seq1 = pF1KB3547.tfa, 3273 bp
seq2 = pF1KB3547/gi568815591r_81850395.tfa (gi568815591r:81850395_82543459), 693065 bp

>pF1KB3547 3273
>gi568815591r:81850395_82543459 (Chr7)

(complement)

93-177  (193808-193892)   98% ->
178-294  (208209-208325)   100% ==
355-396  (406784-406825)   100% ->
397-526  (426287-426416)   100% ->
527-658  (458560-458691)   100% ->
659-728  (476936-477005)   100% ->
729-779  (479106-479156)   100% ->
780-879  (482933-483032)   100% ->
880-1038  (505225-505383)   100% ->
1039-1143  (510559-510663)   100% ->
1144-1222  (528981-529059)   100% ->
1223-1272  (529950-529999)   100% ->
1273-1362  (531217-531306)   100% ->
1363-1440  (535704-535781)   100% ->
1441-1515  (537621-537695)   100% ->
1516-1590  (537963-538037)   100% ->
1591-1662  (546210-546281)   100% ->
1663-1734  (548521-548592)   100% ->
1735-1796  (552214-552275)   100% ->
1797-1873  (558749-558825)   100% ->
1874-1894  (560126-560146)   100% ->
1895-1955  (560833-560893)   100% ->
1956-2053  (568908-569005)   100% ->
2054-2141  (571596-571683)   100% ->
2142-2204  (572723-572785)   100% ->
2205-2308  (573476-573579)   100% ->
2309-2395  (574487-574573)   100% ->
2396-2463  (575797-575864)   100% ->
2464-2502  (576253-576291)   100% ->
2503-2574  (577795-577866)   100% ->
2575-2727  (579101-579253)   100% ->
2728-2780  (579352-579404)   100% ->
2781-2836  (580965-581020)   100% ->
2837-2966  (581437-581566)   100% ->
2967-3076  (583631-583740)   100% ->
3077-3159  (584103-584185)   100% ->
3160-3273  (592952-593065)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93 CACTATCAAATCATGGGTGGATAAGATGCAAGAAGACCTTGTCACACTGG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193808 CAGTATCAAATCATGGGTGGATAAGATGCAAGAAGACCTTGTCACACTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143 CAAAAACAGCAAGTGGAGTCAATCAGCTTGTTGAT         ATTTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 193858 CAAAAACAGCAAGTGGAGTCAATCAGCTTGTTGATGTG...CAGATTTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184 GAGAAATATCAAGATTTGTATACTGTGGAACCAAATAATGCACGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208215 GAGAAATATCAAGATTTGTATACTGTGGAACCAAATAATGCACGCCAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    234 GGTAGAAATTGCAGCCAGGGATATTGAGAAACTTCTGAGCAACAGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208265 GGTAGAAATTGCAGCCAGGGATATTGAGAAACTTCTGAGCAACAGATCTA

    200     .    :
    284 AAGCCCTGGTG
        |||||||||||
 208315 AAGCCCTGGTG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 AGCAATGAAGTTGTCTACTACAATGCAAAGGATGATCTCGAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 406784 AGCAATGAAGTTGTCTACTACAATGCAAAGGATGATCTCGATGTG...TA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397  CCTGAGAAAAATGACAGTGAGCCAGGCAGCCAGAGGATAAAACCTGTTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 426286 GCCTGAGAAAAATGACAGTGAGCCAGGCAGCCAGAGGATAAAACCTGTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446 TCATTGAAGATGCTAATTTTGGACGACAAATATCTTATCAGCACGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 426336 TCATTGAAGATGCTAATTTTGGACGACAAATATCTTATCAGCACGCAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 GTCCATATTCCTACTGACATCTATGAGGGCT         CAACAATTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 426386 GTCCATATTCCTACTGACATCTATGAGGGCTGTA...TAGCAACAATTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    537 GTTAAATGAACTCAACTGGACAAGTGCCTTAGATGAAGTTTTCAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458570 GTTAAATGAACTCAACTGGACAAGTGCCTTAGATGAAGTTTTCAAAAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587 ATCGCGAGGAAGACCCTTCATTATTGTGGCAGGTTTTTGGCAGTGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458620 ATCGCGAGGAAGACCCTTCATTATTGTGGCAGGTTTTTGGCAGTGCCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 GGCCTAGCTCGATATTATCCAG         CTTCACCATGGGTTGATAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 458670 GGCCTAGCTCGATATTATCCAGGTA...TAGCTTCACCATGGGTTGATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    678 