Result of SIM4 for
pF1KB4222
seq1 = pF1KB4222.tfa, 3021 bp
seq2 = pF1KB4222/gi568815594f_92204657.tfa (gi568815594f:92204657_93872495), 1667839 bp
>pF1KB4222 3021
>gi568815594f:92204657_93872495 (Chr4)
80-244 (385468-385630) 96% ->
245-529 (880339-880623) 100% ->
530-735 (906092-906297) 100% ->
736-789 (1002748-1002801) 100% ->
790-963 (1012082-1012255) 100% ->
964-1125 (1019958-1020119) 100% ->
1126-1245 (1033715-1033834) 100% ->
1246-1347 (1190951-1191052) 99% ->
1348-1545 (1218115-1218312) 100% ->
1546-1858 (1251006-1251318) 100% ->
1859-1997 (1285983-1286121) 100% ->
1998-2193 (1310560-1310755) 100% ->
2194-2360 (1421613-1421779) 100% ->
2361-2601 (1564554-1564794) 100% ->
2602-3021 (1567420-1567839) 100%
0 . : . : . : . : . :
80 TTCACATCGGAGCAATTTTTGATGAATCTGCCAAAAAGGATGATGAGGTA
|| -|-| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385468 TTT C TAGGAGCAATTTTTGATGAATCTGCCAAAAAGGATGATGAGGTA
50 . : . : . : . : . :
130 TTTCGCACTGCGGTTGGTGACCTTAACCAGAATGAGGAGATCTTACAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
385516 TTTCGCACTGCGGTTGGTGACCTTAACCAGAATGAGGAGATCTTACAGAC
100 . : . : . : . : . :
180 TGAGAAAATCACATTTTCAGTGATGTTTGTTGATGGCAACAACCCTTTCC
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
385566 TGAGAAAATCACATTTTCAGTGACGTTTGTTGATGGCAACAACCCTTTCC
150 . : . : . : . : . :
230 AAGCAGTTCAAGAAG CCTGTGAACTTATGAATCAAGGCATC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
385616 AAGCAGTTCAAGAAGGTA...CAGCCTGTGAACTTATGAATCAAGGCATC
200 . : . : . : . : . :
271 TTGGCCCTGGTCAGCTCCATTGGCTGCACGTCAGCAGGATCCCTCCAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
880365 TTGGCCCTGGTCAGCTCCATTGGCTGCACGTCAGCAGGATCCCTCCAGTC
250 . : . : . : . : . :
321 TTTGGCAGACGCCATGCATATCCCCCACCTCTTCATTCAGCGCTCAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
880415 TTTGGCAGACGCCATGCATATCCCCCACCTCTTCATTCAGCGCTCAACAG
300 . : . : . : . : . :
371 CTGGGACCCCAAGGAGTGGCTGTGGACTCACCCGGAGCAACAGGAATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
880465 CTGGGACCCCAAGGAGTGGCTGTGGACTCACCCGGAGCAACAGGAATGAT
350 . : . : . : . : . :
421 GACTACACTCTCTCAGTTCGCCCACCTGTCTACTTGCATGATGTTATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
880515 GACTACACTCTCTCAGTTCGCCCACCTGTCTACTTGCATGATGTTATCCT
400 . : . : . : . : . :
471 AAGAGTGGTCACAGAGTATGCCTGGCAGAAATTCATTATATTCTATGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
880565 AAGAGTGGTCACAGAGTATGCCTGGCAGAAATTCATTATATTCTATGATA
450 . : . : . : . : . :
521 GTGAATACG ATATCCGTGGAATACAGGAGTTCTTGGACAAA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
880615 GTGAATACGGTA...CAGATATCCGTGGAATACAGGAGTTCTTGGACAAA
500 . : . : . : . : . :
562 GTCTCTCAGCAGGGAATGGATGTTGCACTTCAGAAGGTAGAAAACAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906124 GTCTCTCAGCAGGGAATGGATGTTGCACTTCAGAAGGTAGAAAACAACAT
550 . : . : . : . : . :
612 CAATAAAATGATTACCACTCTCTTTGACACCATGAGAATAGAAGAACTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906174 CAATAAAATGATTACCACTCTCTTTGACACCATGAGAATAGAAGAACTGA
600 . : . : . : . : . :
