seq1 = pF1KB4184.tfa, 1497 bp
seq2 = pF1KB4184/gi568815576f_23762103.tfa (gi568815576f:23762103_23984846), 222744 bp

>pF1KB4184 1497
>gi568815576f:23762103_23984846 (Chr22)

1-30  (95898-95927)   100% ->
31-129  (100002-100100)   100% ->
130-290  (106379-106539)   100% ->
291-415  (113015-113139)   100% ->
416-545  (114940-115069)   100% ->
546-694  (115619-115767)   100% ->
695-882  (120357-120544)   100% ->
883-993  (120657-120767)   100% ->
994-1095  (121670-121771)   100% ->
1096-1171  (121847-121922)   100% ->
1172-1299  (122200-122327)   100% ->
1300-1497  (122547-122744)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCACGCCCTCCTGCGATCTAGAATG         ATTCAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  95898 ATGCTCCACGCCCTCCTGCGATCTAGAATGGTA...CAGATTCAGGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GATCCTGCTCCTGACCATCTGCGCTGCCGGCATTGGTGGGACTTTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 GATCCTGCTCCTGACCATCTGCGCTGCCGGCATTGGTGGGACTTTTCAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGGCTATAACCTCTCTATCATCAATGCCCCGACCTTG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100063 TTGGCTATAACCTCTCTATCATCAATGCCCCGACCTTGGTA...CAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATTCAGGAATTCACCAATGAGACATGGCAGGCGCGTACTGGAGAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106382 ATTCAGGAATTCACCAATGAGACATGGCAGGCGCGTACTGGAGAGCCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCCGATCACCTAGTCCTGCTTATGTGGTCCCTCATCGTGTCTCTGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106432 GCCCGATCACCTAGTCCTGCTTATGTGGTCCCTCATCGTGTCTCTGTATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCTGGGAGGCCTCTTTGGAGCACTGCTTGCAGGTCCCTTGGCCATCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106482 CCCTGGGAGGCCTCTTTGGAGCACTGCTTGCAGGTCCCTTGGCCATCACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGGAAG         GAAGAAGTCCCTCCTGGTGAATAACATCTTTGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106532 CTGGGAAGGTA...AAGGAAGAAGTCCCTCCTGGTGAATAACATCTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTGTCAGCAGCAATCCTGTTTGGATTCAGCCGCAAAGCAGGCTCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113048 GGTGTCAGCAGCAATCCTGTTTGGATTCAGCCGCAAAGCAGGCTCCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGATGATCATGCTGGGAAGACTGCTCGTGGGAGTCAATGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113098 AGATGATCATGCTGGGAAGACTGCTCGTGGGAGTCAATGCAGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    416  GTGTGAGCATGAACATCCAGCCCATGTACCTGGGGGAGAGCGCCCCTAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114939 GGTGTGAGCATGAACATCCAGCCCATGTACCTGGGGGAGAGCGCCCCTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGAGCTCCGAGGAGCTGTGGCCATGAGCTCAGCCATCTTTACGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114989 GGAGCTCCGAGGAGCTGTGGCCATGAGCTCAGCCATCTTTACGGCTCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGATCGTGATGGGACAGGTGGTCGGACTCAG         GGAGCTCCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 115039 GGATCGTGATGGGACAGGTGGTCGGACTCAGGTA...TAGGGAGCTCCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGTGGCCCTCAGGCCTGGCCCCTGCTGCTGGCCAGCTGCCTGGTGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115629 GGTGGCCCTCAGGCCTGGCCCCTGCTGCTGGCCAGCTGCCTGGTGCCCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGCGCTCCAGCTCGCCTCCCTGCCTCTGCTCCCTGAAAGCCCGCGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115679 GGCGCTCCAGCTCGCCTCCCTGCCTCTGCTCCCTGAAAGCCCGCGCTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCCTCATTGACTGTGGAGACACCGAGGCCTGCCTGGCAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115729 