seq1 = pF1KB4041.tfa, 1389 bp
seq2 = pF1KB4041/gi568815579f_53471601.tfa (gi568815579f:53471601_53677949), 206349 bp

>pF1KB4041 1389
>gi568815579f:53471601_53677949 (Chr19)

1-136  (99995-100130)   97% ->
137-1389  (105097-106349)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGGGTTTGGTGACGTTCGCCGACGTAGCCATAGACTTTTCTCA
         ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CTGTTTCAGGGTTTGGTGACGTTCGCCGACGTAGCCATAGACTTTTCTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGTGGGCCTGTCTGAACTCTGCTCAGAGGGACCTGTACTGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 GGAGGAGTGGGCCTGTCTGAACTCTGCTCAGAGGGACCTGTACTGGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGCTGGAGAACTACAGTAACTTGGTCTCACTGG         ATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100095 TGATGCTGGAGAACTACAGTAACTTGGTCTCACTGGGTG...CAGATTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGTCAGCATATGAAAATAAGAGTTTACCTACAGAAAAAAACATTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105102 GAGTCAGCATATGAAAATAAGAGTTTACCTACAGAAAAAAACATTCATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATAAGGGCTTCCAAAAGGAATTCAGATAGAAGAAGTAAATCCCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105152 AATAAGGGCTTCCAAAAGGAATTCAGATAGAAGAAGTAAATCCCTTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTAACTGGATATGTGAAGGTACGCTTGAAAGACCACAGCGCTCCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105202 GTAACTGGATATGTGAAGGTACGCTTGAAAGACCACAGCGCTCCAGAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGTATGTCAATCAGATGATCATCAATTATGTCAAAAGACCTGCTACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105252 AGGTATGTCAATCAGATGATCATCAATTATGTCAAAAGACCTGCTACTAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAGGCACCCCTCCTAGAACACATCAGAGACATCATAAGGAGAATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105302 AGAAGGCACCCCTCCTAGAACACATCAGAGACATCATAAGGAGAATTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTGAATGTAAGGACTGTGGGAAGGCCTTTAGTCGTGGCTATCAACTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105352 TTGAATGTAAGGACTGTGGGAAGGCCTTTAGTCGTGGCTATCAACTTAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAACATCAGAAAATCCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105402 CAACATCAGAAAATCCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TAAGAAGGCCTTCCGTTGGGGCAATCAGCTTACTCAACATCAAAAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105452 TAAGAAGGCCTTCCGTTGGGGCAATCAGCTTACTCAACATCAAAAAATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105502 ATACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TGGGGCTCAAGCCTCGTTATTCATAAGAGGATTCATACTGGTGAAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105552 TGGGGCTCAAGCCTCGTTATTCATAAGAGGATTCATACTGGTGAAAAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTATGAATGTAAAGACTGTGGAAAGGCCTTTCGGCGTGGTGATGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105602 CTATGAATGTAAAGACTGTGGAAAGGCCTTTCGGCGTGGTGATGAGCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCAGCACCAGAGATTCCACACTGGGGAGAAAGACTACGAATGCAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105652 CTCAGCACCAGAGATTCCACACTGGGGAGAAAGACTACGAATGCAAAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGTGGGAAGACCTTTAGCCGTGTGTATAAACTTATTCAGCACAAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105702 TGTGGGAAGACCTTTAGCCGTGTGTATAAACTTATTCAGCACAAGAGAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCATAGTGGGGAGAAGCCTTACGAGTGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105752 TCATAGTGGGGAGAAGCCTTACGAGTGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTTGTGGTTCAAGCCTCATTCAGCATAAAAGAATTCACACAGGTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105802 TTTGTGGTTCAAGCCTCATTCAGCATAAAAGAATTCACACAGGTGAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CCCTATGAATGTCAAGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCGAGTCAATTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105852 CCCTATGAATGTCAAGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCGAGTCAATTACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TACTCAGCATCAGAAGATCCACACCGGTGAGAAGCCTCACGAATGTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105902 TACTCAGCATCAGAAGATCCACACCGGTGAGAAGCCTCACGAATGTAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGTGTGGGAAGGCCTTTCGCTGGGGTTCGAGCCTCGTTAAGCACGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105952 AGTGTGGGAAGGCCTTTCGCTGGGGTTCGAGCCTCGTTAAGCACGAGAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATACATACGGGCGAGAAGCCGTACAAGTGCACAGAATGTGGGAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106002 ATACATACGGGCGAGAAGCCGTACAAGTGCACAGAATGTGGGAAGGCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CAATTGTGGCTATCACCTCACTCAGCACGAGAGAATCCACACAGGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106052 CAATTGTGGCTATCACCTCACTCAGCACGAGAGAATCCACACAGGCGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCCCGTATAAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCTTTCATTTATGGATCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106102 CCCCGTATAAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCTTTCATTTATGGATCGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CTCGTGAAACATGAGAGAATTCATACCGGGGTGAAACCCTATGGGTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106152 CTCGTGAAACATGAGAGAATTCATACCGGGGTGAAACCCTATGGGTGTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGAATGTGGGAAGAGCTTTAGTCACGGCCATCAGCTTACACAACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106202 AGAATGTGGGAAGAGCTTTAGTCACGGCCATCAGCTTACACAACATCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AAACGCACAGTGGGGCGAAATCCTACGAATGTAAGGAGTGCGGGAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106252 AAACGCACAGTGGGGCGAAATCCTACGAATGTAAGGAGTGCGGGAAGGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1342 TGTAACCACCTAAACCATCTCCGAGAACATCAGAGGATCCACAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106302 TGTAACCACCTAAACCATCTCCGAGAACATCAGAGGATCCACAACAGT