662 ATCGCTATCGAGACACTCTTAGGCGAGCGATCCTTGTTATGAATCCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906224 ATCGCTATCGAGACACTCTTAGGCGAGCGATCCTTGTTATGAATCCTGCT
650 . : . : . : . : . :
712 ACAGCCAAATCCTTCATTACTGAG GTTGTGGAGACTAATTT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
906274 ACAGCCAAATCCTTCATTACTGAGGTA...TAGGTTGTGGAGACTAATTT
700 . : . : . : . : . :
753 GGTTGCTTTTGACTGTCACTGGATCATTATAAATGAG GAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
1002765 GGTTGCTTTTGACTGTCACTGGATCATTATAAATGAGGTA...TAGGAAA
750 . : . : . : . : . :
794 TAAACGATGTGGACGTACAGGAACTTGTAAGAAGGTCAATTGGAAGGTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1012086 TAAACGATGTGGACGTACAGGAACTTGTAAGAAGGTCAATTGGAAGGTTA
800 . : . : . : . : . :
844 ACGATTATTCGGCAGACATTTCCAGTTCCCCAGAACATAAGTCAGCGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1012136 ACGATTATTCGGCAGACATTTCCAGTTCCCCAGAACATAAGTCAGCGGTG
850 . : . : . : . : . :
894 TTTCCGTGGCAACCATCGAATATCTTCAACATTGTGTGATCCAAAGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1012186 TTTCCGTGGCAACCATCGAATATCTTCAACATTGTGTGATCCAAAGGATC
900 . : . : . : . : . :
944 CATTTGCTCAGAATATGGAG ATTTCCAACCTTTACATATAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
1012236 CATTTGCTCAGAATATGGAGGTA...CAGATTTCCAACCTTTACATATAT
950 . : . : . : . : . :
985 GACACGGTGCTTCTGCTTGCTAATGCTTTTCATAAGAAGCTGGAGGACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1019979 GACACGGTGCTTCTGCTTGCTAATGCTTTTCATAAGAAGCTGGAGGACCG
1000 . : . : . : . : . :
1035 AAAGTGGCACAGCATGGCAAGTCTGTCATGTATCAGAAAGAACTCAAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1020029 AAAGTGGCACAGCATGGCAAGTCTGTCATGTATCAGAAAGAACTCAAAGC
1050 . : . : . : . : . :
1085 CCTGGCAGGGTGGGCGCTCCATGTTGGAGACCATCAAGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
1020079 CCTGGCAGGGTGGGCGCTCCATGTTGGAGACCATCAAGAAGGTA...TAG
1100 . : . : . : . : . :
1126 GGTGGAGTTAGTGGGTTGACTGGAGAGCTAGAATTTGGAGAAAATGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1033715 GGTGGAGTTAGTGGGTTGACTGGAGAGCTAGAATTTGGAGAAAATGGAGG
1150 . : . : . : . : . :
1176 CAATCCCAATGTCCACTTTGAAATCCTTGGAACCAACTATGGAGAAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1033765 CAATCCCAATGTCCACTTTGAAATCCTTGGAACCAACTATGGAGAAGAGC
1200 . : . : . : . : . :
1226 TTGGCAGAGGTGTTCGAAAA CTTGGGTGCTGGAATCCTGTC
||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| |||||||||||||||
1033815 TTGGCAGAGGTGTTCGAAAAGTA...CAGCTTGGTTGCTGGAATCCTGTC
1250 . : . : . : . : . :
1267 ACAGGTCTGAATGGGTCACTGACTGACAAGAAATTGGAGAATAACATGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1190972 ACAGGTCTGAATGGGTCACTGACTGACAAGAAATTGGAGAATAACATGCG
1300 . : . : . : . : . :
1317 TGGAGTGGTTCTACGTGTAGTAACTGTTCTG GAAGAACCTT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
1191022 TGGAGTGGTTCTACGTGTAGTAACTGTTCTGGTA...TAGGAAGAACCTT
1350 . : . : . : . : . :
1358 TTGTGATGGTCTCTGAAAATGTCTTGGGTAAGCCGAAGAAATACCAGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1218125 TTGTGATGGTCTCTGAAAATGTCTTGGGTAAGCCGAAGAAATACCAGGGC
1400 . : . : . : . : . :
1408 TTCTCCATTGATGTTTTGGATGCCTTATCTAACTACCTGGGTTTTAACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1218175 TTCTCCATTGATGTTTTGGATGCCTTATCTAACTACCTGGGTTTTAACTA
