seq1 = pF1KB3524.tfa, 1380 bp
seq2 = pF1KB3524/gi568815575r_73113113.tfa (gi568815575r:73113113_73314492), 201380 bp

>pF1KB3524 1380
>gi568815575r:73113113_73314492 (ChrX)

(complement)

1-1380  (100001-101380)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGTCAGAGAACCGCAAGGAGCTGTCAGAATCCAGTCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGTCAGAGAACCGCAAGGAGCTGTCAGAATCCAGTCAAGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGTAATCAGATAATGGTGGAAGGGCTCGGGGAACATCTGGAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGTAATCAGATAATGGTGGAAGGGCTCGGGGAACATCTGGAGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGAAGATGCCGCTGCTGGGCTTGGAGACGATGGGAAGTGCGGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGAAGATGCCGCTGCTGGGCTTGGAGACGATGGGAAGTGCGGTGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGCCGCTGGGCTTGGGGAAGAAGGGGAAAACGGTGAAGATACTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGCCGCTGGGCTTGGGGAAGAAGGGGAAAACGGTGAAGATACTGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGTCCGGGGAAGATGGGAAAAAAGGTGGCGATACTGATGAGGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGTCCGGGGAAGATGGGAAAAAAGGTGGCGATACTGATGAGGACTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCAGACCGTCCAAAAGGACTTATCGGTTATGTTTTAGATACAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGCAGACCGTCCAAAAGGACTTATCGGTTATGTTTTAGATACAGACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTGAAAGTCTACCTGTGAAAGTTAAGTACCGTGTGTTAGCCCTTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTGAAAGTCTACCTGTGAAAGTTAAGTACCGTGTGTTAGCCCTTAAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTTCAAACTAGAGCGGCCAATTTAGAATCCAAATTCCTGAGGGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTTCAAACTAGAGCGGCCAATTTAGAATCCAAATTCCTGAGGGAATTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGACATTGAAAGAAAGTTTGCTGAAATGTACCAACCCTTACTGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACATTGAAAGAAAGTTTGCTGAAATGTACCAACCCTTACTGGAAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGACGTCAGATCATCAATGCAATCTATGAACCTACAGAAGAGGAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGACGTCAGATCATCAATGCAATCTATGAACCTACAGAAGAGGAATGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATATAAATCAGACTCTGAGGACTGTGATGATGAGGAAATGTGTCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATATAAATCAGACTCTGAGGACTGTGATGATGAGGAAATGTGTCATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATGTATGGTAATGAGGAGGGTATGGTACATGAATATGTGGATGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGATGTATGGTAATGAGGAGGGTATGGTACATGAATATGTGGATGAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATGGTTATGAGGACTATTATTATGATTATGCTGTGGAAGAGGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATGGTTATGAGGACTATTATTATGATTATGCTGTGGAAGAGGAGGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGGAGGAGGAGGACGACATTGAGGCTACTGGAGAAGAGAATAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGGAGGAGGAGGACGACATTGAGGCTACTGGAGAAGAGAATAAAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAGGATCCTAAGGGAATTCCTGATTTTTGGCTAACTGTTTTAAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAGGATCCTAAGGGAATTCCTGATTTTTGGCTAACTGTTTTAAAAAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTGATACACTCACTCCTTTGATTAAGAAATATGATGAGCCTATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTGATACACTCACTCCTTTGATTAAGAAATATGATGAGCCTATTCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTCCTGACAGATATTAAAGTTAAGCTTTCAGATCCTGGCGAGCCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTCCTGACAGATATTAAAGTTAAGCTTTCAGATCCTGGCGAGCCCCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTTTCACACTAGAATTTCACTTCAAACCCAATGAATATTTCAAAAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTTTCACACTAGAATTTCACTTCAAACCCAATGAATATTTCAAAAATGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGTTGACAAAGACCTATGTGCTGAAGTCAAAGCTAGCATATTATGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGTTGACAAAGACCTATGTGCTGAAGTCAAAGCTAGCATATTATGATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCATCCCTATAGGGGAACTGCGATTGAGTATTCCACAGGCTGTGAGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCATCCCTATAGGGGAACTGCGATTGAGTATTCCACAGGCTGTGAGATAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATTGGAATGAAGGAAAGAATGTCACTTTGAAAACCATCAAGAAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATTGGAATGAAGGAAAGAATGTCACTTTGAAAACCATCAAGAAGAAACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AAACATCGGATCTGGGGAACAATCCGAACTGTAACTGAAGATTTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAACATCGGATCTGGGGAACAATCCGAACTGTAACTGAAGATTTTCCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGATTCATTTTTCAATTTTTTCTCTCCTCATGGAATCACCTCAAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGATTCATTTTTCAATTTTTTCTCTCCTCATGGAATCACCTCAAATGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGATGGAAATGATGATTTTTTACTTGGTCACAATTTACGTACTTACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGGATGGAAATGATGATTTTTTACTTGGTCACAATTTACGTACTTACATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATTCCAAGATCAGTATTATTTTTCTCAGGTGATGCACTGGAATCTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATTCCAAGATCAGTATTATTTTTCTCAGGTGATGCACTGGAATCTCAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGAGGGGGTAGTTAGAGAAGTTAATGATGCAATTTATGACAAAATTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGAGGGGGTAGTTAGAGAAGTTAATGATGCAATTTATGACAAAATTATTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGATAATTGGATGGCTGCAATTGAGGAAGTTAAAGCTTGTTGCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGATAATTGGATGGCTGCAATTGAGGAAGTTAAAGCTTGTTGCAAAAAC

   1350     .    :    .    :    .    :
   1351 CTTGAGGCATTAGTAGAAGACATTGATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTTGAGGCATTAGTAGAAGACATTGATCGT