seq1 = pF1KB3912.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KB3912/gi568815586r_102302510.tfa (gi568815586r:102302510_102580381), 277872 bp

>pF1KB3912 459
>gi568815586r:102302510_102580381 (Chr12)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-220  (104583-104739)   100% ->
221-402  (160692-160873)   100% ->
403-459  (177816-177872)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAAAATCAGCAGTCTTCCAACCCAATTATTTAAGTGCTGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAAAATCAGCAGTCTTCCAACCCAATTATTTAAGTGCTGCTTTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATTTCTTGAAG         GTGAAGATGCACACCATGTCCTCCTCGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATTTCTTGAAGGTA...CAGGTGAAGATGCACACCATGTCCTCCTCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCTCTTCTACCTGGCGCTGTGCCTGCTCACCTTCACCAGCTCTGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104611 ATCTCTTCTACCTGGCGCTGTGCCTGCTCACCTTCACCAGCTCTGCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGGACCGGAGACGCTCTGCGGGGCTGAGCTGGTGGATGCTCTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104661 GCTGGACCGGAGACGCTCTGCGGGGCTGAGCTGGTGGATGCTCTTCAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGTGTGGAGACAGGGGCTTTTATTTCA         ACAAGCCCACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104711 CGTGTGTGGAGACAGGGGCTTTTATTTCAGTA...CAGACAAGCCCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTATGGCTCCAGCAGTCGGAGGGCGCCTCAGACAGGCATCGTGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160704 GGTATGGCTCCAGCAGTCGGAGGGCGCCTCAGACAGGCATCGTGGATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCTGCTTCCGGAGCTGTGATCTAAGGAGGCTGGAGATGTATTGCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160754 TGCTGCTTCCGGAGCTGTGATCTAAGGAGGCTGGAGATGTATTGCGCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCAAGCCTGCCAAGTCAGCTCGCTCTGTCCGTGCCCAGCGCCACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160804 CCTCAAGCCTGCCAAGTCAGCTCGCTCTGTCCGTGCCCAGCGCCACACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACATGCCCAAGACCCAGAAG         GAAGTACATTTGAAGAACGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 160854 ACATGCCCAAGACCCAGAAGGTA...TAGGAAGTACATTTGAAGAACGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 AGTAGAGGGAGTGCAGGAAACAAGAACTACAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177837 AGTAGAGGGAGTGCAGGAAACAAGAACTACAGGATG