seq1 = pF1KB3644.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KB3644/gi568815597r_159941396.tfa (gi568815597r:159941396_160142532), 201137 bp

>pF1KB3644 1137
>gi568815597r:159941396_160142532 (Chr1)

(complement)

1-1137  (100001-101137)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGTCAGTTGCCAAGGTGTATTACAGTCAGACCACTCAGACAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGTCAGTTGCCAAGGTGTATTACAGTCAGACCACTCAGACAGAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCCCCTAATGGGCCCAGGGATACGACGGCGGAGAGTCCTGACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCCCCTAATGGGCCCAGGGATACGACGGCGGAGAGTCCTGACAAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGTCGCAGCAACGTGAGAATGGAGCACATTGCCGACAAGCGCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGTCGCAGCAACGTGAGAATGGAGCACATTGCCGACAAGCGCTTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCTCAAGGACCTGTGGACAACCTTCATTGACATGCAGTGGCGCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCTCAAGGACCTGTGGACAACCTTCATTGACATGCAGTGGCGCTACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTCTGCTCTTCTCTGCGACCTTTGCAGGCACATGGTTCCTCTTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTTCTGCTCTTCTCTGCGACCTTTGCAGGCACATGGTTCCTCTTTGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGTGGTATCTGGTAGCTGTGGCACATGGGGACCTGCTGGAGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGTGGTATCTGGTAGCTGTGGCACATGGGGACCTGCTGGAGCTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCCCGGCCAACCACACCCCCTGTGTGGTACAGGTGCACACACTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCCCGGCCAACCACACCCCCTGTGTGGTACAGGTGCACACACTCACTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCCTTCCTCTTCTCCCTTGAATCCCAAACCACCATTGGCTATGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCCTTCCTCTTCTCCCTTGAATCCCAAACCACCATTGGCTATGGCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTACATCAGTGAGGAATGTCCACTGGCCATTGTGCTTCTTATTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTACATCAGTGAGGAATGTCCACTGGCCATTGTGCTTCTTATTGCCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTGCTCACCACCATCCTGGAAATCTTCATCACAGGTACCTTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTGCTCACCACCATCCTGGAAATCTTCATCACAGGTACCTTCCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGATTGCCCGGCCCAAGAAGCGGGCTGAGACCATTCGTTTCAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGATTGCCCGGCCCAAGAAGCGGGCTGAGACCATTCGTTTCAGCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGCAGTTGTGGCCTCCCACAATGGCAAGCCCTGCCTCATGATCCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGCAGTTGTGGCCTCCCACAATGGCAAGCCCTGCCTCATGATCCGAGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCAATATGCGCAAAAGCCTCCTCATTGGCTGCCAGGTGACAGGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCAATATGCGCAAAAGCCTCCTCATTGGCTGCCAGGTGACAGGAAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTTCAGACCCACCAAACCAAGGAAGGGGAGAACATCCGGCTCAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTTCAGACCCACCAAACCAAGGAAGGGGAGAACATCCGGCTCAACCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAATGTGACTTTCCAAGTAGACACAGCCTCTGACAGCCCCTTCCTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAATGTGACTTTCCAAGTAGACACAGCCTCTGACAGCCCCTTCCTTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTACCCCTTACCTTCTATCATGTGGTAGATGAGACCAGTCCCTTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTACCCCTTACCTTCTATCATGTGGTAGATGAGACCAGTCCCTTGAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTCCCTCTTCGCAGTGGTGAGGGTGACTTTGAGCTGGTGCTGATCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTCCCTCTTCGCAGTGGTGAGGGTGACTTTGAGCTGGTGCTGATCCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGGGACAGTGGAGTCCACCAGTGCCACCTGTCAGGTGCGCACTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTGGGACAGTGGAGTCCACCAGTGCCACCTGTCAGGTGCGCACTTCCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGCCAGAGGAGATCCTTTGGGGCTACGAGTTCACACCTGCCATCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGCCAGAGGAGATCCTTTGGGGCTACGAGTTCACACCTGCCATCTCACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCAGCCAGTGGTAAATACATAGCTGACTTTAGCCTTTTTGACCAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCAGCCAGTGGTAAATACATAGCTGACTTTAGCCTTTTTGACCAAGTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAAAGTGGCCTCTCCTAGTGGCCTCCGTGACAGCACTGTACGCTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAAAGTGGCCTCTCCTAGTGGCCTCCGTGACAGCACTGTACGCTACGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GACCCTGAAAAGCTCAAGTTGGAGGAGTCATTAAGGGAGCAAGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GACCCTGAAAAGCTCAAGTTGGAGGAGTCATTAAGGGAGCAAGCTGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1101 GGAGGGCAGTGCCCTTAGTGTGCGCATCAGCAATGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAGGGCAGTGCCCTTAGTGTGCGCATCAGCAATGTC