seq1 = pF1KB4057.tfa, 2061 bp
seq2 = pF1KB4057/gi568815578r_38030222.tfa (gi568815578r:38030222_38261600), 231379 bp

>pF1KB4057 2061
>gi568815578r:38030222_38261600 (Chr20)

(complement)

10-190  (100001-100181)   100% ->
191-433  (105512-105754)   100% ->
434-552  (110544-110662)   100% ->
553-681  (113512-113640)   100% ->
682-859  (114707-114884)   100% ->
860-995  (119402-119537)   100% ->
996-1099  (120216-120319)   100% ->
1100-1342  (121947-122189)   100% ->
1343-1615  (123216-123488)   100% ->
1616-1776  (129101-129261)   100% ->
1777-1913  (130372-130508)   100% ->
1914-2061  (131232-131379)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 GAGCTGGTCTTAGAGAGGTGTGATCTGGAGCTGGAGACCAATGGCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GAGCTGGTCTTAGAGAGGTGTGATCTGGAGCTGGAGACCAATGGCCGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 CCACCACACGGCCGACCTGTGCCGGGAGAAGCTGGTGGTGCGACGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACCACACGGCCGACCTGTGCCGGGAGAAGCTGGTGGTGCGACGGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 AGCCCTTCTGGCTGACCCTGCACTTTGAGGGCCGCAACTACGAGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCCTTCTGGCTGACCCTGCACTTTGAGGGCCGCAACTACGAGGCCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    160 GTAGACAGTCTCACCTTCAGTGTCGTGACCG         GCCCAGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 GTAGACAGTCTCACCTTCAGTGTCGTGACCGGTG...CAGGCCCAGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGCCAGGAGGCCGGGACCAAGGCCCGTTTTCCACTAAGAGATGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105522 TAGCCAGGAGGCCGGGACCAAGGCCCGTTTTCCACTAAGAGATGCTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGGGTGACTGGACAGCCACCGTGGTGGACCAGCAAGACTGCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105572 AGGAGGGTGACTGGACAGCCACCGTGGTGGACCAGCAAGACTGCACCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCGCTGCAGCTCACCACCCCGGCCAACGCCCCCATCGGCCTGTATCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105622 TCGCTGCAGCTCACCACCCCGGCCAACGCCCCCATCGGCCTGTATCGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCCTGGAGGCCTCCACTGGCTACCAGGGATCCAGCTTTGTGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105672 CAGCCTGGAGGCCTCCACTGGCTACCAGGGATCCAGCTTTGTGCTGGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTTCATTTTGCTCTTCAACGCCTGGTGCCCAG         CGGATGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105722 ACTTCATTTTGCTCTTCAACGCCTGGTGCCCAGGTG...CAGCGGATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGTACCTGGACTCGGAAGAGGAGCGGCAGGAGTATGTCCTCACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110552 GTGTACCTGGACTCGGAAGAGGAGCGGCAGGAGTATGTCCTCACCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCTTTATCTACCAGGGCTCGGCCAAGTTCATCAAGAACATACCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110602 GGGCTTTATCTACCAGGGCTCGGCCAAGTTCATCAAGAACATACCTTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATTTTGGGCAG         TTTGAAGATGGGATCCTAGACATCTGCCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110652 ATTTTGGGCAGGTA...CAGTTTGAAGATGGGATCCTAGACATCTGCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATCCTTCTAGATGTCAACCCCAAGTTCCTGAAGAACGCCGGCCGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113542 ATCCTTCTAGATGTCAACCCCAAGTTCCTGAAGAACGCCGGCCGTGACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTCCCGCCGCAGCAGCCCCGTCTACGTGGGCCGGGTGGTGAGTGGCATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 113592 CTCCCGCCGCAGCAGCCCCGTCTACGTGGGCCGGGTGGTGAGTGGCATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682         GTCAACTGCAACGATGACCAGGGTGTGCTGCTGGGACGCTGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113642 TG...CAGGTCAACTGCAACGATGACCAGGGTGTGCTGCTGGGACGCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACAACAACTACGGGGACGGCGTCAGCCCCATGTCCTGGATCGGCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114749 GACAACAACTACGGGGACGGCGTCAGCCCCATGTCCTGGATCGGCAGCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGACATCCTGCGGCGCTGGAAGAACCACGGCTGCCAGCGCGTCAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114799 GGACATCCTGCGGCGCTGGAAGAACCACGGCTGCCAGCGCGTCAAGTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCCAGTGCTGGGTCTTCGCCGCCGTGGCCTGCACAG         TGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114849 GCCAGTGCTGGGTCTTCGCCGCCGTGGCCTGCACAGGTG...CAGTGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGGTGCCTGGGCATCCCTACCCGCGTCGTGACCAACTACAACTCGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119407 AGGTGCCTGGGCATCCCTACCCGCGTCGTGACCAACTACAACTCGGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGACCAGAACAGCAACCTTCTCATCGAGTACTTCCGCAATGAGTTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119457 TGACCAGAACAGCAACCTTCTCATCGAGTACTTCCGCAATGAGTTTGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGATCCAGGGTGACAAGAGCGAGATGATCTG         GAACTTCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119507 AGATCCAGGGTGACAAGAGCGAGATGATCTGGTG...CAGGAACTTCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TGCTGGGTGGAGTCGTGGATGACCAGGCCGGACCTGCAGCCGGGGTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120226 TGCTGGGTGGAGTCGTGGATGACCAGGCCGGACCTGCAGCCGGGGTACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGGCTGGCAGGCCCTGGACCCAACGCCCCAGGAGAAGAGCGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 120276 GGGCTGGCAGGCCCTGGACCCAACGCCCCAGGAGAAGAGCGAAGGTG...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1100    GGACGTACTGCTGTGGCCCAGTTCCAGTTCGTGCCATCAAGGAGGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121944 CAGGGACGTACTGCTGTGGCCCAGTTCCAGTTCGTGCCATCAAGGAGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GACCTGAGCACCAAGTACGATGCGCCCTTTGTCTTTGCGGAGGTCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121994 GACCTGAGCACCAAGTACGATGCGCCCTTTGTCTTTGCGGAGGTCAATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CGACGTGGTAGACTGGATCCAGCAGGACGATGGGTCTGTGCACAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122044 CGACGTGGTAGACTGGATCCAGCAGGACGATGGGTCTGTGCACAAATCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TCAACCGTTCCCTGATCGTTGGGCTGAAGATCAGCACTAAGAGCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122094 TCAACCGTTCCCTGATCGTTGGGCTGAAGATCAGCACTAAGAGCGTGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CGAGACGAGCGGGAGGATATCACCCACACCTACAAATACCCAGAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122144 CGAGACGAGCGGGAGGATATCACCCACACCTACAAATACCCAGAGGGTA.

