seq1 = pF1KB3701.tfa, 3534 bp
seq2 = pF1KB3701/gi568815587r_66748902.tfa (gi568815587r:66748902_66972159), 223258 bp

>pF1KB3701 3534
>gi568815587r:66748902_66972159 (Chr11)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-321  (100289-100473)   100% ->
322-487  (100680-100845)   100% ->
488-633  (100963-101108)   100% ->
634-751  (101268-101385)   100% ->
752-903  (101707-101858)   100% ->
904-1022  (103196-103314)   100% ->
1023-1185  (105811-105973)   100% ->
1186-1368  (108204-108386)   100% ->
1369-1513  (118777-118921)   100% ->
1514-1603  (119324-119413)   100% ->
1604-1825  (119500-119721)   100% ->
1826-1982  (120214-120370)   100% ->
1983-2223  (120880-121120)   100% ->
2224-2473  (121237-121486)   100% ->
2474-2718  (121696-121940)   100% ->
2719-2898  (122044-122223)   100% ->
2899-3147  (122301-122549)   100% ->
3148-3288  (122790-122930)   100% ->
3289-3534  (123013-123258)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAAGTTCCGAACAGTCCATGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGAATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAAGTTCCGAACAGTCCATGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGAATCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAACCTCCACCGCCCCCGCTGCCTCCCCAAATGTCCGGCGCCTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAACCTCCACCGCCCCCGCTGCCTCCCCAAATGTCCGGCGCCTGGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAAGCCCATCAAGAAAGTCATGGTGGCCAACAGAG         GTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 ATAAGCCCATCAAGAAAGTCATGGTGGCCAACAGAGGTG...TAGGTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGCCATCCGTGTGTTCCGGGCCTGCACGGAGCTGGGCATCCGCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100294 ATTGCCATCCGTGTGTTCCGGGCCTGCACGGAGCTGGGCATCCGCACCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCATCTACTCTGAGCAGGACACGGGCCAGATGCACCGGCAGAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100344 AGCCATCTACTCTGAGCAGGACACGGGCCAGATGCACCGGCAGAAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGAAGCCTATCTCATCGGCCGCGGCCTGGCCCCCGTGCAGGCCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100394 ATGAAGCCTATCTCATCGGCCGCGGCCTGGCCCCCGTGCAGGCCTACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACATCCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAG         GAGAACAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100444 CACATCCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAGGTG...CAGGAGAACAACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATGCAGTGCACCCTGGCTACGGGTTCCTCTCTGAGCGAGCGGACTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100691 AGATGCAGTGCACCCTGGCTACGGGTTCCTCTCTGAGCGAGCGGACTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCAGGCCTGCCAGGATGCAGGGGTCCGGTTTATTGGGCCAAGCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100741 CCCAGGCCTGCCAGGATGCAGGGGTCCGGTTTATTGGGCCAAGCCCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGGTCCGCAAGATGGGAGACAAGGTGGAGGCCCGGGCCATCGCCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100791 GTGGTCCGCAAGATGGGAGACAAGGTGGAGGCCCGGGCCATCGCCATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCGG         GTGTTCCCGTTGTCCCTGGCACAGATGCCCCCATCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100841 TGCGGGTG...CAGGTGTTCCCGTTGTCCCTGGCACAGATGCCCCCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGTCCCTGCATGAGGCCCACGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100999 CGTCCCTGCATGAGGCCCACGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCTTCAAGGCGGCCTATGGGGGTGGAGGGCGTGGCATGAGGGTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 ATCTTCAAGGCGGCCTATGGGGGTGGAGGGCGTGGCATGAGGGTGGTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGCTACGAG         GAGCTGGAGGAGAATTACACCCGGGCCTACT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101099 CAGCTACGAGGTG...CAGGAGCTGGAGGAGAATTACACCCGGGCCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGAGGCTCTGGCCGCCTTTGGGAATGGGGCGCTGTTTGTGGAGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101299 CAGAGGCTCTGGCCGCCTTTGGGAATGGGGCGCTGTTTGTGGAGAAGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATCGAGAAGCCACGGCACATCGAGGTGCAGATCTTGG         GGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101349 ATCGAGAAGCCACGGCACATCGAGGTGCAGATCTTGGGTG...CAGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101711 CCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCGGCACCAGAAGGTGGTCGAGATTGCCCCCGCCGCCCACCTGGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101761 GGCGGCACCAGAAGGTGGTCGAGATTGCCCCCGCCGCCCACCTGGACCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGCTTCGGACTCGGCTCACCAGCGACTCTGTGAAACTCGCTAAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101811 CAGCTTCGGACTCGGCTCACCAGCGACTCTGTGAAACTCGCTAAACAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    904        GTGGGCTACGAGAACGCAGGCACCGTGGAGTTCCTGGTGGACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101861 G...CAGGTGGGCTACGAGAACGCAGGCACCGTGGAGTTCCTGGTGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGCACGGCAAGCACTACTTCATCGAGGTCAACTCCCGCCTGCAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103239 GGCACGGCAAGCACTACTTCATCGAGGTCAACTCCCGCCTGCAGGTGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CACACGGTCACAGAGGAGATCACCGA         CGTAGACCTGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103289 CACACGGTCACAGAGGAGATCACCGAGTG...CAGCGTAGACCTGGTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGCTCAGATCCACGTGGCTGAGGGCAGGAGCCTACCCGACCTGGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105826 TGCTCAGATCCACGTGGCTGAGGGCAGGAGCCTACCCGACCTGGGCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGCAGGAGAACATCCGCATCAACGGGTGTGCCATCCAGTGCCGGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105876 GGCAGGAGAACATCCGCATCAACGGGTGTGCCATCCAGTGCCGGGTCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACCGAGGACCCCGCGCGCAGCTTCCAGCCGGACACCGGCCGCATTGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105926 ACCGAGGACCCCGCGCGCAGCTTCCAGCCGGACACCGGCCGCATTGAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1186        GTGTTCCGGAGCGGAGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGATAATG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105976 G...CAGGTGTTCCGGAGCGGAGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGATAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTTCCGCCTTCCAAGGAGCCGTCATCTCGCCCCACTACGACTCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108247 CTTCCGCCTTCCAAGGAGCCGTCATCTCGCCCCACTACGACTCCCTGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTCAAAGTCATTGCCCACGGCAAAGACCACCCCACGGCCGCCACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108297 GTCAAAGTCATTGCCCACGGCAAAGACCACCCCACGGCCGCCACCAAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAGCAGGGCCCTTGCGGAGTTCCGCGTCCGAGGTGTGAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108347 GAGCAGGGCCCTTGCGGAGTTCCGCGTCCGAGGTGTGAAGGTG...CAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCAACATCGCCTTCCTGCAGAATGTGCTCAACAACCAGCAGTTCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118778 CCAACATCGCCTTCCTGCAGAATGTGCTCAACAACCAGCAGTTCCTGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GGCACTGTGGACACCCAGTTCATCGACGAGAACCCAGAGCTGTTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118828 GGCACTGTGGACACCCAGTTCATCGACGAGAACCCAGAGCTGTTCCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCGGCCTGCACAGAACCGGGCCCAAAAGCTGTTGCACTACCTCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118878 GCGGCCTGCACAGAACCGGGCCCAAAAGCTGTTGCACTACCTCGGTC...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514    GCCATGTCATGGTAAACGGTCCAACCACCCCGATTCCCGTCAAGGCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119321 CAGGCCATGTCATGGTAAACGGTCCAACCACCCCGATTCCCGTCAAGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AGCCCCAGCCCCACGGACCCCGTTGTCCCTGCAGTGCCCATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 119371 AGCCCCAGCCCCACGGACCCCGTTGTCCCTGCAGTGCCCATAGGTA...T

