seq1 = pF1KB4155.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KB4155/gi568815597r_160899042.tfa (gi568815597r:160899042_161121073), 222032 bp

>pF1KB4155 897
>gi568815597r:160899042_161121073 (Chr1)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-133  (119721-119789)   100% ->
134-241  (119947-120054)   100% ->
242-388  (120297-120443)   100% ->
389-591  (120726-120928)   100% ->
592-694  (121096-121198)   100% ->
695-815  (121327-121438)   91% ->
816-864  (121983-122031)   100% ->
865-897  (122168-122200)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACAAAGGCGCAAGTCGAGAGGAAACTGTTGTGCCTCTTCATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACAAAGGCGCAAGTCGAGAGGAAACTGTTGTGCCTCTTCATATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGATCCTGTTGT         GCTCCCTGGCATTGGGCAGTGTTACAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGATCCTGTTGTGTA...TAGGCTCCCTGGCATTGGGCAGTGTTACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACTCTTCTGAACCTGAAGTCAGAATTCCTGAGAATAATC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 119748 TGCACTCTTCTGAACCTGAAGTCAGAATTCCTGAGAATAATCGTG...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    134  CTGTGAAGTTGTCCTGTGCCTACTCGGGCTTTTCTTCTCCCCGTGTGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119946 GCTGTGAAGTTGTCCTGTGCCTACTCGGGCTTTTCTTCTCCCCGTGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGGAAGTTTGACCAAGGAGACACCACCAGACTCGTTTGCTATAATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119996 GTGGAAGTTTGACCAAGGAGACACCACCAGACTCGTTTGCTATAATAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATCACAG         CTTCCTATGAGGACCGGGTGACCTTCTTGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120046 AGATCACAGGTG...TAGCTTCCTATGAGGACCGGGTGACCTTCTTGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACTGGTATCACCTTCAAGTCCGTGACACGGGAAGACACTGGGACATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120329 ACTGGTATCACCTTCAAGTCCGTGACACGGGAAGACACTGGGACATACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTGTATGGTCTCTGAGGAAGGCGGCAACAGCTATGGGGAGGTCAAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120379 TTGTATGGTCTCTGAGGAAGGCGGCAACAGCTATGGGGAGGTCAAGGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCTCATCGTGCTTG         TGCCTCCATCCAAGCCTACAGTTAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 120429 AGCTCATCGTGCTTGGTA...CAGTGCCTCCATCCAAGCCTACAGTTAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCCCCTCCTCTGCCACCATTGGGAACCGGGCAGTGCTGACATGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120752 ATCCCCTCCTCTGCCACCATTGGGAACCGGGCAGTGCTGACATGCTCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACAAGATGGTTCCCCACCTTCTGAATACACCTGGTTCAAAGATGGGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120802 ACAAGATGGTTCCCCACCTTCTGAATACACCTGGTTCAAAGATGGGATAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATGCCTACGAATCCCAAAAGCACCCGTGCCTTCAGCAACTCTTCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120852 TGATGCCTACGAATCCCAAAAGCACCCGTGCCTTCAGCAACTCTTCCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCCTGAATCCCACAACAGGAGAGCTG         GTCTTTGATCCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 120902 GTCCTGAATCCCACAACAGGAGAGCTGGTA...CAGGTCTTTGATCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTCAGCCTCTGATACTGGAGAATACAGCTGTGAGGCACGGAATGGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121110 GTCAGCCTCTGATACTGGAGAATACAGCTGTGAGGCACGGAATGGGTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGACACCCATGACTTCAAATGCTGTGCGCATGGAAGCTG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121160 GGACACCCATGACTTCAAATGCTGTGCGCATGGAAGCTGGTG...CAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGCGGAATGTGGGGGTCATCGTGGCAGCCGTCCTTGTAACCCTGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121329 GAGCGGAATGTGGGGGTCATCGTGGCAGCCGTCCTTGTAACCCTGATTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTGGGAATCTTGGTTTTTGGCATCTGGTTTGCCTATAGCCGAGGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121379 CCTGGGAATCTTGGTTTTTGGCATCTGGTTTGCCTATAGCCGAGGCCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGACAGAACAAAGAAAGG         GACTTCGAGTAAGAAGGTGATT
        ||||||| |-|-------->>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121429 TTGACAGTA A        GTA...CAGGACTTCGAGTAAGAAGGTGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TACAGCCAGCCTAGTGCCCGAAGTGAA         GGAGAATTCAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 122005 TACAGCCAGCCTAGTGCCCGAAGTGAAGTG...CAGGGAGAATTCAAACA

    950     .    :    .
    879 GACCTCGTCATTCCTGGTG
        |||||||||||||||||||
 122182 GACCTCGTCATTCCTGGTG