1450 . : . : . : . : . :
1458 CGAAATTTACGTAGCACCGGATCACAAATACGGAAGCCCACAAGAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1218225 CGAAATTTACGTAGCACCGGATCACAAATACGGAAGCCCACAAGAAGATG
1500 . : . : . : . : . :
1508 GGACATGGAATGGCTTGGTAGGAGAACTTGTCTTTAAG AGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
1218275 GGACATGGAATGGCTTGGTAGGAGAACTTGTCTTTAAGGTA...CAGAGA
1550 . : . : . : . : . :
1549 GCCGACATAGGGATTTCTGCTTTAACCATCACTCCAGATCGTGAAAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251009 GCCGACATAGGGATTTCTGCTTTAACCATCACTCCAGATCGTGAAAATGT
1600 . : . : . : . : . :
1599 GGTGGACTTTACGACACGTTACATGGACTACTCAGTGGGGGTACTACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251059 GGTGGACTTTACGACACGTTACATGGACTACTCAGTGGGGGTACTACTTC
1650 . : . : . : . : . :
1649 GAAGGGCTGAAAAGACAGTGGATATGTTTGCCTGTCTTGCACCATTTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251109 GAAGGGCTGAAAAGACAGTGGATATGTTTGCCTGTCTTGCACCATTTGAT
1700 . : . : . : . : . :
1699 CTCTCTCTATGGGCTTGCATTGCTGGCACAGTCCTTCTGGTGGGTCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251159 CTCTCTCTATGGGCTTGCATTGCTGGCACAGTCCTTCTGGTGGGTCTACT
1750 . : . : . : . : . :
1749 GGTCTACCTCTTGAACTGGCTTAATCCCCCACGATTACAAATGGGATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251209 GGTCTACCTCTTGAACTGGCTTAATCCCCCACGATTACAAATGGGATCAA
1800 . : . : . : . : . :
1799 TGACGTCTACTACTCTCTACAACTCCATGTGGTTTGTGTATGGATCTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1251259 TGACGTCTACTACTCTCTACAACTCCATGTGGTTTGTGTATGGATCTTTT
1850 . : . : . : . : . :
1849 GTACAACAAG GCGGGGAAGTCCCGTACACGACTCTGGCTAC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
1251309 GTACAACAAGGTA...CAGGCGGGGAAGTCCCGTACACGACTCTGGCTAC
1900 . : . : . : . : . :
1890 CCGAATGATGATGGGGGCTTGGTGGCTATTTGCTTTGATTGTTATCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1286014 CCGAATGATGATGGGGGCTTGGTGGCTATTTGCTTTGATTGTTATCTCAT
1950 . : . : . : . : . :
1940 CTTACACGGCAAACCTCGCTGCTTTCCTCACTATTACACGCATTGAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1286064 CTTACACGGCAAACCTCGCTGCTTTCCTCACTATTACACGCATTGAAAGT
2000 . : . : . : . : . :
1990 TCCATCCA GTCTCTCCAGGACCTTTCCAAGCAAACAGAAAT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
1286114 TCCATCCAGTA...AAGGTCTCTCCAGGACCTTTCCAAGCAAACAGAAAT
2050 . : . : . : . : . :
2031 CCCTTATGGCACAGTCCTAGACTCTGCGGTATATGAGCATGTCCGCATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1310593 CCCTTATGGCACAGTCCTAGACTCTGCGGTATATGAGCATGTCCGCATGA
2100 . : . : . : . : . :
2081 AAGGACTGAATCCTTTTGAGAGGGACAGCATGTATTCCCAAATGTGGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1310643 AAGGACTGAATCCTTTTGAGAGGGACAGCATGTATTCCCAAATGTGGCGG
2150 . : . : . : . : . :
2131 ATGATCAACCGAAGCAATGGATCGGAGAACAATGTTCTGGAGTCCCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1310693 ATGATCAACCGAAGCAATGGATCGGAGAACAATGTTCTGGAGTCCCAGGC
2200 . : . : . : . : . :
2181 AGGCATTCAAAAG GTAAAATATGGAAATTATGCTTTCGTAT
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
1310743 AGGCATTCAAAAGGTA...CAGGTAAAATATGGAAATTATGCTTTCGTAT
2250 . : . : . : . : . :
