seq1 = pF1KB4098.tfa, 1233 bp
seq2 = pF1KB4098/gi568815591r_95485644.tfa (gi568815591r:95485644_95696293), 210650 bp

>pF1KB4098 1233
>gi568815591r:95485644_95696293 (Chr7)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-272  (101130-101271)   100% ->
273-344  (102524-102595)   100% ->
345-529  (103350-103534)   100% ->
530-616  (103697-103783)   100% ->
617-694  (104229-104306)   100% ->
695-771  (106578-106654)   100% ->
772-870  (108469-108567)   100% ->
871-981  (108766-108876)   100% ->
982-1095  (109171-109284)   100% ->
1096-1233  (110513-110650)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGCGGCCCGCTTCGTGCTGCGCAGCGCTGGCTCGCTCAACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGCGGCCCGCTTCGTGCTGCGCAGCGCTGGCTCGCTCAACGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCTGGTGCCCCGAGAGGTGGAGCATTTCTCGCGCTACAGCCCGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCCTGGTGCCCCGAGAGGTGGAGCATTTCTCGCGCTACAGCCCGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGTCCATGAAGCAGCTACTGGACTTTG         GTTCAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 CGCTGTCCATGAAGCAGCTACTGGACTTTGGTG...TAGGTTCAGAAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCATGTGAAAGAACTTCTTTTGCATTTTTGCGACAAGAATTGCCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 GCATGTGAAAGAACTTCTTTTGCATTTTTGCGACAAGAATTGCCTGTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTCGCCAACATTCTGAAGGAAATTGATATCCTCCCGACCCAATTAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101191 ACTCGCCAACATTCTGAAGGAAATTGATATCCTCCCGACCCAATTAGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATACCTCTTCAGTGCAATTGGTTAAAAGCTG         GTATATACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101241 ATACCTCTTCAGTGCAATTGGTTAAAAGCTGGTA...CAGGTATATACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCTGATGGATTTGGTGGAATTCCATGAGAAAAGCCCAGATGACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102534 AGCCTGATGGATTTGGTGGAATTCCATGAGAAAAGCCCAGATGACCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCATTATCAGA         CTTTGTAGATACACTCATCAAAGTTCGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102584 AGCATTATCAGAGTA...TAGCTTTGTAGATACACTCATCAAAGTTCGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAGACACCATAATGTAGTCCCTACAATGGCACAAGGAATCATAGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 ATAGACACCATAATGTAGTCCCTACAATGGCACAAGGAATCATAGAGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAGATGCCTGTACAGTTGACCCAGTCACCAATCAAAATCTTCAATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 AAAGATGCCTGTACAGTTGACCCAGTCACCAATCAAAATCTTCAATATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTGGATCGATTTTACATGAACCGTATTTCTACTCGGATGCTGATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103479 CTTGGATCGATTTTACATGAACCGTATTTCTACTCGGATGCTGATGAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGCACA         TTCTTATATTTAGTGACTCACAGACAGGAAACCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103529 AGCACAGTA...CAGTTCTTATATTTAGTGACTCACAGACAGGAAACCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCCACATTGGAAGCATTGATCCTAACTGTGATGTGGTAGCAGTGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103732 AGCCACATTGGAAGCATTGATCCTAACTGTGATGTGGTAGCAGTGGTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AG         ATGCCTTTGAGTGTTCAAGGATGCTCTGTGATCAGTATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103782 AGGTA...CAGATGCCTTTGAGTGTTCAAGGATGCTCTGTGATCAGTATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATTTATCATCTCCAGAATTAAAGCTTACACAAGTGAATG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104268 ATTTATCATCTCCAGAATTAAAGCTTACACAAGTGAATGGTA...TAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAATTTCCAGACCAACCAATTCACATCGTGTATGTTCCTTCTCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106580 AAATTTCCAGACCAACCAATTCACATCGTGTATGTTCCTTCTCACCTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCATATGCTCTTTGAACTATTTAAG         AATGCAATGCGGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106630 TCATATGCTCTTTGAACTATTTAAGGTA...TAGAATGCAATGCGGGCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAGTTGAACACCAGGAAAATCAGCCTTCCCTTACACCAATAGAGGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108485 CAGTTGAACACCAGGAAAATCAGCCTTCCCTTACACCAATAGAGGTTATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTTGTCTTGGGAAAAGAAGACCTTACCATTAAG         ATTTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108535 GTTGTCTTGGGAAAAGAAGACCTTACCATTAAGGTA...TAGATTTCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAGAGGAGGTGGTGTTCCCCTGAGAATTATTGACCGCCTCTTTAGTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108774 CAGAGGAGGTGGTGTTCCCCTGAGAATTATTGACCGCCTCTTTAGTTATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CATACTCCACTGCACCAACGCCTGTGATGGATAATTCCCGGAATGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108824 CATACTCCACTGCACCAACGCCTGTGATGGATAATTCCCGGAATGCTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTG         GCTGGTTTTGGTTACGGCTTGCCAATTTCTCGTCTGTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108874 TTGGTA...TAGGCTGGTTTTGGTTACGGCTTGCCAATTTCTCGTCTGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGCAAAGTACTTTCAAGGAGATCTGAATCTCTACTCTTTATCAGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109209 TGCAAAGTACTTTCAAGGAGATCTGAATCTCTACTCTTTATCAGGATATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GAACAGATGCTATCATCTACTTAAAG         GCTTTGTCTTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109259 GAACAGATGCTATCATCTACTTAAAGGTA...TAGGCTTTGTCTTCTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TCTATAGAAAAACTTCCAGTTTTTAACAAGTCAGCCTTCAAACATTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110528 TCTATAGAAAAACTTCCAGTTTTTAACAAGTCAGCCTTCAAACATTATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GATGAGCTCTGAGGCTGATGACTGGTGTATCCCAAGCAGGGAACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110578 GATGAGCTCTGAGGCTGATGACTGGTGTATCCCAAGCAGGGAACCAAAGA

   1300     .    :    .    :
   1211 ACCTGGCAAAAGAAGTGGCCATG
        |||||||||||||||||||||||
 110628 ACCTGGCAAAAGAAGTGGCCATG