seq1 = pF1KB4058.tfa, 1611 bp
seq2 = pF1KB4058/gi568815592r_33094685.tfa (gi568815592r:33094685_33300476), 205792 bp

>pF1KB4058 1611
>gi568815592r:33094685_33300476 (Chr6)

(complement)

1-235  (100001-100235)   100% ->
236-483  (101061-101308)   100% ->
484-640  (102013-102169)   100% ->
641-820  (102536-102715)   100% ->
821-993  (103871-104043)   100% ->
994-1123  (104441-104570)   100% ->
1124-1256  (104775-104907)   99% ->
1257-1360  (105011-105114)   100% ->
1361-1466  (105427-105532)   100% ->
1467-1611  (105648-105792)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTGGGCCGCTCGCCCGCCCTTCCTCCCTCAGCGGCATGCCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTGGGCCGCTCGCCCGCCCTTCCTCCCTCAGCGGCATGCCGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGTGTGGGCCGGTGGGGGTGCGAAAAGAAATGCATTGTGGGGTCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGTGTGGGCCGGTGGGGGTGCGAAAAGAAATGCATTGTGGGGTCGCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGGTGGCGGCGGCGACGGCCCTGGCTGGATCCCGCAGCGGCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGGTGGCGGCGGCGACGGCCCTGGCTGGATCCCGCAGCGGCGGCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCGGTGGCAGGCGGAGAACAACAAACCCCGGAGCCGGAGCCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGCGGTGGCAGGCGGAGAACAACAAACCCCGGAGCCGGAGCCAGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCTGGACGGGACGGGATGGGCGACAGCGGGCGGG         ACTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100201 GGCTGGACGGGACGGGATGGGCGACAGCGGGCGGGGTG...CAGACTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAAGCCCAGACAGCTCCTCCCCAAATCCCCTTCCCCAGGGAGTCCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101067 GAAGCCCAGACAGCTCCTCCCCAAATCCCCTTCCCCAGGGAGTCCCTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTTCTCCTCCTGGGCCACCCCTACCCCCTTCAACAGCTCCATCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101117 CCTTCTCCTCCTGGGCCACCCCTACCCCCTTCAACAGCTCCATCCCTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGGCTCTGGGGCCCCACCCCCACCCCCGATGCCACCACCCCCACTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101167 AGGCTCTGGGGCCCCACCCCCACCCCCGATGCCACCACCCCCACTGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTCCCTTTCCAGTCATCAGTTCTTCCATGGGGTCCCCTGGTCTGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101217 CTCCCTTTCCAGTCATCAGTTCTTCCATGGGGTCCCCTGGTCTGCCCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCAGCTCCCCCAGGATTCTCCGGGCCTGTCAGCAGCCCCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101267 CCAGCTCCCCCAGGATTCTCCGGGCCTGTCAGCAGCCCCCAGGTG...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    484  ATTAACTCAACAGTGTCACTCCCTGGGGGTGGGTCTGGCCCCCCTGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 GATTAACTCAACAGTGTCACTCCCTGGGGGTGGGTCTGGCCCCCCTGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGTGAAGCCACCAGTCTTAGGGGTCCGGGGCCTGCACTGTCCACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102062 ATGTGAAGCCACCAGTCTTAGGGGTCCGGGGCCTGCACTGTCCACCCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCAGGTGGCCCTGGGGCTGGCAAACGGCTATGTGCAATCTGCGGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 CCAGGTGGCCCTGGGGCTGGCAAACGGCTATGTGCAATCTGCGGGGACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AAGCTCAG         GCAAACACTACGGGGTTTACAGCTGTGAGGGTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102162 AAGCTCAGGTA...TAGGCAAACACTACGGGGTTTACAGCTGTGAGGGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCAAGGGCTTCTTCAAACGCACCATCCGCAAAGACCTTACATACTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102569 GCAAGGGCTTCTTCAAACGCACCATCCGCAAAGACCTTACATACTCTTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGGGACAACAAAGACTGCACAGTGGACAAGCGCCAGCGGAACCGCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102619 