seq1 = pF1KB4062.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KB4062/gi568815584f_49793737.tfa (gi568815584f:49793737_49994261), 200525 bp

>pF1KB4062 525
>gi568815584f:49793737_49994261 (Chr14)

1-525  (100001-100525)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAGGTGCTATCCAAAATCTTCGGGAACAAGGAAATGCGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAGGTGCTATCCAAAATCTTCGGGAACAAGGAAATGCGGATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGTTGGGCCTGGACGCGGCCGGCAAGACAACAATCCTGTACAAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGTTGGGCCTGGACGCGGCCGGCAAGACAACAATCCTGTACAAGTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGGGCCAGTCGGTGACCACCATTCCCACTGTGGGTTTCAACGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGGGCCAGTCGGTGACCACCATTCCCACTGTGGGTTTCAACGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGGTGACTTACAAAAATGTCAAGTTCAACGTATGGGATGTGGGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACGGTGACTTACAAAAATGTCAAGTTCAACGTATGGGATGTGGGCGGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACAAGATCCGGCCGCTCTGGCGGCATTACTACACTGGGACCCAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACAAGATCCGGCCGCTCTGGCGGCATTACTACACTGGGACCCAAGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCTTCGTAGTGGACTGCGCCGACCGCGACCGCATCGATGAGGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCTTCGTAGTGGACTGCGCCGACCGCGACCGCATCGATGAGGCTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGAGCTGCACCGCATTATCAATGATCGGGAGATGAGGGACGCCATAAT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGAGCTGCACCGCATTATCAATGACCGGGAGATGAGGGACGCCATAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCATCTTCGCCAACAAGCAGGACCTGCCCGATGCCATGAAACCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCATCTTCGCCAACAAGCAGGACCTGCCCGATGCCATGAAACCCCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGATCCAGGAGAAACTGGGCCTGACCCGGATTCGGGACAGGAACTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGATCCAGGAGAAACTGGGCCTGACCCGGATTCGGGACAGGAACTGGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCAGCCCTCCTGTGCCACCTCAGGGGACGGACTCTATGAGGGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGCAGCCCTCCTGTGCCACCTCAGGGGACGGACTCTATGAGGGGCTCAC

    500     .    :    .    :    .
    501 ATGGTTAACCTCTAACTACAAATCT
        |||||||||||||||||||||||||
 100501 ATGGTTAACCTCTAACTACAAATCT