Result of SIM4 for pF1KB3587

seq1 = pF1KB3587.tfa, 1464 bp
seq2 = pF1KB3587/gi568815592f_157282022.tfa (gi568815592f:157282022_157773119), 491098 bp

>pF1KB3587 1464
>gi568815592f:157282022_157773119 (Chr6)

1-245  (100001-100245)   100% ->
246-406  (260564-260724)   100% ->
407-565  (310967-311125)   100% ->
566-703  (346328-346465)   100% ->
704-752  (350813-350861)   100% ->
753-855  (363716-363818)   100% ->
856-965  (365238-365347)   100% ->
966-1068  (371504-371606)   100% ->
1069-1464  (390703-391098)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCCCGGCGGCGGCGGGCCCATGAAAGACTGCGAGTACAGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCCCGGCGGCGGCGGGCCCATGAAAGACTGCGAGTACAGCCAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCACCCACAGCTCCTCCCCCATGGAGTCGCCCCACAAGAAGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCACCCACAGCTCCTCCCCCATGGAGTCGCCCCACAAGAAGAAGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCGGCCCGGAGGAAATGGGAGGTGTTCCCGGGAAGAAACAAGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCGGCCCGGAGGAAATGGGAGGTGTTCCCGGGAAGAAACAAGTTCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTAACGGGAGGATCATGATGGCCCGGCAGACGGGCGTCTTCTACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTAACGGGAGGATCATGATGGCCCGGCAGACGGGCGTCTTCTACCTGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCGTCCTCATCCTGGTCACTAGCGGACTCTTCTTCGCCTTCGA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100201 GCTCGTCCTCATCCTGGTCACTAGCGGACTCTTCTTCGCCTTCGAGTA..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246     CTGTCCGTACCTGGCGGTGAAAATCACCCCTGCCATCCCTGCAGTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 .CAGCTGTCCGTACCTGGCGGTGAAAATCACCCCTGCCATCCCTGCAGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGCATCCTGTTCTTCTTTGTGATGGGGACCCTGCTCCGCACCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260610 GCTGGCATCCTGTTCTTCTTTGTGATGGGGACCCTGCTCCGCACCAGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCGACCCCGGAGTCCTCCCACGAGCCACGCCTGATGAAGCCGCCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260660 CAGCGACCCCGGAGTCCTCCCACGAGCCACGCCTGATGAAGCCGCCGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGAAAGGCAAATAG         ATATCGCAAACGGCACCAGTTCAGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 260710 TGGAAAGGCAAATAGGTA...CAGATATCGCAAACGGCACCAGTTCAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGTACCGCCCGCCTCCCAGAACCAAAGAAGTCATCATCAATGGCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310993 GGGTACCGCCCGCCTCCCAGAACCAAAGAAGTCATCATCAATGGCCAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGTGAAACTTAAATACTGTTTCACCTGCAAGATTTTCCGGCCCCCTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 311043 CGTGAAACTTAAATACTGTTTCACCTGCAAGATTTTCCGGCCCCCTCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTCCCATTGCAGCCTTTGTGATAACTGCGTAG         AACGGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 311093 CCTCCCATTGCAGCCTTTGTGATAACTGCGTAGGTG...CAGAACGGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATCACCACTGTCCCTGGGTAGGCAACTGTGTGGGGAAAAGAAACTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 346336 GATCACCACTGTCCCTGGGTAGGCAACTGTGTGGGGAAAAGAAACTACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATTTTTTTATATGTTTATTTTATCTCTGTCTTTTCTGACAGTCTTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 346386 ATTTTTTTATATGTTTATTTTATCTCTGTCTTTTCTGACAGTCTTTATAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTGCATTCGTTATCACCCACGTCATTCTTC         GTTCACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 346436 TTGCATTCGTTATCACCCACGTCATTCTTCGTA...CAGGTTCACAGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACAGGATTCCTAAATGCCCTTAAGGACAGTCCTGCAAG         CGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 350824 ACAGGATTCCTAAATGCCCTTAAGGACAGTCCTGCAAGATA...CACCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGGAGGCTGTGGTGTGCTTCTTCTCTGTCTGGTCCATCGTTGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363719 CCTGGAGGCTGTGGTGTGCTTCTTCTCTGTCTGGTCCATCGTTGGCCTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGGATTCCACACCTACTTGATCAGCTCCAACCAGACAACAAATGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363769 CAGGATTCCACACCTACTTGATCAGCTCCAACCAGACAACAAATGAGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856          ATTAAAGGATCCTGGTCAAATAAAAGAGGTAAAGAAAATTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363819 GTA...CAGATTAAAGGATCCTGGTCAAATAAAAGAGGTAAAGAAAATTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAATCCCTACAGCTACGGAAATATCTTTACCAACTGCTGTGTTGCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 365279 CAATCCCTACAGCTACGGAAATATCTTTACCAACTGCTGTGTTGCCCTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTGGGCCCATCTCACCAAG         CCTGATCGACAGAAGAGGGTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 365329 GTGGGCCCATCTCACCAAGGTA...CAGCCTGATCGACAGAAGAGGGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCCAGCCCGACACGCCGCAGCCAGCAGCACCCTCCAATGGCATCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 371526 ATCCAGCCCGACACGCCGCAGCCAGCAGCACCCTCCAATGGCATCACCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GTACGGGGCCACGCAGTCACAGAGTGACATG         TGCGACCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 371576 GTACGGGGCCACGCAGTCACAGAGTGACATGGTA...CAGTGCGACCAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACCAGTGCATTCAGAGCACCAAATTCGTTTTGCAGGCTGCAGCCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390713 ACCAGTGCATTCAGAGCACCAAATTCGTTTTGCAGGCTGCAGCCACGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTGCTGCAGAGCGAGCCCAGCCTCACCAGCGACGAGCTGCACCTGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390763 CTGCTGCAGAGCGAGCCCAGCCTCACCAGCGACGAGCTGCACCTGCCCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAAGCCTGGCCTGGGCACGCCCTGCGCCAGCCTCACACTGGGCCCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390813 GAAGCCTGGCCTGGGCACGCCCTGCGCCAGCCTCACACTGGGCCCGCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CACCGCCCGCCTCCATGCCCAACCTCGCCGAGGCCACGCTCGCGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390863 CACCGCCCGCCTCCATGCCCAACCTCGCCGAGGCCACGCTCGCGGACGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGCCCCGGAAAGATGAGCACATGGGCCACCAGTTCCTGACGCCCGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390913 ATGCCCCGGAAAGATGAGCACATGGGCCACCAGTTCCTGACGCCCGATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCGCCCTCGCCCCCCAGGCTACTGGCGGCGGGCAGCCCCCTGGCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390963 GGCGCCCTCGCCCCCCAGGCTACTGGCGGCGGGCAGCCCCCTGGCGCACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCCGCACCATGCACGTGCTGGGCCTGGCCAGCCAGGACTCCCTGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 391013 GCCGCACCATGCACGTGCTGGGCCTGGCCAGCCAGGACTCCCTGCATGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1429 GACTCTGTGCGCGGCCTGGTGAAGCTCAGCTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 391063 GACTCTGTGCGCGGCCTGGTGAAGCTCAGCTCCGTG

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