CGGGACAACAAAGACTGCACAGTGGACAAGCGCCAGCGGAACCGCTGTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTACTGCCGCTATCAGAAGTGCCTGGCCACTGGCATGAAGAGGGAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102669 GTACTGCCGCTATCAGAAGTGCCTGGCCACTGGCATGAAGAGGGAGGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    821       CGGTACAGGAGGAGCGTCAGCGGGGAAAGGACAAGGATGGGGAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102719 ...CAGCGGTACAGGAGGAGCGTCAGCGGGGAAAGGACAAGGATGGGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGGGAGGGGGCTGGGGGAGCCCCCGAGGAGATGCCTGTGGACAGGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103915 GGGGAGGGGGCTGGGGGAGCCCCCGAGGAGATGCCTGTGGACAGGATCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGAGGCAGAGCTTGCTGTGGAACAGAAGAGTGACCAGGGCGTTGAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103965 GGAGGCAGAGCTTGCTGTGGAACAGAAGAGTGACCAGGGCGTTGAGGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTGGGGGAACCGGGGGTAGCGGCAGCAGC         CCAAATGACCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104015 CTGGGGGAACCGGGGGTAGCGGCAGCAGCGTG...CAGCCAAATGACCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTGACTAACATCTGTCAGGCAGCTGACAAACAGCTATTCACGCTTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104453 GTGACTAACATCTGTCAGGCAGCTGACAAACAGCTATTCACGCTTGTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTGGGCGAAGAGGATCCCACACTTTTCCTCCTTGCCTCTGGATGATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104503 GTGGGCGAAGAGGATCCCACACTTTTCCTCCTTGCCTCTGGATGATCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCATATTGCTGCGGGCAG         GCTGGAATGAACTCCTCATTGCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104553 TCATATTGCTGCGGGCAGGTC...CAGGCTGGAATGAACTCCTCATTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCCTTTTCACACCGATCCATTGATGTTCGAGATGGCATCCTCCTTGCCAC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104798 TCCTTCTCACACCGATCCATTGATGTTCGAGATGGCATCCTCCTTGCCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGGTCTTCACGTGCACCGCAACTCAGCCCATTCAGCAGGAGTAGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104848 AGGTCTTCACGTGCACCGCAACTCAGCCCATTCAGCAGGAGTAGGAGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TCTTTGATCG         GTCCCTCTCCAGGGTGCTGACAGAGCTAGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104898 TCTTTGATCGGTC...CAGGTCCCTCTCCAGGGTGCTGACAGAGCTAGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TCCAAAATGCGTGACATGAGGATGGACAAGACAGAGCTTGGCTGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105042 TCCAAAATGCGTGACATGAGGATGGACAAGACAGAGCTTGGCTGCCTGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGCAATCATTCTGTTTAATCCAG         ATGCCAAGGGCCTCTCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105092 GGCAATCATTCTGTTTAATCCAGGTA...CAGATGCCAAGGGCCTCTCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACCCTAGTGAGGTGGAGGTCCTGCGGGAGAAAGTGTATGCATCACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105445 ACCCTAGTGAGGTGGAGGTCCTGCGGGAGAAAGTGTATGCATCACTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACCTACTGCAAACAGAAGTACCCTGAGCAGCAGGGACG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105495 ACCTACTGCAAACAGAAGTACCCTGAGCAGCAGGGACGGTG...CAGGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGCCAAGCTGCTGCTACGTCTTCCTGCCCTCCGGTCCATTGGCCTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105651 TGCCAAGCTGCTGCTACGTCTTCCTGCCCTCCGGTCCATTGGCCTTAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GTCTAGAGCATCTGTTTTTCTTCAAGCTCATTGGTGACACCCCCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105701 GTCTAGAGCATCTGTTTTTCTTCAAGCTCATTGGTGACACCCCCATCGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 ACCTTCCTCATGGAGATGCTTGAGGCTCCCCATCAACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105751 ACCTTCCTCATGGAGATGCTTGAGGCTCCCCATCAACTGGCC