seq1 = pF1KB4188.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KB4188/gi568815581r_29103426.tfa (gi568815581r:29103426_29304474), 201049 bp

>pF1KB4188 1071
>gi568815581r:29103426_29304474 (Chr17)

(complement)

1-474  (100001-100474)   99% ==
494-1071  (100475-101049)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCACCAGACCGGCATCCAAGCAAGTGAAGATGTTAAAGAGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCACCAGACCGGCATCCAAGCAAGTGAAGATGTTAAAGAGATCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCAGAGCCAGAAATGGAAAGTACAGACTTCTGAAAATATCTATTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCAGAGCCAGAAATGGAAAGTACAGACTTCTGAAAATATCTATTGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAGCAACTTGTGATTGGATCATATAGTCAGCCTTCAGATTCCTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAGCAACTTGTGATTGGATCATATAGTCAGCCTTCAGATTCCTGGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGATTATGATTCCTTTGTTTTACCCCTGTTGGAGGACAAACAACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGATTATGATTCCTTTGTTTTACCCCTGTTGGAGGACAAACAACCATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTATATATTATTCAGGTTAGATTCTCAGAATGCCCAGGGATATGAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTATATATTATTCAGGTTAGATTCTCAGAATGCCCAGGGATATGAATGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATTCATTGCATGGTCTCCAGATCATTCTCATGTTCGTCAAAAAATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATTCATTGCATGGTCTCCAGATCATTCTCATGTTCGTCAAAAAATGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATGCAGCAACAAGAGCAACTCTGAAGAAGGAATTTGGAGGTGGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATGCAGCAACAAGAGCAACTCTGAAGAAGGAATTTGGAGGTGGCCACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAAGATGAAGTATTTGGAACAGTAAAGGAAGATGTATCATTACATGGAT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAAGATGAAATATTTGGAACAGTAAAGGAAGATGTATCATTACATGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATAAAAAATACTTGCTGTCACAATCTTCCCCTGCCCCACTGACTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATAAAAAATACTTGCTGTCACAATCTTCCCCTGCCCCACTGACTGCAGCT

    450     .    :    .    :
    451 GAGGAAGAACTACGACAGATTAAA
        ||||||||| ||||||||||||||
 100451 GAGGAAGAATTACGACAGATTAAA

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    494 ATCATATTGGGGTACAGACTGACGTGGGTGTGGACACTAAGCATCAAACA
        ||||-||-| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100475 ATCA AT GAGGTACAGACTGACGTGGGTGTGGACACTAAGCATCAAACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544 CTACAAGGAGTAGCATTTCCCATTTCTCGAGAAGCCTTTCAGGCTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100523 CTACAAGGAGTAGCATTTCCCATTTCTCGAGAAGCCTTTCAGGCTTTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594 AAAATTGAATAATAGACAGCTCAACTATGTGCAGTTGGAAATAGATATAA
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100573 AAAATTGAATAACAGACAGCTCAACTATGTGCAGTTGGAAATAGATATAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    644 AAAATGAAATTATAATTTTGGCCAACACAACAAATACAGAACTGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100623 AAAATGAAATTATAATTTTGGCCAACACAACAAATACAGAACTGAAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694 TTGCCAAAGAGGATTCCCAAGGATTCAGCTCGTTACCATTTCTTTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100673 TTGCCAAAGAGGATTCCCAAGGATTCAGCTCGTTACCATTTCTTTCTGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744 TAAACATTCCCATGAAGGAGACTATTTAGAGTCCATAGTTTTTATTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||
 100723 TAAACATTCCCATGAAGGAGACTATTTAGAGTCCATAGTTTT ATTTATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    794 CAATGCCTGGATACACATGCAGTATAAGAGAGCGGATGCTGTATTCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100772 CAATGCCTGGATACACATGCAGTATAAGAGAGCGGATGCTGTATTCTAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844 TGCAAGAGCCGTCTGCTAGAAATTGTAGAAAGACAACTACAAATGGATGT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100822 TGCAAGAGCCCTCTGCTAGAAATTGTAGAAAGACAACTACAAATGGATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    894 AATTAGAAAGATCGAGATAGACAATGGGGATGAGTTGACTGCAGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100872 AATTAGAAAGATCGAGATAGACAATGGGGATGAGTTGACTGCAGACTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    944 TTTATGAAGAAGTACATCCCAAGCAGCATGCACACAAGCAAAGTTTTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100922 TTTATGAAGAAGTACATCCCAAGCAGCAGGCACACAAGCAAAGTTTTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 AAACCAAAAGGTCCTGCAGGAAAAAGAGGAATTCGAAGACTAATTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100972 AAACCAAAAGGTCCTGCAGGAAAAAGAGGAATTCGAAGACTAATTAGGGG

    550     .    :    .    :    .
   1044 CCCAGCGGAAACTGAAGCTACTACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101022 CCCAGCGGAAACTGAAGCTACTACTGAT