seq1 = pF1KB4251.tfa, 2919 bp
seq2 = pF1KB4251/gi568815590f_22179387.tfa (gi568815590f:22179387_22455502), 276116 bp

>pF1KB4251 2919
>gi568815590f:22179387_22455502 (Chr8)

1-198  (100001-100198)   100% ->
199-286  (101734-101821)   100% ->
287-425  (101991-102129)   100% ->
426-632  (103648-103854)   100% ->
633-743  (104776-104886)   100% ->
744-861  (108142-108259)   100% ->
862-986  (109156-109280)   100% ->
987-1067  (110461-110541)   100% ->
1068-1181  (110847-110960)   100% ->
1182-1370  (124635-124823)   100% ->
1371-1455  (125398-125482)   100% ->
1456-1545  (126541-126630)   100% ->
1546-1686  (128547-128687)   100% ->
1687-1800  (130575-130688)   100% ->
1801-1989  (131726-131914)   100% ->
1990-2091  (134942-135043)   100% ->
2092-2208  (135643-135759)   100% ->
2209-2297  (136859-136947)   100% ->
2298-2403  (138784-138889)   100% ->
2404-2657  (173573-173826)   100% ->
2658-2765  (174885-174992)   100% ->
2766-2919  (175963-176116)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCTTTCCGACCATCGTTCAGGGGCCAGTCTCCTATCCACCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCTTTCCGACCATCGTTCAGGGGCCAGTCTCCTATCCACCCATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGTGCCAGGCTGTACGGATGCCAGGCTGTTGGCCACAAGCTTCTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGTGCCAGGCTGTACGGATGCCAGGCTGTTGGCCACAAGCTTCTAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTTGGACCCAGCTCTGGGCAGGGGAGCACCTGCAGGCAGAGGCCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTTGGACCCAGCTCTGGGCAGGGGAGCACCTGCAGGCAGAGGCCATGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGGAAAGCCAGAGGAACCAAGCACACAGAGGGGGCCAGCACAAAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100151 TTTGGAAAGCCAGAGGAACCAAGCACACAGAGGGGGCCAGCACAAAGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        GAGTCTGTGGGTTTGGTCTCCATGTTCCGAGGCCTGGGCATTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 A...CAGGAGTCTGTGGGTTTGGTCTCCATGTTCCGAGGCCTGGGCATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAACAGTTTCTAAGACCCCTCTGAAACGGGAAATGCTTCCATCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101777 AAACAGTTTCTAAGACCCCTCTGAAACGGGAAATGCTTCCATCAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GTAGAGGCATTTTAGGTCGAGGCTTGTCTGCTAATCTGGTACGCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101827 .CAGGTAGAGGCATTTTAGGTCGAGGCTTGTCTGCTAATCTGGTACGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACAGGGAGGAACTCTCTCCCACTTTTTGGGATCCAAAAGTGTTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 GGACAGGGAGGAACTCTCTCCCACTTTTTGGGATCCAAAAGTGTTGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGGGACAGCAAGATGGCAGAGACCTCCGTTGGTTGGAGTAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102087 CTGGGGACAGCAAGATGGCAGAGACCTCCGTTGGTTGGAGTAGGTG...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    426   GACGCTTGGAAGAGGGAGTTCAGATGCGTCTTTATTACCACTGGGAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103646 AGGACGCTTGGAAGAGGGAGTTCAGATGCGTCTTTATTACCACTGGGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCAGCAGGTGGTATCAGCAGAGAAGTGGACAAGCCTCCCTGTACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103696 AGCAGCAGGTGGTATCAGCAGAGAAGTGGACAAGCCTCCCTGTACCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCACACCGTCCCGGGGTCCCCCGCAGCTGTCATCACCACCAGCTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103746 GCACACCGTCCCGGGGTCCCCCGCAGCTGTCATCACCACCAGCTCTGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGTCTCCCCTGCACTCTCCAGATCGCCCTCTGGTCCTGACTGTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103796 CAGTCTCCCCTGCACTCTCCAGATCGCCCTCTGGTCCTGACTGTGGAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAGGAAAA         AGAGCTTATTGTGAAGCAAGGATCAAAAGGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103846 CAAGGAAAAGTA...TAGAGAGCTTATTGTGAAGCAAGGATCAAAAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CACCTCAGTCTTTGGGACTGAACCTCGTCAAAATACAGTGTCATAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104808 CACCTCAGTCTTTGGGACTGAACCTCGTCAAAATACAGTGTCATAATGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCAGTTTATCAATATCATGTGACTTTCAG         CCCCAATGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104858 GCAGTTTATCAATATCATGTGACTTTCAGGTA...CAGCCCCAATGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTGCAAAAGCATGAGGTTCGGCATGTTGAAGGACCATCAAGCTGTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108154 GTGCAAAAGCATGAGGTTCGGCATGTTGAAGGACCATCAAGCTGTCACCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCAACGTCACTGCGTTTGATGGATCTATTCTCTATCTGCCTGTTAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108204 