TCCTCATTGACTGTGGAGACACCGAGGCCTGCCTGGCAGGTG...CAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTACGGCGGCTCCGGGGCTCCGGGGACTTGGCAGGGGAGCTGGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120359 CTACGGCGGCTCCGGGGCTCCGGGGACTTGGCAGGGGAGCTGGAGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAGGAGGAGCGCGCTGCCTGCCAGGGCTGCCGTGCCCGGCGCCCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120409 GGAGGAGGAGCGCGCTGCCTGCCAGGGCTGCCGTGCCCGGCGCCCATGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTGTTCCAGCATCGGGCCCTGAGGAGACAGGTGACAAGCCTCGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120459 AGCTGTTCCAGCATCGGGCCCTGAGGAGACAGGTGACAAGCCTCGTGGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGGGCAGTGCCATGGAGCTCTGCGGGAATGACTCG         GTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 120509 CTGGGCAGTGCCATGGAGCTCTGCGGGAATGACTCGGTG...CAGGTGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CGCCTACGCCTCCTCCGTGTTCCGGAAGGCAGGAGTGCCGGAAGCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120662 CGCCTACGCCTCCTCCGTGTTCCGGAAGGCAGGAGTGCCGGAAGCGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCCAGTACGCGATCATCGGGACTGGGAGCTGCGAGCTGCTCACGGCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120712 TCCAGTACGCGATCATCGGGACTGGGAGCTGCGAGCTGCTCACGGCGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTTAGT         TGTGTGGTAATCGAGAGGGTGGGTCGGCGCGTGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120762 GTTAGTGTG...CAGTGTGTGGTAATCGAGAGGGTGGGTCGGCGCGTGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCTCATCGGTGGGTACAGCCTGATGACCTGCTGGGGGAGCATCTTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121705 GCTCATCGGTGGGTACAGCCTGATGACCTGCTGGGGGAGCATCTTCACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGCCCTGTGCCTGCAG         AGCTCCTTCCCCTGGACACTCTAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121755 TGGCCCTGTGCCTGCAGGTA...CAGAGCTCCTTCCCCTGGACACTCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTGGCCATGGCCTGCATCTTTGCCTTCATCCTCAGCTTTGGCATTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121871 CTGGCCATGGCCTGCATCTTTGCCTTCATCCTCAGCTTTGGCATTGGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TG         CCGGAGTGACGGGGATCCTGGCCACAGAGCTGTTTGACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121921 TGGTG...TAGCCGGAGTGACGGGGATCCTGGCCACAGAGCTGTTTGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGATGGCCAGGCCTGCTGCCTGCATGGTCTGCGGGGCGCTCATGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122239 AGATGGCCAGGCCTGCTGCCTGCATGGTCTGCGGGGCGCTCATGTGGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ATGCTCATCCTGGTCGGCCTGGGATTTCCCTTTATCATG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 122289 ATGCTCATCCTGGTCGGCCTGGGATTTCCCTTTATCATGGTA...CAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGCCTTGTCCCACTTCCTCTATGTCCCTTTCCTTGGTGTCTGTGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122549 GGCCTTGTCCCACTTCCTCTATGTCCCTTTCCTTGGTGTCTGTGTCTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GGGCCATCTACACTGGCCTGTTCCTTCCTGAGACCAAAGGCAAGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122599 GGGCCATCTACACTGGCCTGTTCCTTCCTGAGACCAAAGGCAAGACCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CAAGAGATCTCCAAGGAATTACACAGACTCAACTTCCCCAGGCGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122649 CAAGAGATCTCCAAGGAATTACACAGACTCAACTTCCCCAGGCGGGCCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1452 GGGCCCCACGTGGAGGAGCCTGGAGGTTATCCAGTCAACAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122699 GGGCCCCACGTGGAGGAGCCTGGAGGTTATCCAGTCAACAGAACTC