TAGTAGAACTCCAAATAAGATTGACCTTTATGATGTACGCAGAAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476955 TAGTAGAACTCCAAATAAGATTGACCTTTATGATGTACGCAGAAGACCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    728 G         GTACATCCAAGGAGCTGCATCTCCTAAAGACATGCTTATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477005 GGTA...CAGGTACATCCAAGGAGCTGCATCTCCTAAAGACATGCTTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    769 CTGGTGGATGT         GAGTGGAAGTGTTAGTGGATTGACACTTAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 479146 CTGGTGGATGTGTG...TAGGAGTGGAAGTGTTAGTGGATTGACACTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    810 ACTGATCCGAACATCTGTCTCCGAAATGTTAGAAACCCTCTCAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 482963 ACTGATCCGAACATCTGTCTCCGAAATGTTAGAAACCCTCTCAGATGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    860 ATTTCGTGAATGTAGCTTCA         TTTAACAGCAATGCTCAGGAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 483013 ATTTCGTGAATGTAGCTTCAGTA...CAGTTTAACAGCAATGCTCAGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTAAGCTGTTTTCAGCACCTTGTCCAAGCAAATGTAAGAAATAAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 505246 GTAAGCTGTTTTCAGCACCTTGTCCAAGCAAATGTAAGAAATAAAAAAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTTGAAAGACGCGGTGAATAATATCACAGCCAAAGGAATTACAGATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 505296 GTTGAAAGACGCGGTGAATAATATCACAGCCAAAGGAATTACAGATTATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAAGGGCTTTAGTTTTGCTTTTGAACAGCTGCTTAAT         TAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 505346 AGAAGGGCTTTAGTTTTGCTTTTGAACAGCTGCTTAATGTA...CAGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AATGTTTCCAGAGCAAACTGCAATAAGATTATTATGCTATTCACGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 510562 AATGTTTCCAGAGCAAACTGCAATAAGATTATTATGCTATTCACGGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGGAGAAGAGAGAGCCCAGGAGATATTTAACAAATACAATAAAGATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 510612 AGGAGAAGAGAGAGCCCAGGAGATATTTAACAAATACAATAAAGATAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AA         GTACGTGTATTCACGTTTTCAGTTGGTCAACACAATTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 510662 AAGTG...CAGGTACGTGTATTCACGTTTTCAGTTGGTCAACACAATTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GACAGAGGACCTATTCAGTGGATGGCCTGTGAAAACAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 529020 GACAGAGGACCTATTCAGTGGATGGCCTGTGAAAACAAAGGTA...CAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TTATTATTATGAAATTCCTTCCATTGGTGCAATAAGAATCAATACTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 529951 TTATTATTATGAAATTCCTTCCATTGGTGCAATAAGAATCAATACTCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273         GAATATTTGGATGTTTTGGGAAGACCAATGGTTTTAGCAGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 530001 TA...CAGGAATATTTGGATGTTTTGGGAAGACCAATGGTTTTAGCAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GACAAAGCTAAGCAAGTCCAATGGACAAATGTGTACCTGGATGCATTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 531259 GACAAAGCTAAGCAAGTCCAATGGACAAATGTGTACCTGGATGCATTGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1363        GAACTGGGACTTGTCATTACTGGAACTCTTCCGGTCTTCAACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531309 A...TAGGAACTGGGACTTGTCATTACTGGAACTCTTCCGGTCTTCAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TAACCGGCCAATTTGAAAATAAGACAAACTTAAAG         AACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 535747 TAACCGGCCAATTTGAAAATAAGACAAACTTAAAGGTT...TAGAACCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CTGATTCTTGGTGTGATGGGAGTAGATGTGTCTTTGGAAGATATTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 537627 CTGATTCTTGGTGTGATGGGAGTAGATGTGTCTTTGGAAGATATTAAAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 ACTGACACCACGTTTTACA         CTGTGCCCCAATGGGTATTACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 537677 ACTGACACCACGTTTTACAGTA...CAGCTGTGCCCCAATGGGTATTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 