seq1 = pF1KB3715.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KB3715/gi568815595r_133728791.tfa (gi568815595r:133728791_133995466), 266676 bp

>pF1KB3715 624
>gi568815595r:133728791_133995466 (Chr3)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-129  (130825-130883)   100% ->
130-183  (153804-153857)   100% ->
184-289  (154077-154182)   100% ->
290-401  (155850-155961)   100% ->
402-495  (157208-157301)   100% ->
496-562  (160826-160892)   100% ->
563-624  (166615-166676)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCAGGGGGAGATTTTGGGAATCCACTGAGAAAATTCAAGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCAGGGGGAGATTTTGGGAATCCACTGAGAAAATTCAAGTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCTTGGGGGAGCAGAGCG         TCGGGAAGACGTCTCTGATTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 GTTCTTGGGGGAGCAGAGCGGTA...CAGTCGGGAAGACGTCTCTGATTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGAGGTTCATGTACGACAGCTTCGACAACACATACCAG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 130846 CGAGGTTCATGTACGACAGCTTCGACAACACATACCAGGTG...CAGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACCATTGGGATTGACTTCTTGTCAAAAACCATGTACTTGGAGGACCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153807 ACCATTGGGATTGACTTCTTGTCAAAAACCATGTACTTGGAGGACCGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 G         GTGCGACTGCAGCTCTGGGACACAGCTGGTCAGGAGAGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153857 GGTG...CAGGTGCGACTGCAGCTCTGGGACACAGCTGGTCAGGAGAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCCGCAGCCTGATCCCCAGCTACATCCGGGACTCCACGGTGGCTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154117 TCCGCAGCCTGATCCCCAGCTACATCCGGGACTCCACGGTGGCTGTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGTACGACATCACAA         ATCTCAACTCCTTCCAACAGACCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 154167 GTGTACGACATCACAAGTG...CAGATCTCAACTCCTTCCAACAGACCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TAAGTGGATCGACGACGTCAGGACAGAGAGGGGCAGTGATGTTATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155875 TAAGTGGATCGACGACGTCAGGACAGAGAGGGGCAGTGATGTTATCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCTGGTGGGCAACAAGACGGACCTGGCTGATAAGAG         GCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 155925 TGCTGGTGGGCAACAAGACGGACCTGGCTGATAAGAGGTA...TAGGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ATAACCATCGAGGAGGGGGAGCAGCGCGCCAAAGAACTGAGCGTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157212 ATAACCATCGAGGAGGGGGAGCAGCGCGCCAAAGAACTGAGCGTCATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CATTGAGACCAGTGCGAAGACTGGCTACAACGTGAAGCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 157262 CATTGAGACCAGTGCGAAGACTGGCTACAACGTGAAGCAGGTG...CAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTTTTCGACGTGTGGCGTCGGCTCTACCCGGAATGGAGAATGTCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160827 TTTTTCGACGTGTGGCGTCGGCTCTACCCGGAATGGAGAATGTCCAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAAAGCAAAGAAGGGA         TGATCGACATCAAGCTGGACAAACC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 160877 AAAAGCAAAGAAGGGAGTA...CAGTGATCGACATCAAGCTGGACAAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .
    588 CCAGGAGCCCCCGGCCAGCGAGGGCGGCTGCTCCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166640 CCAGGAGCCCCCGGCCAGCGAGGGCGGCTGCTCCTGC