seq1 = pF1KB3821.tfa, 1269 bp
seq2 = pF1KB3821/gi568815580r_57450715.tfa (gi568815580r:57450715_57686620), 235906 bp

>pF1KB3821 1269
>gi568815580r:57450715_57686620 (Chr18)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-194  (106422-106548)   100% ->
195-314  (113256-113375)   100% ->
315-463  (115081-115229)   100% ->
464-598  (120040-120174)   100% ->
599-705  (123641-123747)   100% ->
706-804  (127378-127476)   98% ->
805-912  (131669-131776)   100% ->
913-1077  (132197-132361)   99% ->
1078-1137  (135247-135306)   100% ->
1138-1269  (135775-135906)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTTCACTCGGCGCAAACATGGCTGCGGCCCTGCGCGCCGCGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTTCACTCGGCGCAAACATGGCTGCGGCCCTGCGCGCCGCGGGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTCCGCGATCCGC         TGGCATCCAGCAGCTGGAGGGTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTCCGCGATCCGCGTA...CAGTGGCATCCAGCAGCTGGAGGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCAGCCATGGAGGTGGAAGTCAGGTGCAGCTGCAGCGGCCGTCACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106446 GTCAGCCATGGAGGTGGAAGTCAGGTGCAGCTGCAGCGGCCGTCACCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAACAGCCCAGCATGCCCAGGGTGCAAAACCTCAAGTTCAACCGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106496 GAAACAGCCCAGCATGCCCAGGGTGCAAAACCTCAAGTTCAACCGCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAG         GAAGCCGAAAACTGGAATATTAATGCTAAACATGGGAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106546 GAGGTA...TAGGAAGCCGAAAACTGGAATATTAATGCTAAACATGGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCCTGAAACTCTTGGAGATGTTCACGACTTCCTTCTGAGACTCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113294 GCCCTGAAACTCTTGGAGATGTTCACGACTTCCTTCTGAGACTCTTCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCGAGACCTCATGACACTTCCTATTCAGAA         TAAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113344 GACCGAGACCTCATGACACTTCCTATTCAGAAGTG...TAGTAAGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCATTCATCGCCAAACGCCGAACCCCCAAGATTCAAGAGCAGTACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115090 ACCATTCATCGCCAAACGCCGAACCCCCAAGATTCAAGAGCAGTACCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGATTGGAGGCGGATCCCCCATCAAGATATGGACTTCCAAGCAGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115140 GGATTGGAGGCGGATCCCCCATCAAGATATGGACTTCCAAGCAGGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCATGGTGAAGCTGCTGGATGAATTGTCCCCCAACACAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115190 GGCATGGTGAAGCTGCTGGATGAATTGTCCCCCAACACAGGTA...TAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCTCACAAATACTATATTGGATTTCGGTACGTCCATCCTTTAACAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120041 CCCTCACAAATACTATATTGGATTTCGGTACGTCCATCCTTTAACAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGCAATTGAAGAGATGGAGAGAGATGGCCTAGAAAGGGCTATTGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120091 AAGCAATTGAAGAGATGGAGAGAGATGGCCTAGAAAGGGCTATTGCTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACACAGTATCCACAGTACAGCTGCTCCACCACAG         GCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120141 ACACAGTATCCACAGTACAGCTGCTCCACCACAGGTA...CAGGCAGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTTAAATGCCATTTACAGATACTATAATCAAGTGGGACGGAAGCCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123648 CTTAAATGCCATTTACAGATACTATAATCAAGTGGGACGGAAGCCCACGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGAAGTGGAGCACTATTGACAGGTGGCCCACACATCACCTCCTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123698 TGAAGTGGAGCACTATTGACAGGTGGCCCACACATCACCTCCTCATCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          TGCTTTGCAGATCATATTCTAAAGGAACTGGACCATTTTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123748 GTA...CAGTGCTTTGCAGATCATATTCTAAAGGAACTGGACCATTTTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACTTGAGAAGAGAAGCGAGGTGGTCATTCTGTTTTCTGCTCACTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127419 ACTTGAGAAGAGAAGCGAGGTGGTCATTCTGTTTTCTGCTCACTCACTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGATGTCT         GTGGTCAACAGAGGCGACCCATATCCTCAGGAG
        | ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 127469 CCATGTCTGTA...CAGGTGGTCAACAGAGGCGACCCATATCCTCAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTAAGCGCCACTGTCCAAAAAGTCATGGAAAGGCTGGAGTACTGCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131702 GTAAGCGCCACTGTCCAAAAAGTCATGGAAAGGCTGGAGTACTGCAACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTACCGACTGGTGTGGCAATCCAAG         GTTGGTCCGATGCCCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| |||||||
 131752 CTACCGACTGGTGTGGCAATCCAAGGTA...TAGGTTGGTCCAATGCCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GGTTGGGTCCTCAAACAGACGAATCTATCAAAGGGCTTTGTGAGAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132213 GGTTGGGTCCTCAAACAGACGAATCTATCAAAGGGCTTTGTGAGAGGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGGAAGAATATCCTCTTGGTTCCGATAGCATTTACCAGTGACCATATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132263 AGGAAGAATATCCTCTTGGTTCCGATAGCATTTACCAGTGACCATATTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AACGCTGTATGAGCTGGACATCGAGTACTCTCAAGTTTTAGCCAAGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 132313 AACGCTGTATGAGCTGGACATCGAGTACTCTCAAGTTTTAGCCAAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078         TGTGGAGTTGAAAACATCAGAAGAGCTGAGTCTCTTAATGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132363 TA...CAGTGTGGAGTTGAAAACATCAGAAGAGCTGAGTCTCTTAATGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AATCCATTGTTCTCTAAG         GCCCTGGCCGACTTGGTGCATTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 135289 AATCCATTGTTCTCTAAGGTA...CAGGCCCTGGCCGACTTGGTGCATTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACACATCCAGTCAAACGAGCTGTGTTCCAAGCAGCTGACCCTGAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135798 ACACATCCAGTCAAACGAGCTGTGTTCCAAGCAGCTGACCCTGAGCTGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CGCTCTGTGTCAATCCTGTCTGCAGGGAGACTAAATCCTTCTTCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135848 CGCTCTGTGTCAATCCTGTCTGCAGGGAGACTAAATCCTTCTTCACCAGC

   1350     .
   1261 CAGCAGCTG
        |||||||||
 135898 CAGCAGCTG