TTGCAATCGATCCTAATGGTTATGTTTTATTACATCCAAATCTTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 537985 TTGCAATCGATCCTAATGGTTATGTTTTATTACATCCAAATCTTCAGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AAG         AACCCCAAATCTCAGGAGCCAGTAACATTGGATTTCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 538035 AAGGTC...TAGAACCCCAAATCTCAGGAGCCAGTAACATTGGATTTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TGATGCAGAGTTAGAGAATGATATTAAAGTGGAG         ATTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 546248 TGATGCAGAGTTAGAGAATGATATTAAAGTGGAGGTG...TAGATTCGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ATAAGATGATTGATGGGGAAAGTGGAGAAAAAACATTCAGAACTCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 548528 ATAAGATGATTGATGGGGAAAGTGGAGAAAAAACATTCAGAACTCTGGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AAATCTCAAGATGAG         AGATATATTGACAAAGGAAACAGGAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 548578 AAATCTCAAGATGAGGTA...TAGAGATATATTGACAAAGGAAACAGGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ATACACATGGACACCTGTCAATGGCACAGATTACAG         TTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 552240 ATACACATGGACACCTGTCAATGGCACAGATTACAGGTA...CAGTTTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CCTTGGTATTACCAACCTACAGTTTTTACTATATAAAAGCCAAACTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 558754 CCTTGGTATTACCAACCTACAGTTTTTACTATATAAAAGCCAAACTAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GAGACAATAACTCAGGCCAGAT         CAAAAAAGGGCAAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 558804 GAGACAATAACTCAGGCCAGATGTA...CAGCAAAAAAGGGCAAAATGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GG         ATTCGGAAACCCTGAAGCCAGATAATTTTGAAGAATCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 560145 GGGCA...CAGATTCGGAAACCCTGAAGCCAGATAATTTTGAAGAATCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GCTATACATTCATAGCACCAAG         AGATTACTGCAATGACCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 560872 GCTATACATTCATAGCACCAAGGTT...CAGAGATTACTGCAATGACCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AAAATATCGGATAATAACACTGAATTTCTTTTAAATTTCAACGAGTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 568927 AAAATATCGGATAATAACACTGAATTTCTTTTAAATTTCAACGAGTTTAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGATAGAAAAACTCCAAACAACCCATCAT         GTAACGCGGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 568977 TGATAGAAAAACTCCAAACAACCCATCATGTA...TAGGTAACGCGGATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGATTAATAGAGTCTTGCTTGATGCAGGCTTTACAAATGAACTTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 571608 TGATTAATAGAGTCTTGCTTGATGCAGGCTTTACAAATGAACTTGTCCAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AATTACTGGAGTAAGCAGAAAAATAT         CAAGGGAGTGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 571658 AATTACTGGAGTAAGCAGAAAAATATGTA...CAGCAAGGGAGTGAAAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 ACGATTTGTTGTGACTGATGGTGGGATTACCAGAGTTTATCCCAAAGA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 572738 ACGATTTGTTGTGACTGATGGTGGGATTACCAGAGTTTATCCCAAAGAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2205        GGCTGGAGAAAATTGGCAAGAAAACCCAGAGACATATGAGGAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 572788 A...TAGGGCTGGAGAAAATTGGCAAGAAAACCCAGAGACATATGAGGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AGCTTCTATAAAAGGAGCCTAGATAATGATAACTATGTTTTCACTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 573519 AGCTTCTATAAAAGGAGCCTAGATAATGATAACTATGTTTTCACTGCTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CTACTTTAACA         AAAGTGGACCTGGTGCCTATGAATCGGGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 573569 CTACTTTAACAGTA...TAGAAAGTGGACCTGGTGCCTATGAATCGGGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TTATGGTAAGCAAAGCTGTAGAAATATATATTCAAGGGAAACTTCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 574517 TTATGGTAAGCAAAGCTGTAGAAATATATATTCAAGGGAAACTTCTTAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 CCTGCAG         TTGTTGGAATTAAAATTGATGTAAATTCCTGGAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 