 GGCCCCGCTATCTCCTCAGACACACCGATTCATGAATGTCTGCTTCTGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCCCAATTGGCCAGGGTTATGGACTGACAGAATCATGTGGTGCTGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115327 GCCCAATTGGCCAGGGTTATGGACTGACAGAATCATGTGGTGCTGGGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GTTACTGAAG         TAACTGACTATACTACTGGCAGAGTTGGAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 115377 GTTACTGAAGGTA...CAGTAACTGACTATACTACTGGCAGAGTTGGAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 ACCTCTTATTTGCTGTGAAATTAAGCTAAAAGACTGGCAAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118024 ACCTCTTATTTGCTGTGAAATTAAGCTAAAAGACTGGCAAGAAGGTA...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514    GCGGTTATACAATTAATGACAAGCCAAACCCCAGAGGTGAAATCGTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120082 CAGGCGGTTATACAATTAATGACAAGCCAAACCCCAGAGGTGAAATCGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATTGGTGGACAGAACATCTCCATGGGATATTTTAAAAATGAAGAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120132 ATTGGTGGACAGAACATCTCCATGGGATATTTTAAAAATGAAGAGAAAAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGCAGAAGATTATTCTGTGGATGAAAATGGACAAAGGTGGTTTTGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120182 AGCAGAAGATTATTCTGTGGATGAAAATGGACAAAGGTGGTTTTGCACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTGATATTGGAGAATTCCATCCCGATGGATGTTTACAGATTATAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120232 GTGATATTGGAGAATTCCATCCCGATGGATGTTTACAGATTATAGGTC..

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706     ATCGTAAGAAAGATCTAGTGAAGTTACAAGCAGGAGAGTATGTATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120282 .CAGATCGTAAGAAAGATCTAGTGAAGTTACAAGCAGGAGAGTATGTATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TCTTGGGAAAGTAGAAGCTGCACTGAAGAATTGTCCACTTATTGACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121888 TCTTGGGAAAGTAGAAGCTGCACTGAAGAATTGTCCACTTATTGACAACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TCTGTGCTTTTGCCAAAAG         TGATCAGTCCTATGTGATCAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121938 TCTGTGCTTTTGCCAAAAGGTA...TAGTGATCAGTCCTATGTGATCAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TTTGTGGTTCCTAACCAGAAAAGGTTGACACTTTTGGCACAACAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123998 TTTGTGGTTCCTAACCAGAAAAGGTTGACACTTTTGGCACAACAGAAAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GGTAGAAGGAACTTGGGTTGATATCTGCAATAATCCTGCTATGGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124048 GGTAGAAGGAACTTGGGTTGATATCTGCAATAATCCTGCTATGGAAGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AAATACTGAAAGAAATTCGAGAAGCTGCAAATGCCA         TGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 124098 AAATACTGAAAGAAATTCGAGAAGCTGCAAATGCCAGTA...CAGTGAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TTGGAGCGATTTGAAATTCCAATCAAGGTTCGATTAAGCCCAGAGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139306 TTGGAGCGATTTGAAATTCCAATCAAGGTTCGATTAAGCCCAGAGCCATG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GACCCCTGAAACTGGTTTGGTAACTGATGCTTTCAAACTGAAAAGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139356 GACCCCTGAAACTGGTTTGGTAACTGATGCTTTCAAACTGAAAAGGAAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AGCTGAGGAACCATTACCTCAAAGACATTGAACGAATGTATGGGGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139406 AGCTGAGGAACCATTACCTCAAAGACATTGAACGAATGTATGGGGGCAAA