2222 GGGATGCAGCTGTATTGGAATATGTGGCTATCAATGACCCAGATTGTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1421641 GGGATGCAGCTGTATTGGAATATGTGGCTATCAATGACCCAGATTGTTCC
2300 . : . : . : . : . :
2272 TTTTACACCATTGGAAATACTGTTGCTGATCGGGGATATGGAATTGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1421691 TTTTACACCATTGGAAATACTGTTGCTGATCGGGGATATGGAATTGCATT
2350 . : . : . : . : . :
2322 ACAACATGGCAGTCCTTACCGAGATGTTTTTTCACAAAG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
1421741 ACAACATGGCAGTCCTTACCGAGATGTTTTTTCACAAAGGTA...AAGGA
2400 . : . : . : . : . :
2363 TCCTGGAGCTTCAGCAGAATGGTGACATGGACATCCTGAAGCACAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1564556 TCCTGGAGCTTCAGCAGAATGGTGACATGGACATCCTGAAGCACAAATGG
2450 . : . : . : . : . :
2413 TGGCCTAAGAATGGCCAGTGTGACCTGTACTCGTCAGTGGACACAAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1564606 TGGCCTAAGAATGGCCAGTGTGACCTGTACTCGTCAGTGGACACAAAGCA
2500 . : . : . : . : . :
2463 GAAAGGAGGCGCCCTGGACATAAAGAGCTTTGCAGGGGTCTTTTGTATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1564656 GAAAGGAGGCGCCCTGGACATAAAGAGCTTTGCAGGGGTCTTTTGTATCC
2550 . : . : . : . : . :
2513 TGGCTGCTGGAATTGTCCTCTCCTGCTTCATAGCCATGCTGGAGACGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1564706 TGGCTGCTGGAATTGTCCTCTCCTGCTTCATAGCCATGCTGGAGACGTGG
2600 . : . : . : . : . :
2563 TGGAACAAGAGGAAAGGCTCCCGGGTTCCATCAAAAGAG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
1564756 TGGAACAAGAGGAAAGGCTCCCGGGTTCCATCAAAAGAGGTA...CAGGA
2650 . : . : . : . : . :
2604 TGACAAGGAAATTGACCTGGAGCACCTCCATAGACGTGTAAATAGCTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567422 TGACAAGGAAATTGACCTGGAGCACCTCCATAGACGTGTAAATAGCTTGT
2700 . : . : . : . : . :
2654 GCACAGATGACGACAGCCCCCATAAACAGTTTTCCACCTCGTCAATTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567472 GCACAGATGACGACAGCCCCCATAAACAGTTTTCCACCTCGTCAATTGAT
2750 . : . : . : . : . :
2704 TTGACCCCTCTGGACATTGACACTTTGCCAACACGACAAGCACTGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567522 TTGACCCCTCTGGACATTGACACTTTGCCAACACGACAAGCACTGGAGCA
2800 . : . : . : . : . :
2754 AATCAGTGATTTCAGGAACACTCATATTACCACAACAACCTTTATCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567572 AATCAGTGATTTCAGGAACACTCATATTACCACAACAACCTTTATCCCAG
2850 . : . : . : . : . :
2804 AGCAGATCCAGACTCTTAGCCGCACACTGTCAGCTAAAGCTGCTTCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567622 AGCAGATCCAGACTCTTAGCCGCACACTGTCAGCTAAAGCTGCTTCTGGT
2900 . : . : . : . : . :
2854 TTCACTTTTGGCAACGTGCCTGAGCACCGAACTGGCCCTTTTAGGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567672 TTCACTTTTGGCAACGTGCCTGAGCACCGAACTGGCCCTTTTAGGCACAG
2950 . : . : . : . : . :
2904 GGCACCTAATGGGGGCTTTTTCAGGAGTCCTATAAAAACAATGTCATCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567722 GGCACCTAATGGGGGCTTTTTCAGGAGTCCTATAAAAACAATGTCATCTA
3000 . : . : . : . : . :
2954 TTCCTTATCAACCAACTCCTACCCTGGGGCTCAATCTGGGTAATGATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1567772 TTCCTTATCAACCAACTCCTACCCTGGGGCTCAATCTGGGTAATGATCCA
3050 . : .
3004 GACCGAGGCACCTCCATA
||||||||||||||||||
1567822 GACCGAGGCACCTCCATA