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343      GGTCCTCAGAGGAGAGGGAGGCCTTCACAAGGGCGAACCACCTGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122194 ..CAGGGTCCTCAGAGGAGAGGGAGGCCTTCACAAGGGCGAACCACCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ACAAACTGGCCGAGAAGGAGGAGACAGGGATGGCCATGCGGATCCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123261 ACAAACTGGCCGAGAAGGAGGAGACAGGGATGGCCATGCGGATCCGTGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GGCCAGAGCATGAACATGGGCAGTGACTTTGACGTCTTTGCCCACATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123311 GGCCAGAGCATGAACATGGGCAGTGACTTTGACGTCTTTGCCCACATCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CAACAACACCGCTGAGGAGTACGTCTGCCGCCTCCTGCTCTGTGCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123361 CAACAACACCGCTGAGGAGTACGTCTGCCGCCTCCTGCTCTGTGCCCGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCGTCAGCTACAATGGGATCTTGGGGCCCGAGTGTGGCACCAAGTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123411 CCGTCAGCTACAATGGGATCTTGGGGCCCGAGTGTGGCACCAAGTACCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CTCAACCTCAACCTGGAGCCTTTCTCTG         AGAAGAGCGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 123461 CTCAACCTCAACCTGGAGCCTTTCTCTGGTA...CAGAGAAGAGCGTTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TCTTTGCATCCTCTATGAGAAATACCGTGACTGCCTTACGGAGTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129114 TCTTTGCATCCTCTATGAGAAATACCGTGACTGCCTTACGGAGTCCAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TCATCAAGGTGCGGGCCCTCCTCGTGGAGCCAGTTATCAACAGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129164 TCATCAAGGTGCGGGCCCTCCTCGTGGAGCCAGTTATCAACAGCTACCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CTGGCTGAGAGGGACCTCTACCTGGAGAATCCAGAAATCAAGATCCGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129214 CTGGCTGAGAGGGACCTCTACCTGGAGAATCCAGAAATCAAGATCCGGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1777        ATCCTTGGGGAGCCCAAGCAGAAACGCAAGCTGGTGGCTGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129264 A...CAGATCCTTGGGGAGCCCAAGCAGAAACGCAAGCTGGTGGCTGAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 TGTCCCTGCAGAACCCGCTCCCTGTGGCCCTGGAAGGCTGCACCTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130415 TGTCCCTGCAGAACCCGCTCCCTGTGGCCCTGGAAGGCTGCACCTTCACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GTGGAGGGGGCCGGCCTGACTGAGGAGCAGAAGACGGTGGAGAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 130465 GTGGAGGGGGCCGGCCTGACTGAGGAGCAGAAGACGGTGGAGATGTA...

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1914    CCCAGACCCCGTGGAGGCAGGGGAGGAAGTTAAGGTGAGAATGGACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131229 CAGCCCAGACCCCGTGGAGGCAGGGGAGGAAGTTAAGGTGAGAATGGACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 TGCTGCCGCTCCACATGGGCCTCCACAAGCTGGTGGTGAACTTCGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131279 TGCTGCCGCTCCACATGGGCCTCCACAAGCTGGTGGTGAACTTCGAGAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GACAAGCTGAAGGCTGTGAAGGGCTTCCGGAATGTCATCATTGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131329 GACAAGCTGAAGGCTGTGAAGGGCTTCCGGAATGTCATCATTGGCCCCGC

   2150 
   2061 C
        |
 131379 C