seq1 = pF1KB3618.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KB3618/gi568815581f_55165485.tfa (gi568815581f:55165485_55420876), 255392 bp

>pF1KB3618 885
>gi568815581f:55165485_55420876 (Chr17)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-451  (102267-102602)   100% ->
452-672  (149743-149963)   100% ->
673-885  (155180-155392)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAAATGTCCCGACCGCTCCCCCTGAATCCCACCTTTATCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAAATGTCCCGACCGCTCCCCCTGAATCCCACCTTTATCCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCTACGGCGTGCTCAGGTCCCTGCTGGAGAACCCGCTGAAGCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCTACGGCGTGCTCAGGTCCCTGCTGGAGAACCCGCTGAAGCTCCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCACCACGAAGACG         CATTTAGTAAAGATAAAGACAAGGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCACCACGAAGACGGTG...CAGCATTTAGTAAAGATAAAGACAAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAAGCTGGATGATGAGAGTAACAGCCCGACGGTCCCCCAGTCGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102293 AAGAAGCTGGATGATGAGAGTAACAGCCCGACGGTCCCCCAGTCGGCATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGGGCCTACCTTATGGGACAAAACCCTTCCCTATGACGGAGATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102343 CCTGGGGCCTACCTTATGGGACAAAACCCTTCCCTATGACGGAGATACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAGTTGGAATACATGGACCTGGAGGAGTTTTTGTCAGAAAATGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102393 TCCAGTTGGAATACATGGACCTGGAGGAGTTTTTGTCAGAAAATGGCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCCCCAGCCCATCTCAGCATGACCACAGCCCTCACCCTCCTGGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102443 CCCCCCAGCCCATCTCAGCATGACCACAGCCCTCACCCTCCTGGGCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCAGCTTCCTCGGCTGCCCCCTCGGTCATGGACCTCAGCAGCCGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102493 GCCAGCTTCCTCGGCTGCCCCCTCGGTCATGGACCTCAGCAGCCGGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGCACCCCTTCACCCTGGCATCCCATCTCCGAACTGTATGCAGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102543 CTGCACCCCTTCACCCTGGCATCCCATCTCCGAACTGTATGCAGAGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATCAGACCAG         GTCAGCTGTTGCCAGCAAACCGCAATACACC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102593 ATCAGACCAGGTA...CAGGTCAGCTGTTGCCAGCAAACCGCAATACACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAGTCCCATTGATCCTGACACCATCCAGGTCCCAGTGGGTTATGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149774 AAGTCCCATTGATCCTGACACCATCCAGGTCCCAGTGGGTTATGAGCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCCAGCAGATCTTGCCCTTTCCAGCATCCCTGGCCAGGAAATGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149824 ACCCAGCAGATCTTGCCCTTTCCAGCATCCCTGGCCAGGAAATGTTTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCTCGCAAACGCAAGTTCTCTGAGGAAGAACTGAAGCCACAGCCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149874 CCTCGCAAACGCAAGTTCTCTGAGGAAGAACTGAAGCCACAGCCCATGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAAGAAAGCTCGCAAAGTCTTCATCCCTGATGACCTGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 149924 CAAGAAAGCTCGCAAAGTCTTCATCCCTGATGACCTGAAGGTA...CAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGACAAGTACTGGGCAAGGCGCAGAAAGAACAACATGGCAGCCAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155181 ATGACAAGTACTGGGCAAGGCGCAGAAAGAACAACATGGCAGCCAAGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCCGCGACGCCCGGAGGCTGAAAGAGAACCAGATCGCCATCCGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155231 TCCCGCGACGCCCGGAGGCTGAAAGAGAACCAGATCGCCATCCGGGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTTCCTGGAGAAGGAGAACTCGGCCCTCCGCCAGGAGGTGGCTGACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155281 GTTCCTGGAGAAGGAGAACTCGGCCCTCCGCCAGGAGGTGGCTGACTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGAAGGAGCTGGGCAAATGCAAGAACATACTTGCCAAGTATGAGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155331 GGAAGGAGCTGGGCAAATGCAAGAACATACTTGCCAAGTATGAGGCCAGG

    900     .    :
    874 CACGGGCCCCTG
        ||||||||||||
 155381 CACGGGCCCCTG