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1604   GCCCGCCCCCGGCTGGTTTCAGAGACATCCTGCTGCGAGAGGGGCCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119498 AGGCCCGCCCCCGGCTGGTTTCAGAGACATCCTGCTGCGAGAGGGGCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGGGCTTTGCTCGAGCTGTGCGGAACCACCCGGGGCTGCTGCTGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119548 AGGGCTTTGCTCGAGCTGTGCGGAACCACCCGGGGCTGCTGCTGATGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 ACGACCTTCAGGGACGCCCACCAGTCACTGCTGGCCACTCGTGTGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119598 ACGACCTTCAGGGACGCCCACCAGTCACTGCTGGCCACTCGTGTGCGCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCACGATCTCAAAAAGATCGCCCCCTATGTTGCCCACAACTTCAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119648 CCACGATCTCAAAAAGATCGCCCCCTATGTTGCCCACAACTTCAGCAAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAG         GAGCCACGTTTGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119698 TCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAGGTA...CAGGAGCCACGTTTGACGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GCCATGCGCTTCCTGTATGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTGCAGGAGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120231 GCCATGCGCTTCCTGTATGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTGCAGGAGCTCCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GGAGCTCATCCCCAACATCCCTTTCCAGATGCTGCTGCGGGGGGCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120281 GGAGCTCATCCCCAACATCCCTTTCCAGATGCTGCTGCGGGGGGCCAATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGTGGGCTACACCAACTACCCAGACAACGTGGTCTTCAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 120331 CTGTGGGCTACACCAACTACCCAGACAACGTGGTCTTCAAGTG...CAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TTCTGTGAAGTGGCCAAAGAGAATGGCATGGATGTCTTCCGTGTGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120881 TTCTGTGAAGTGGCCAAAGAGAATGGCATGGATGTCTTCCGTGTGTTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CTCCCTCAACTACTTGCCCAACATGCTGCTGGGCATGGAGGCGGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120931 CTCCCTCAACTACTTGCCCAACATGCTGCTGGGCATGGAGGCGGCAGGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GTGCCGGAGGCGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGCGACGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120981 GTGCCGGAGGCGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGCGACGTGGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GACCCCAGCCGCACCAAGTACTCACTGCAGTACTACATGGGCTTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121031 GACCCCAGCCGCACCAAGTACTCACTGCAGTACTACATGGGCTTGGCCGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 AGAGCTGGTGCGAGCTGGCACCCACATCCTGTGCATCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 121081 AGAGCTGGTGCGAGCTGGCACCCACATCCTGTGCATCAAGGTG...CAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 ACATGGCCGGGCTGCTGAAGCCCACGGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121238 ACATGGCCGGGCTGCTGAAGCCCACGGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CTCCGGGACCGCTTCCCCGACCTCCCACTGCACATCCACACCCACGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121288 CTCCGGGACCGCTTCCCCGACCTCCCACTGCACATCCACACCCACGACAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GTCAGGGGCAGGCGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCCCAGGCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121338 GTCAGGGGCAGGCGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCCCAGGCTGGAGCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 ATGTGGTGGATGTGGCAGCTGATTCCATGTCTGGGATGACTTCACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121388 ATGTGGTGGATGTGGCAGCTGATTCCATGTCTGGGATGACTTCACAGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 AGCATGGGGGCCCTGGTGGCCTGTACCAGAGGGACTCCCCTGGACACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 121438 AGCATGGGGGCCCTGGTGGCCTGTACCAGAGGGACTCCCCTGGACACAGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2474         AGGTGCCCATGGAGCGCGTGTTTGACTACAGTGAGTACTGGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121488 TA...CAGAGGTGCCCATGGAGCGCGTGTTTGACTACAGTGAGTACTGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 AGGGGGCTCGGGGACTGTACGCGGCCTTCGACTGCACGGCCACCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121738 AGGGGGCTCGGGGACTGTACGCGGCCTTCGACTGCACGGCCACCATGAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 TCTGGCAACTCGGACGTGTATGAAAATGAGATCCCAGGGGGCCAGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121788 