seq1 = pF1KB3717.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KB3717/gi568815594r_76061716.tfa (gi568815594r:76061716_76313543), 251828 bp

>pF1KB3717 1434
>gi568815594r:76061716_76313543 (Chr4)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-275  (117680-117837)   100% ->
276-423  (132443-132590)   100% ->
424-612  (133839-134027)   100% ->
613-704  (137016-137107)   100% ->
705-824  (137634-137753)   100% ->
825-994  (139231-139400)   100% ->
995-1113  (143559-143677)   100% ->
1114-1187  (145068-145141)   100% ->
1188-1239  (147243-147294)   100% ->
1240-1398  (150161-150319)   100% ->
1399-1434  (151793-151828)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGATGCTGCTTCTACACGGCGGGGACGTTGTCCCTGCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGATGCTGCTTCTACACGGCGGGGACGTTGTCCCTGCTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGACCAGCGTCACGCTGCTGGTGGCCCGGGTCTTCCAGAAGGCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGACCAGCGTCACGCTGCTGGTGGCCCGGGTCTTCCAGAAGGCTGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAGAGTATCGAGAAG         AAAATTGTGTTAAGGAATGGTACT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCAGAGTATCGAGAAGGTG...TAGAAAATTGTGTTAAGGAATGGTACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGCATTTGACTCCTGGGAGAAGCCCCCTCTGCCTGTGTATACTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117704 GAGGCATTTGACTCCTGGGAGAAGCCCCCTCTGCCTGTGTATACTCAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTATTTCTTCAATGTCACCAATCCAGAGGAGATCCTCAGAGGGGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117754 CTATTTCTTCAATGTCACCAATCCAGAGGAGATCCTCAGAGGGGAGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCGGGTGGAAGAAGTGGGGCCATACACCTACAG         GGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 117804 CTCGGGTGGAAGAAGTGGGGCCATACACCTACAGGTA...TAGGGAACTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAAACAAAGCAAATATTCAATTTGGAGATAATGGAACAACAATATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132450 AGAAACAAAGCAAATATTCAATTTGGAGATAATGGAACAACAATATCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTAGCAACAAGGCCTATGTTTTTGAACGAGACCAATCTGTTGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132500 TGTTAGCAACAAGGCCTATGTTTTTGAACGAGACCAATCTGTTGGAGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTAAAATTGACTTAATTAGAACATTAAATATTCCTGTATTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 132550 CTAAAATTGACTTAATTAGAACATTAAATATTCCTGTATTGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACTGTCATAGAGTGGTCCCAGGTGCACTTCCTCAGGGAGATCATCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133839 ACTGTCATAGAGTGGTCCCAGGTGCACTTCCTCAGGGAGATCATCGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGTTGAAAGCCTATCAGCAGAAGCTCTTTGTGACTCACACAGTTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133889 CATGTTGAAAGCCTATCAGCAGAAGCTCTTTGTGACTCACACAGTTGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATTGCTCTGGGGCTACAAAGATGAAATCTTGTCCCTTATCCATGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133939 AATTGCTCTGGGGCTACAAAGATGAAATCTTGTCCCTTATCCATGTTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGGCCCGATATCTCTCCCTATTTTGGCCTATTCTATGAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 133989 AGGCCCGATATCTCTCCCTATTTTGGCCTATTCTATGAGGTA...CAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAATGGGACTAATGATGGAGACTATGTTTTTCTAACTGGAGAAGACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137018 AAATGGGACTAATGATGGAGACTATGTTTTTCTAACTGGAGAAGACAGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCTTAACTTTACAAAAATTGTGGAATGGAATGGGAAAAC         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 137068 ACCTTAACTTTACAAAAATTGTGGAATGGAATGGGAAAACGTA...TAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCACTTGACTGGTGGATAACAGACAAGTGCAATATGATTAATGGAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137635 TCACTTGACTGGTGGATAACAGACAAGTGCAATATGATTAATGGAACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGGAGATTCTTTTCACCCACTAATAACCAAAGATGAGGTCCTTTATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137685 TGGAGATTCTTTTCACCCACTAATAACCAAAGATGAGGTCCTTTATGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCCATCTGACTTTTGCAG         GTCAGTGTATATTACTTTCAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 137735 TCCCATCTGACTTTTGCAGGTA...CAGGTCAGTGTATATTACTTTCAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACTATGAGAGTGTACAGGGACTGCCTGCCTTTCGGTATAAAGTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139253 GACTATGAGAGTGTACAGGGACTGCCTGCCTTTCGGTATAAAGTTCCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAAATATTAGCCAATACGTCAGACAATGCCGGCTTCTGTATACCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139303 AGAAATATTAGCCAATACGTCAGACAATGCCGGCTTCTGTATACCTGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAAACTGCCTGGGCTCAGGAGTTCTGAATGTCAGCATCTGCAAGAATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 139353 GAAACTGCCTGGGCTCAGGAGTTCTGAATGTCAGCATCTGCAAGAATGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    995        GTGCACCCATCATTATGTCTTTCCCACACTTTTACCAAGCAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139403 A...CAGGTGCACCCATCATTATGTCTTTCCCACACTTTTACCAAGCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGAGAGGTTTGTTTCTGCCATAGAAGGCATGCACCCAAATCAGGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143602 TGAGAGGTTTGTTTCTGCCATAGAAGGCATGCACCCAAATCAGGAAGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGAGACATTTGTGGACATTAATCCT         TTGACTGGAATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 143652 ATGAGACATTTGTGGACATTAATCCTGTG...CAGTTGACTGGAATAATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTAAAAGCAGCCAAGAGGTTCCAAATCAACATTTATGTCAAAAAATTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145083 CTAAAAGCAGCCAAGAGGTTCCAAATCAACATTTATGTCAAAAAATTAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGACTTTGT         TGAAACGGGAGACATTAGAACCATGGTTTTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 145133 TGACTTTGTGTA...TAGTGAAACGGGAGACATTAGAACCATGGTTTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CAGTGATGTACCTCAATGAG         AGTGTTCACATTGATAAAGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 147275 CAGTGATGTACCTCAATGAGGTA...CAGAGTGTTCACATTGATAAAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ACGGCGAGTCGACTGAAGTCTATGATTAACACTACTTTGATCATCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150182 ACGGCGAGTCGACTGAAGTCTATGATTAACACTACTTTGATCATCACCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATACCCTACATCATCATGGCGCTGGGTGTGTTCTTTGGTTTGGTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150232 CATACCCTACATCATCATGGCGCTGGGTGTGTTCTTTGGTTTGGTTTTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCTGGCTTGCATGCAAAGGACAGGGATCCATGGATGAG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 150282 CCTGGCTTGCATGCAAAGGACAGGGATCCATGGATGAGGTG...CAGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :
   1402 ACAGCGGATGAAAGAGCACCCCTCATTCGAACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 151796 ACAGCGGATGAAAGAGCACCCCTCATTCGAACC