574567 CCTGCAGGTA...CAGTTGTTGGAATTAAAATTGATGTAAATTCCTGGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 AGAGAATTTCACCAAAACCTCAATCAGAGATCCG         TGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 575831 AGAGAATTTCACCAAAACCTCAATCAGAGATCCGGTA...CAGTGTGCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 GTCCAGTTTGTGACTGCAAAAGAAACAGTGAC         GTAATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 576260 GTCCAGTTTGTGACTGCAAAAGAAACAGTGACGTA...TAGGTAATGGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 TGTGTGATTCTGGATGATGGTGGGTTTCTTCTGATGGCAAATCATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 577804 TGTGTGATTCTGGATGATGGTGGGTTTCTTCTGATGGCAAATCATGATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 TTATACTAATCAG         ATTGGAAGATTTTTTGGAGAGATTGATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 577854 TTATACTAATCAGGTA...CAGATTGGAAGATTTTTTGGAGAGATTGATC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2603 CCAGCTTGATGAGACACCTGGTTAATATATCAGTTTATGCTTTTAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 579129 CCAGCTTGATGAGACACCTGGTTAATATATCAGTTTATGCTTTTAACAAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 TCTTATGATTATCAGTCAGTATGTGAGCCCGGTGCTGCACCAAAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 579179 TCTTATGATTATCAGTCAGTATGTGAGCCCGGTGCTGCACCAAAACAAGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 AGCAGGACATCGCTCAGCATATGTG         CCATCAGTAGCAGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 579229 AGCAGGACATCGCTCAGCATATGTGGTC...TAGCCATCAGTAGCAGACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 TATTACAAATTGGCTGGTGGGCCACTGCTGCTGCCTG         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 579368 TATTACAAATTGGCTGGTGGGCCACTGCTGCTGCCTGGTA...CAGGTCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785 ATTCTACAGCAGTTTCTCTTGAGTTTGACCTTTCCACGACTCCTTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 580969 ATTCTACAGCAGTTTCTCTTGAGTTTGACCTTTCCACGACTCCTTGAGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2835 AG         TTGAGATGGAGGATGATGACTTCACGGCCTCCCTGTCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 581019 AGGTA...AAGTTGAGATGGAGGATGATGACTTCACGGCCTCCCTGTCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2876 AGCAGAGCTGCATTACTGAACAAACCCAGTATTTCTTCGATAACGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 581476 AGCAGAGCTGCATTACTGAACAAACCCAGTATTTCTTCGATAACGACAGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2926 AAATCATTCAGTGGTGTATTAGACTGTGGAAACTGTTCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 581526 AAATCATTCAGTGGTGTATTAGACTGTGGAAACTGTTCCAGGTA...CAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2967 AATCTTTCATGGAGAAAAGCTTATGAACACCAACTTAATATTCATAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 583631 AATCTTTCATGGAGAAAAGCTTATGAACACCAACTTAATATTCATAATGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3017 TTGAGAGCAAAGGGACATGTCCATGTGACACACGACTGCTCATACAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 583681 TTGAGAGCAAAGGGACATGTCCATGTGACACACGACTGCTCATACAAGCG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3067 GAGCAGACTT         CTGACGGTCCAAATCCTTGTGACATGGTTAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 583731 GAGCAGACTTGTA...TAGCTGACGGTCCAAATCCTTGTGACATGGTTAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3108 GCAACCCAGATACCGAAAAGGGCCTGATGTCTGCTTTGATAACAATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 584134 GCAACCCAGATACCGAAAAGGGCCTGATGTCTGCTTTGATAACAATGTCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3158 TG         GAGGATTATACTGACTGTGGTGGTGTTTCTGGATTAAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 584184 TGGTA...CAGGAGGATTATACTGACTGTGGTGGTGTTTCTGGATTAAAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3199 CCCTCCCTGTGGTATATCATTGGAATCCAGTTTCTACTACTTTGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 592991 CCCTCCCTGTGGTATATCATTGGAATCCAGTTTCTACTACTTTGGCTGGT

   3200     .    :    .    :    .
   3249 ATCTGGCAGCACACACCGCCTGTTA
        |||||||||||||||||||||||||
 593041 ATCTGGCAGCACACACCGCCTGTTA