TCTGGCAACTCGGACGTGTATGAAAATGAGATCCCAGGGGGCCAGTACAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 CAACCTGCACTTCCAGGCCCACAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121838 CAACCTGCACTTCCAGGCCCACAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTCAAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 AGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCCAACCAGATGCTGGGCGATCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121888 AGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCCAACCAGATGCTGGGCGATCTCATC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 AAG         GTGACGCCCTCCTCCAAGATCGTGGGGGACCTGGCCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121938 AAGGTG...CAGGTGACGCCCTCCTCCAAGATCGTGGGGGACCTGGCCCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 GTTTATGGTGCAGAATGGATTGAGCCGGGCAGAGGCCGAAGCTCAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122082 GTTTATGGTGCAGAATGGATTGAGCCGGGCAGAGGCCGAAGCTCAGGCGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 AAGAGCTGTCCTTTCCCCGCTCCGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122132 AAGAGCTGTCCTTTCCCCGCTCCGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 GGTGTCCCCCATGGGGGGTTCCCCGAACCCTTTCGCTCTAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 122182 GGTGTCCCCCATGGGGGGTTCCCCGAACCCTTTCGCTCTAAGGTA...CA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2899  GTACTGAAGGACCTGCCAAGGGTGGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122300 GGTACTGAAGGACCTGCCAAGGGTGGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 CTCCCCTGGATCTGCAGGCACTGGAGAAGGAGCTGGTAGACCGGCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122350 CTCCCCTGGATCTGCAGGCACTGGAGAAGGAGCTGGTAGACCGGCATGGG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 GAGGAGGTGACGCCGGAAGATGTGCTCTCAGCAGCTATGTACCCCGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122400 GAGGAGGTGACGCCGGAAGATGTGCTCTCAGCAGCTATGTACCCCGATGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 GTTTGCCCACTTCAAGGACTTCACTGCCACCTTTGGCCCCCTGGATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122450 GTTTGCCCACTTCAAGGACTTCACTGCCACCTTTGGCCCCCTGGATAGCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 TGAATACTCGCCTCTTCCTGCAGGGACCCAAGATCGCAGAGGAGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122500 TGAATACTCGCCTCTTCCTGCAGGGACCCAAGATCGCAGAGGAGTTTGAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148          GTGGAGCTGGAGCGGGGCAAGACGCTGCACATCAAAGCCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122550 GTC...CAGGTGGAGCTGGAGCGGGGCAAGACGCTGCACATCAAAGCCCT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 GGCCGTGAGCGACCTGAACCGGGCCGGCCAGAGGCAGGTCTTCTTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122831 GGCCGTGAGCGACCTGAACCGGGCCGGCCAGAGGCAGGTCTTCTTTGAGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 TCAATGGGCAGCTGCGGTCCATCTTGGTCAAGGACACCCAGGCCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122881 TCAATGGGCAGCTGCGGTCCATCTTGGTCAAGGACACCCAGGCCATGAAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289          GAGATGCACTTCCACCCCAAGGCCCTAAAGGACGTGAAGGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122931 GTA...CAGGAGATGCACTTCCACCCCAAGGCCCTAAAGGACGTGAAGGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 CCAGATCGGGGCGCCCATGCCTGGGAAGGTGATAGACATCAAAGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123054 CCAGATCGGGGCGCCCATGCCTGGGAAGGTGATAGACATCAAAGTGGTGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 CAGGGGCCAAGGTGGCCAAGGGCCAGCCCCTGTGTGTGCTCAGTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123104 CAGGGGCCAAGGTGGCCAAGGGCCAGCCCCTGTGTGTGCTCAGTGCCATG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 AAGATGGAGACTGTGGTGACCTCACCCATGGAGGGTACTGTCCGCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123154 AAGATGGAGACTGTGGTGACCTCACCCATGGAGGGTACTGTCCGCAAGGT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3480 TCATGTGACCAAGGACATGACACTGGAAGGTGACGACCTCATCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123204 TCATGTGACCAAGGACATGACACTGGAAGGTGACGACCTCATCCTGGAGA

   3700     .
   3530 TCGAG
        |||||
 123254 TCGAG