seq1 = pF1KB4054.tfa, 414 bp
seq2 = pF1KB4054/gi568815596f_111023746.tfa (gi568815596f:111023746_111264228), 240483 bp

>pF1KB4054 414
>gi568815596f:111023746_111264228 (Chr2)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-214  (100305-100394)   100% ->
215-318  (126299-126402)   99% ->
319-414  (140388-140483)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAAGCAACCTTCTGATGTAAGTTCTGAGTGTGACCGAGAAGGTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCCTCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAATTGCAGCCTGCGGAGAGGCCTCCCCAGCTCAGACCTGGGGCCCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCCTACAGACAGAGCCACAAG         ACAGGAGCCCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 CCTCCCTACAGACAGAGCCACAAGGTA...CAGACAGGAGCCCAGCACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100322 ATGAGTTGTGACAAATCAACACAAACCCCAAGTCCTCCTTGCCAGGCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACCACTATCTCAGTGCAATGG         CTTCCATGAGGCAGGCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100372 CAACCACTATCTCAGTGCAATGGGTA...CAGCTTCCATGAGGCAGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATCGCCCAAGAGTTGCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126317 AACCTGCAGATATGCGCCCAGAGATATGGATCGCCCAAGAGTTGCGGCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGG         GTATT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 126367 ATTGGAGACGAGTTTAACGCTTACTATGCAAGGAGGGTA...CAGGTATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTGAATAATTACCAAGCAGCCGAAGACCACCCACGAATGGTTATCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140393 TTTGAATAATTACCAAGCAGCCGAAGACCACCCACGAATGGTTATCTTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GACTGTTACGTTACATTGTCCGCCTGGTGTGGAGAATGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140443 GACTGTTACGTTACATTGTCCGCCTGGTGTGGAGAATGCAT