seq1 = pF1KB3981.tfa, 546 bp
seq2 = pF1KB3981/gi568815588r_102576897.tfa (gi568815588r:102576897_102805490), 228594 bp

>pF1KB3981 546
>gi568815588r:102576897_102805490 (Chr10)

(complement)

1-147  (99999-100145)   99% ->
148-264  (106002-106118)   100% ->
265-315  (115548-115598)   100% ->
316-501  (119490-119675)   100% ->
502-546  (128550-128594)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTTGCTCTCAATTTTGCGCAAGTTGAAAAGTGCACCAGACCAGGA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 AAGGGCTTGCTCTCAATTTTGCGCAAGTTGAAAAGTGCACCAGACCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGAGAATACTTCTCCTGGGCTTGGATAATGCTGGCAAGACCACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GGTGAGAATACTTCTCCTGGGCTTGGATAATGCTGGCAAGACCACTCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAAGCAGCTTGCATCTGAAGACATCAGCCACATCACACCTACACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100099 TGAAGCAGCTTGCATCTGAAGACATCAGCCACATCACACCTACACAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       GGTTTCAACATCAAAAGTGTACAATCACAAGGTTTTAAACTGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 ...CAGGGTTTCAACATCAAAAGTGTACAATCACAAGGTTTTAAACTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTATGGGACATTGGTGGACAGAGGAAAATCAGACCATACTGGAAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106046 TGTATGGGACATTGGTGGACAGAGGAAAATCAGACCATACTGGAAGAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTTTGAAAATACCGATATTCTT         ATATATGTAATCGACAGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106096 ATTTTGAAAATACCGATATTCTTGTA...TAGATATATGTAATCGACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGACAGAAAAAGATTTGAAGAGACGGGTCAG         GAACTAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115566 GCAGACAGAAAAAGATTTGAAGAGACGGGTCAGGTA...CAGGAACTAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAATTACTGGAGGAAGAAAAACTAAGTTGTGTGCCAGTGCTCATCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119498 GGAATTACTGGAGGAAGAAAAACTAAGTTGTGTGCCAGTGCTCATCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTAATAAGCAGGATTTGCTCACAGCAGCCCCTGCCTCTGAAATTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119548 CTAATAAGCAGGATTTGCTCACAGCAGCCCCTGCCTCTGAAATTGCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGACTGAACCTGCATACCATCCGCGACCGAGTCTGGCAGATCCAGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119598 GGACTGAACCTGCATACCATCCGCGACCGAGTCTGGCAGATCCAGTCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCAGCTCTCACAGGAGAGGGCGTTCAG         GATGGCATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 119648 CTCAGCTCTCACAGGAGAGGGCGTTCAGGTG...AAGGATGGCATGAACT

    550     .    :    .    :    .    :
    515 GGGTCTGCAAAAATGTCAATGCAAAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 128563 GGGTCTGCAAAAATGTCAATGCAAAGAAGAAA