GCAACGTCACTGCGTTTGATGGATCTATTCTCTATCTGCCTGTTAAGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAACAA         GTTCTTGAGTTAAAAAGTCAAAGGAAAACAGACAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108254 CAACAAGTG...TAGGTTCTTGAGTTAAAAAGTCAAAGGAAAACAGACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCTGAAATCAGCATTAAGATTCAGATGACAAAGATCCTGGAGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109191 TGCTGAAATCAGCATTAAGATTCAGATGACAAAGATCCTGGAGCCCTGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGACCTGTGCATTCCCTTCTACAATGTTGTTTTCCGTCG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109241 CTGACCTGTGCATTCCCTTCTACAATGTTGTTTTCCGTCGGTA...CAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTAATGAAACTTTTAGATATGAAGCTTGTGGGGAGAAACTTTTATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110462 GTAATGAAACTTTTAGATATGAAGCTTGTGGGGAGAAACTTTTATGACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TACAAGTGCTATGGTACTACAGCAACACAG         ATTGCAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110512 TACAAGTGCTATGGTACTACAGCAACACAGGTT...CAGATTGCAGATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGCCAGGCTATGCAGCTAGCATCCGAAGGACAGATGGAGGGCTCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110858 GGCCAGGCTATGCAGCTAGCATCCGAAGGACAGATGGAGGGCTCTTCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTAGCTGATGTCTCCCATAAGGTCATTCGGAATGACTGTGTGCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110908 CTAGCTGATGTCTCCCATAAGGTCATTCGGAATGACTGTGTGCTGGATGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CAT         GCATGCCATTTATCAGCAGAATAAAGAACACTTCCAGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110958 CATGTG...AAGGCATGCCATTTATCAGCAGAATAAAGAACACTTCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ATGAGTGTACTAAGCTTCTGGTTGGCAATATTGTTATCACCCGATATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124673 ATGAGTGTACTAAGCTTCTGGTTGGCAATATTGTTATCACCCGATATAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AATCGTACCTATCGTATTGATGATGTGGATTGGAATAAGACTCCAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124723 AATCGTACCTATCGTATTGATGATGTGGATTGGAATAAGACTCCAAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TAGCTTCACGATGTCTGATGGGAAAGAGATCACATTCTTGGAATACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124773 TAGCTTCACGATGTCTGATGGGAAAGAGATCACATTCTTGGAATACTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 G         CAAAAATTATGGGATCACAGTTAAGGAAGAGGACCAGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124823 GGTA...TAGCAAAAATTATGGGATCACAGTTAAGGAAGAGGACCAGCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TTGCTGATTCACAGGCCCAGTGAGAGACAGGATAATCATGGGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 125438 TTGCTGATTCACAGGCCCAGTGAGAGACAGGATAATCATGGGATGGTG..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456     CTGCTAAAAGGGGAAATCCTGCTGCTGCCTGAGCTTTCTTTTATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 .AAGCTGCTAAAAGGGGAAATCCTGCTGCTGCCTGAGCTTTCTTTTATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCGGAATCCCAGAGAAGATGAAGAAGGACTTCAGAGCCATGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 126587 CCGGAATCCCAGAGAAGATGAAGAAGGACTTCAGAGCCATGAAGGTT...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546    GATTTGGCTCAGCAAATCAATCTGAGCCCCAAGCAACACCATAGTGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128544 TAGGATTTGGCTCAGCAAATCAATCTGAGCCCCAAGCAACACCATAGTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TTTGGAATGCTTGCTGCAAAGAATTGCAAAGAACGAGGCAGCCACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128594 TTTGGAATGCTTGCTGCAAAGAATTGCAAAGAACGAGGCAGCCACCAATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AACTGATGCGTTGGGGGCTCCGTCTGCAAAAGGATGTACATAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128644 AACTGATGCGTTGGGGGCTCCGTCTGCAAAAGGATGTACATAAGGTA...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1687    ATTGAAGGACGTGTTCTGCCAATGGAAAGAATTAACTTAAAAAATAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130572 TAGATTGAAGGACGTGTTCTGCCAATGGAAAGAATTAACTTAAAAAATAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TTCGTTTATCACATCTCAGGAACTAAACTGGGTTAAGGAAGTAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130622 TTCGTTTATCACATCTCAGGAACTAAACTGGGTTAAGGAAGTAACCAGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACCCTTCCATCTTGACT         ATCCCCATGCATTTCTGGGCACTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 130672 ACCCTTCCATCTTGACTGTA...TAGATCCCCATGCATTTCTGGGCACTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TTTTACCCAAAGAGAGCAATGGACCAGGCTCGAGAACTGGTCAACATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131750 TTTTACCCAAAGAGAGCAATGGACCAGGCTCGAGAACTGGTCAACATGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGAGAAGATAGCCGGCCCCATTGGCATGCGTATGAGCCCACCGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131800 GGAGAAGATAGCCGGCCCCATTGGCATGCGTATGAGCCCACCGGCCTGGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TTGAACTAAAGGATGACCGAATAGAGACTTATGTCAGAACCATTCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131850 TTGAACTAAAGGATGACCGAATAGAGACTTATGTCAGAACCATTCAATCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ACGTTAGGAGCTGAG         GGGAAGATACAGATGGTTGTTTGCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 131900 ACGTTAGGAGCTGAGGTA...AAGGGGAAGATACAGATGGTTGTTTGCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CATCATGGGCCCACGTGATGATCTCTATGGGGCCATCAAGAAGCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134968 CATCATGGGCCCACGTGATGATCTCTATGGGGCCATCAAGAAGCTGTGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GTGTGCAGTCCCCAGTGCCCTCCCAG         GTTGTCAATGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 135018 GTGTGCAGTCCCCAGTGCCCTCCCAGGTG...TAGGTTGTCAATGTTCGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 ACCATTGGTCAGCCCACCAGGCTTCGGAGTGTGGCCCAGAAGATTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135658 ACCATTGGTCAGCCCACCAGGCTTCGGAGTGTGGCCCAGAAGATTTTACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TCAGATTAACTGTAAATTGGGTGGTGAGCTCTGGGGAGTGGATATTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135708 TCAGATTAACTGTAAATTGGGTGGTGAGCTCTGGGGAGTGGATATTCCTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TG         AAACAGTTAATGGTGATCGGGATGGATGTTTACCATGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135758 TGGTG...TAGAAACAGTTAATGGTGATCGGGATGGATGTTTACCATGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 CCCAGTAGAGGCATGCGCTCCGTGGTTGGCTTCGTGGCAAGCATCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136898 CCCAGTAGAGGCATGCGCTCCGTGGTTGGCTTCGTGGCAAGCATCAATCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298          CACCCTCACAAAATGGTATTCCCGGGTGGTGTTCCAGATGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136948 GTA...TAGCACCCTCACAAAATGGTATTCCCGGGTGGTGTTCCAGATGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 CGCATCAGGAGATTGTGGACAGCCTGAAGCTATGCCTCGTGGGCTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138825 CGCATCAGGAGATTGTGGACAGCCTGAAGCTATGCCTCGTGGGCTCCTTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 AAAAAGTTTTATGAG         GTGAACCACTGTCTACCAGAGAAGAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 138875 AAAAAGTTTTATGAGGTG...CAGGTGAACCACTGTCTACCAGAGAAGAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 TGTGGTGTACCGTGATGGAGTGTCTGATGGCCAACTGAAGACAGTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173599 TGTGGTGTACCGTGATGGAGTGTCTGATGGCCAACTGAAGACAGTTGCCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 ACTATGAGATTCCTCAACTACAGAAGTGTTTTGAAGCTTTTGAGAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173649 ACTATGAGATTCCTCAACTACAGAAGTGTTTTGAAGCTTTTGAGAATTAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CAGCCCAAGATGGTGGTGTTTGTAGTTCAGAAGAAAATCAGTACTAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173699 CAGCCCAAGATGGTGGTGTTTGTAGTTCAGAAGAAAATCAGTACTAATCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 ATATCTGGCTGCTCCTCAGAACTTTGTAACTCCCACTCCTGGAACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173749 ATATCTGGCTGCTCCTCAGAACTTTGTAACTCCCACTCCTGGAACTGTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 TAGATCATACAATAACAAGCTGTGAGTG         GGTGGATTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 173799 TAGATCATACAATAACAAGCTGTGAGTGGTA...TAGGGTGGATTTCTAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 CTTCTTGCCCATCATGTACGGCAGGGCTGTGGCATTCCTACGCATTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174898 CTTCTTGCCCATCATGTACGGCAGGGCTGTGGCATTCCTACGCATTATGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CTGTGTTCTCAACACCGCAAACCTGAGCCCTGATCATATGCAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 174948 CTGTGTTCTCAACACCGCAAACCTGAGCCCTGATCATATGCAGAGGTG..

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766     GCTGACTTTCAAACTGTGCCACATGTACTGGAATTGGCCTGGCACC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174998 .CAGGCTGACTTTCAAACTGTGCCACATGTACTGGAATTGGCCTGGCACC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 ATCAGAGTTCCAGCTCCTTGCAAGTATGCCCACAAGCTAGCTTTCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176009 ATCAGAGTTCCAGCTCCTTGCAAGTATGCCCACAAGCTAGCTTTCCTGTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 AGGACACATCTTGCATCATGAACCAGCCATCCAGCTGTGCGAGAACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176059 AGGACACATCTTGCATCATGAACCAGCCATCCAGCTGTGCGAGAACCTGT

   3100     .
   2912 TCTTCCTG
        ||||||||
 176109 TCTTCCTG